More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0922 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0922  ABC transporter related  100 
 
 
240 aa  465  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4062  ABC transporter related  45.87 
 
 
252 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5462  ABC transporter-like  45.57 
 
 
245 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0295  ABC transporter  45.99 
 
 
244 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0694  ABC transporter related  47.83 
 
 
245 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1117  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  42.56 
 
 
255 aa  204  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000186599  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0303  ABC transporter related  45.57 
 
 
243 aa  202  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  45.18 
 
 
244 aa  201  6e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  47.19 
 
 
252 aa  201  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5248  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.99 
 
 
244 aa  201  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6999  ABC transporter related  46.32 
 
 
249 aa  201  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0192486 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0208  ABC transporter-related protein  44.86 
 
 
245 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2763  ATPase  46.33 
 
 
243 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0929  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein PEB1  43.72 
 
 
242 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.285427  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0227  ABC transporter related  45.12 
 
 
248 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  48.37 
 
 
247 aa  200  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0892  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein PEB1  43.72 
 
 
242 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.495443  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1180  ABC transporter related  44.75 
 
 
360 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4751  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.31 
 
 
269 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00318924  hitchhiker  0.00202738 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1000  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein PEB1  43.72 
 
 
242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1058  ABC transporter related  46.05 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253123  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1225  ABC transporter related  47.44 
 
 
244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.128427 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1495  ABC transporter related  46.52 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6334  ABC transporter related  46.52 
 
 
249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.443551  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0326  ABC transporter related  45.89 
 
 
242 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2788  ABC transporter related  48.28 
 
 
243 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2806  ABC transporter related protein  48.71 
 
 
247 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.237976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1919  ABC transporter related  45.57 
 
 
244 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.831773  normal  0.256849 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1920  ABC transporter related  46.75 
 
 
249 aa  198  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0015  ABC transporter related  44.44 
 
 
245 aa  198  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.619929  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  44.16 
 
 
259 aa  198  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0713  ABC transporter related  44.59 
 
 
363 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2857  ABC transporter related  45.45 
 
 
244 aa  197  9e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.969115 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2217  ABC transporter related  49.26 
 
 
243 aa  197  9e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.565902  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2021  ABC transporter related  44.59 
 
 
363 aa  197  9e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2106  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  44.03 
 
 
245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  43.09 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2588  ABC transporter-like protein  48.28 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000779589  normal  0.524801 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5173  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  48.42 
 
 
261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.569594  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0020  ABC transporter related  44.03 
 
 
245 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  43.81 
 
 
242 aa  196  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3475  ABC transporter related  46.33 
 
 
246 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  47.64 
 
 
245 aa  196  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5082  ABC transporter related  45.58 
 
 
244 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.27733  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0446  ABC transporter related  44.4 
 
 
242 aa  196  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0299  ABC transporter-related protein  47.37 
 
 
252 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  44.75 
 
 
239 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2453  ABC transporter related protein  42.99 
 
 
242 aa  195  6e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0726  ABC transporter related  41.67 
 
 
247 aa  194  7e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000170097  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  44.39 
 
 
240 aa  195  7e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3670  ABC transporter related  47.85 
 
 
255 aa  194  9e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.740211  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  44.39 
 
 
242 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  43.17 
 
 
243 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3275  ABC transporter related  43.6 
 
 
259 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0729  ABC transporter related  45.53 
 
 
240 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155428  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1343  ABC transporter related  46.32 
 
 
246 aa  194  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.995415  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0344  ABC transporter related  45.02 
 
 
242 aa  194  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0985  ABC transporter related protein  43.6 
 
 
259 aa  193  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2740  ABC transporter related  49.09 
 
 
248 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5268  ABC transporter related  44.64 
 
 
241 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369683  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0289  general L-amino acid transport ATP-binding protein AapP  41.23 
 
 
245 aa  193  2e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  46.12 
 
 
246 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1504  ABC transporter related  44.58 
 
 
252 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2389  ABC transporter related  42.04 
 
 
266 aa  192  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2490  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.86 
 
 
240 aa  192  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5544  ABC transporter related  44.21 
 
 
241 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.635049 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3208  ABC transporter-related protein  44.4 
 
 
261 aa  192  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  47.62 
 
 
244 aa  192  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1569  ABC transporter related  48.15 
 
 
261 aa  192  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0583  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.05 
 
 
240 aa  192  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0663  SMR family multidrug efflux pump  41.67 
 
 
245 aa  192  5e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1594  ABC transporter related  47.95 
 
 
259 aa  191  6e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3151  ABC transporter related  44.24 
 
 
242 aa  191  7e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0859723 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0166  ATPase  44.95 
 
 
244 aa  191  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2369  ABC transporter related  43.42 
 
 
246 aa  191  9e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3555  ABC transporter-like protein  49.77 
 
 
247 aa  190  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.836989  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1042  ABC transporter related  45.37 
 
 
241 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0556178  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  44.69 
 
 
241 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  42.59 
 
 
255 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0358  ABC transporter related  45.65 
 
 
252 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  42.92 
 
 
248 aa  190  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  42.92 
 
 
248 aa  191  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  42.06 
 
 
243 aa  190  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2796  ABC transporter related  42.04 
 
 
266 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1400  ABC transporter related protein  47.39 
 
 
257 aa  190  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2393  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  44.39 
 
 
240 aa  190  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0099  ABC transporter related  42.29 
 
 
247 aa  190  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000131657  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0569  glutamine transport protein glnQ  41.05 
 
 
240 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.909339  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.53 
 
 
260 aa  190  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1128  ABC transporter related protein  49.55 
 
 
266 aa  189  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.419113  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3012  ABC transporter related  44.78 
 
 
244 aa  189  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197193  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2630  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.35 
 
 
278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00585721  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0861  ATPase  43.86 
 
 
363 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.528651 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1038  ATPase  43.86 
 
 
363 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.396319 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2323  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter ATP-binding protein  43.65 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483469  normal  0.984523 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1247  ABC transporter related protein  46.26 
 
 
249 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0795163  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0439  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  42.34 
 
 
250 aa  189  2.9999999999999997e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0501472  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  45.33 
 
 
253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9351  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.7 
 
 
247 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.478822 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0916  ABC transporter related  43.78 
 
 
242 aa  189  4e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>