More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2560 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2560  hypothetical protein  100 
 
 
237 aa  487  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1990  hypothetical protein  84.32 
 
 
239 aa  423  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0228  protein of unknown function DUF28  67.93 
 
 
255 aa  333  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12523  hypothetical protein  71.43 
 
 
248 aa  328  6e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0097  hypothetical protein  59.24 
 
 
242 aa  296  2e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0278859 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2653  protein of unknown function DUF28  62.05 
 
 
226 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3642  protein of unknown function DUF28  62.92 
 
 
242 aa  275  4e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1650  hypothetical protein  52.97 
 
 
236 aa  259  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3516  hypothetical protein  55.08 
 
 
238 aa  250  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1612  hypothetical protein  49.37 
 
 
240 aa  238  9e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00192145  normal  0.534654 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0752  protein of unknown function DUF28  50.21 
 
 
236 aa  231  8.000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2184  hypothetical protein  50.63 
 
 
240 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1389  hypothetical protein  52.79 
 
 
236 aa  227  1e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.407687  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1694  hypothetical protein  50.21 
 
 
240 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534386  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1765  hypothetical protein  50.21 
 
 
240 aa  226  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.874851  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0424  hypothetical protein  46.75 
 
 
235 aa  203  1e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1426  hypothetical protein  46.31 
 
 
244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1037  hypothetical protein  46.32 
 
 
235 aa  194  1e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000707905  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0624  hypothetical protein  45.41 
 
 
244 aa  191  8e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1081  hypothetical protein  45.89 
 
 
235 aa  190  2e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.478174  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1514  hypothetical protein  44.16 
 
 
235 aa  189  5e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0105441  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1187  hypothetical protein  46.32 
 
 
235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1306  hypothetical protein  46.32 
 
 
235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.793334  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0557  hypothetical protein  45.89 
 
 
235 aa  180  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0768  hypothetical protein  41.23 
 
 
240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0981887  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  42.11 
 
 
242 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  43.44 
 
 
248 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  41.63 
 
 
248 aa  174  8e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  41.63 
 
 
248 aa  174  8e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  40.72 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  40.72 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  41.47 
 
 
248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2399  protein of unknown function DUF28  39.32 
 
 
248 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42546  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  41.15 
 
 
246 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  39.3 
 
 
246 aa  170  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  41.59 
 
 
248 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  42.25 
 
 
247 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  41.15 
 
 
248 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  38.22 
 
 
243 aa  168  6e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  41.15 
 
 
248 aa  167  9e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3509  hypothetical protein  40.72 
 
 
248 aa  167  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.208978 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  40.27 
 
 
248 aa  167  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0163  hypothetical protein  40.27 
 
 
248 aa  167  1e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  40.72 
 
 
248 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  40.72 
 
 
248 aa  167  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  40.85 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  39.3 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  40.17 
 
 
246 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  42.52 
 
 
247 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  40.61 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  40.18 
 
 
248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  39.37 
 
 
248 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3030  hypothetical protein  38.33 
 
 
252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.248633  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  41.31 
 
 
247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2729  hypothetical protein  40.62 
 
 
248 aa  162  6e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31246  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2210  hypothetical protein  41.33 
 
 
245 aa  161  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1922  hypothetical protein  41.33 
 
 
245 aa  161  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.541871  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3525  hypothetical protein  40.18 
 
 
248 aa  160  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2507  hypothetical protein  38.36 
 
 
242 aa  160  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.153457  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4171  hypothetical protein  39.37 
 
 
248 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265987  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  39.83 
 
 
251 aa  159  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  41.98 
 
 
247 aa  158  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  40.38 
 
 
247 aa  157  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  40.38 
 
 
247 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  37.61 
 
 
246 aa  156  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2305  hypothetical protein  39.19 
 
 
248 aa  156  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119494 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0465  hypothetical protein  36.55 
 
 
239 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000140686  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2114  hypothetical protein  37.33 
 
 
248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.308852  normal  0.355584 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3380  hypothetical protein  38.2 
 
 
255 aa  154  8e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2117  protein of unknown function DUF28  35.11 
 
 
247 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.892674  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  37.33 
 
 
253 aa  153  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  37.17 
 
 
247 aa  153  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  38.84 
 
 
249 aa  153  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  37.33 
 
 
253 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  37 
 
 
249 aa  152  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  37.78 
 
 
250 aa  152  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4362  hypothetical protein  38.74 
 
 
255 aa  152  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.144565 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03900  conserved hypothetical protein TIGR01033  34.3 
 
 
265 aa  152  5e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.144849 
 
 
-
 
NC_002936  DET0444  hypothetical protein  39.47 
 
 
251 aa  151  7e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0718  hypothetical protein  37.67 
 
 
255 aa  151  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  37.32 
 
 
247 aa  150  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  40.71 
 
 
248 aa  151  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  37.33 
 
 
250 aa  150  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1210  protein of unknown function DUF28  35.27 
 
 
243 aa  150  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  38.99 
 
 
250 aa  150  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0510  hypothetical protein  33.19 
 
 
239 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.887528  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  37.17 
 
 
251 aa  150  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0449  hypothetical protein  33.19 
 
 
239 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  36.28 
 
 
248 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0541  hypothetical protein  33.19 
 
 
239 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000461831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0541  hypothetical protein  33.19 
 
 
239 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5905599999999994e-39 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  37.66 
 
 
252 aa  150  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_386  hypothetical protein  38.42 
 
 
251 aa  149  3e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0595  hypothetical protein  33.19 
 
 
239 aa  149  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0672572  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0453  hypothetical protein  33.19 
 
 
239 aa  149  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190075  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0577  hypothetical protein  33.19 
 
 
239 aa  149  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00950255  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  38.39 
 
 
246 aa  149  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  38.39 
 
 
246 aa  149  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  38.39 
 
 
246 aa  149  4e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0456  hypothetical protein  33.19 
 
 
242 aa  149  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>