More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3631 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  507  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  87.9 
 
 		 248 aa  454  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3509  hypothetical protein  85.08 
 
 		 248 aa  448  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.208978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  85.08 
 
 		 248 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  80.65 
 
 		 248 aa  421  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  79.44 
 
 		 249 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  80.24 
 
 		 248 aa  420  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  80.24 
 
 		 248 aa  420  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0163  hypothetical protein  77.42 
 
 		 248 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2305  hypothetical protein  66.53 
 
 		 248 aa  355  5e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119494 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  68.7 
 
 		 246 aa  352  4e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  68.55 
 
 		 248 aa  351  8e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  67.74 
 
 		 248 aa  347  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  67.74 
 
 		 248 aa  346  2e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  65.45 
 
 		 248 aa  343  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  67.48 
 
 		 246 aa  343  2e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  66.4 
 
 		 248 aa  341  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2729  hypothetical protein  65.45 
 
 		 248 aa  341  8e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3525  hypothetical protein  65.04 
 
 		 248 aa  339  2e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4171  hypothetical protein  65.59 
 
 		 248 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265987  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6579  hypothetical protein  65.85 
 
 		 248 aa  333  1e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2762  hypothetical protein  68.29 
 
 		 246 aa  333  1e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0792169 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3553  hypothetical protein  65.73 
 
 		 248 aa  332  3e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2114  hypothetical protein  61.29 
 
 		 248 aa  331  6e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.308852  normal  0.355584 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3380  hypothetical protein  62.99 
 
 		 255 aa  329  3e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3062  hypothetical protein  68.15 
 
 		 249 aa  329  3e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0345  hypothetical protein  65.04 
 
 		 248 aa  328  5.0000000000000004e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7401  hypothetical protein  65.04 
 
 		 248 aa  327  8e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372247  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0337  hypothetical protein  65.99 
 
 		 248 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1287  hypothetical protein  66.4 
 
 		 248 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6910  hypothetical protein  64.23 
 
 		 248 aa  325  6e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311344 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0419  hypothetical protein  64.03 
 
 		 254 aa  324  8.000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.26819  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0946  hypothetical protein  64.52 
 
 		 248 aa  323  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.596094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0982  hypothetical protein  64.52 
 
 		 264 aa  323  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.501161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0922  hypothetical protein  65.73 
 
 		 248 aa  314  7e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1219  hypothetical protein  59.84 
 
 		 249 aa  307  1.0000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.854834 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2907  hypothetical protein  60.64 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2433  hypothetical protein  59.52 
 
 		 253 aa  304  9.000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2142  hypothetical protein  63.01 
 
 		 247 aa  303  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1086  hypothetical protein  62.25 
 
 		 249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0780  hypothetical protein  58.8 
 
 		 251 aa  291  9e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0981369  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  54.03 
 
 		 248 aa  260  1e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  54.44 
 
 		 248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  50.2 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2554  protein of unknown function DUF28  52.02 
 
 		 248 aa  248  8e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113083  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  51.01 
 
 		 247 aa  247  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  48.99 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  48.99 
 
 		 247 aa  246  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0484  hypothetical protein  53.33 
 
 		 246 aa  245  4.9999999999999997e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  51.01 
 
 		 247 aa  245  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  48 
 
 		 250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  50.2 
 
 		 247 aa  241  7e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  49.39 
 
 		 246 aa  240  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  49.39 
 
 		 247 aa  238  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  49.19 
 
 		 248 aa  238  8e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  47.79 
 
 		 250 aa  237  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  47.79 
 
 		 250 aa  237  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  49.8 
 
 		 249 aa  236  3e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  48.58 
 
 		 247 aa  235  6e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  49.19 
 
 		 248 aa  234  7e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  49.19 
 
 		 247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  50.2 
 
 		 247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  49.79 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  49.19 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  50 
 
 		 250 aa  232  4.0000000000000004e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  48.99 
 
 		 250 aa  231  5e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  49.19 
 
 		 248 aa  232  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  53.5 
 
 		 246 aa  232  5e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  49.4 
 
 		 249 aa  231  6e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  47.79 
 
 		 251 aa  231  9e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  48.61 
 
 		 253 aa  230  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0704  hypothetical protein  48.98 
 
 		 248 aa  229  2e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  49.19 
 
 		 248 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  49.19 
 
 		 248 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  48.39 
 
 		 248 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3853  protein of unknown function DUF28  49.59 
 
 		 241 aa  229  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0807  hypothetical protein  49.2 
 
 		 251 aa  229  4e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  47.98 
 
 		 248 aa  228  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1228  hypothetical protein  50 
 
 		 252 aa  228  7e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  47.98 
 
 		 248 aa  228  8e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  48.39 
 
 		 248 aa  228  9e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0351  hypothetical protein  47.76 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  48.79 
 
 		 248 aa  228  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  48.79 
 
 		 248 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1953  hypothetical protein  49.79 
 
 		 241 aa  227  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  48.79 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  50.83 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  46.18 
 
 		 249 aa  226  3e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1214  hypothetical protein  49.19 
 
 		 248 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.480804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1243  hypothetical protein  49.19 
 
 		 248 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4204  hypothetical protein  49.19 
 
 		 248 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  47.58 
 
 		 248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  49.6 
 
 		 248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  46.91 
 
 		 246 aa  225  6e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  48.73 
 
 		 243 aa  225  6e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  48.02 
 
 		 253 aa  225  7e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  47.92 
 
 		 239 aa  224  7e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  48.79 
 
 		 247 aa  224  8e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  47.97 
 
 		 252 aa  224  9e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  47.18 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>