More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2641 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  507  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  90.73 
 
 
248 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3509  hypothetical protein  89.11 
 
 
248 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.208978 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  87.9 
 
 
248 aa  454  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  82.26 
 
 
249 aa  429  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  81.85 
 
 
248 aa  424  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  81.05 
 
 
248 aa  421  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  81.05 
 
 
248 aa  421  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0163  hypothetical protein  78.23 
 
 
248 aa  414  9.999999999999999e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  71.77 
 
 
248 aa  360  1e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  71.77 
 
 
248 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  70.97 
 
 
248 aa  358  4e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  67.89 
 
 
246 aa  349  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  68.29 
 
 
246 aa  348  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  67.21 
 
 
248 aa  348  4e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2729  hypothetical protein  67.07 
 
 
248 aa  344  7e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31246  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7401  hypothetical protein  69.11 
 
 
248 aa  344  7e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372247  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  66.26 
 
 
248 aa  340  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2305  hypothetical protein  64.92 
 
 
248 aa  340  1e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119494 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3525  hypothetical protein  66.26 
 
 
248 aa  340  2e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4171  hypothetical protein  65.59 
 
 
248 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265987  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1287  hypothetical protein  68.02 
 
 
248 aa  335  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3380  hypothetical protein  64.17 
 
 
255 aa  335  2.9999999999999997e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6579  hypothetical protein  66.67 
 
 
248 aa  335  5e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0982  hypothetical protein  66.94 
 
 
264 aa  332  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.501161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0946  hypothetical protein  66.94 
 
 
248 aa  333  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.596094 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3553  hypothetical protein  66.53 
 
 
248 aa  331  8e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6910  hypothetical protein  65.85 
 
 
248 aa  328  7e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.311344 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2114  hypothetical protein  61.29 
 
 
248 aa  327  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.308852  normal  0.355584 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2762  hypothetical protein  67.07 
 
 
246 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0792169 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3062  hypothetical protein  68.15 
 
 
249 aa  325  4.0000000000000003e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0922  hypothetical protein  66.53 
 
 
248 aa  318  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0337  hypothetical protein  64.37 
 
 
248 aa  317  7.999999999999999e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171809  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0345  hypothetical protein  63.01 
 
 
248 aa  317  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0419  hypothetical protein  61.66 
 
 
254 aa  313  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.26819  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2907  hypothetical protein  62.65 
 
 
253 aa  312  2.9999999999999996e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1219  hypothetical protein  60.64 
 
 
249 aa  308  5.9999999999999995e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.854834 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1086  hypothetical protein  62.25 
 
 
249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2433  hypothetical protein  57.94 
 
 
253 aa  302  4.0000000000000003e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2142  hypothetical protein  63.01 
 
 
247 aa  297  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68172  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0780  hypothetical protein  60.4 
 
 
251 aa  293  2e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0981369  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  51.42 
 
 
247 aa  255  4e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  51.42 
 
 
247 aa  254  7e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  52.63 
 
 
247 aa  252  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  52.02 
 
 
248 aa  250  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0484  hypothetical protein  54.17 
 
 
246 aa  250  2e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2554  protein of unknown function DUF28  53.63 
 
 
248 aa  244  9.999999999999999e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113083  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  50.61 
 
 
247 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  52.61 
 
 
249 aa  243  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  50.2 
 
 
247 aa  243  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  52.42 
 
 
248 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  50.61 
 
 
247 aa  239  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  51.01 
 
 
247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  51.81 
 
 
249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  52.42 
 
 
248 aa  238  8e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  51.21 
 
 
248 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  48.4 
 
 
250 aa  237  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  46.8 
 
 
250 aa  236  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  50.62 
 
 
247 aa  234  7e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  51.21 
 
 
248 aa  234  7e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  50 
 
 
248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  49.6 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  49.6 
 
 
247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  52.03 
 
 
250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  49.6 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  50.81 
 
 
248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  51.27 
 
 
243 aa  231  6e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  48.58 
 
 
246 aa  229  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  53.09 
 
 
246 aa  229  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  49.19 
 
 
248 aa  229  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  50.4 
 
 
248 aa  229  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0351  hypothetical protein  48.16 
 
 
248 aa  229  4e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0704  hypothetical protein  49.39 
 
 
248 aa  228  5e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  51.2 
 
 
247 aa  228  6e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  48.59 
 
 
251 aa  228  7e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1214  hypothetical protein  51.21 
 
 
248 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.480804  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4204  hypothetical protein  51.21 
 
 
248 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300828  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  50.2 
 
 
248 aa  227  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  51.24 
 
 
246 aa  228  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1243  hypothetical protein  51.21 
 
 
248 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362221  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  51.03 
 
 
245 aa  226  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  53.6 
 
 
247 aa  226  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  47.81 
 
 
253 aa  225  6e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  46.99 
 
 
250 aa  225  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  46.99 
 
 
250 aa  225  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  47.58 
 
 
246 aa  224  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  47.98 
 
 
246 aa  224  8e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  47.98 
 
 
246 aa  224  8e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  47.98 
 
 
246 aa  224  8e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  47.98 
 
 
246 aa  224  8e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0807  hypothetical protein  47.6 
 
 
251 aa  224  8e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  47.98 
 
 
246 aa  224  8e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  47.98 
 
 
246 aa  224  8e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  47.58 
 
 
246 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  47.58 
 
 
246 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  47.58 
 
 
246 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  47.98 
 
 
247 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  47.58 
 
 
246 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  47.58 
 
 
246 aa  223  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  47.58 
 
 
246 aa  223  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>