More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3062 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3062  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  505  9.999999999999999e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  77.64 
 
 		 248 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4171  hypothetical protein  77.24 
 
 		 248 aa  401  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265987  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2305  hypothetical protein  76.21 
 
 		 248 aa  402  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  76.83 
 
 		 248 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3525  hypothetical protein  74.39 
 
 		 248 aa  393  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2729  hypothetical protein  73.17 
 
 		 248 aa  387  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1287  hypothetical protein  78.05 
 
 		 248 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0345  hypothetical protein  78.05 
 
 		 248 aa  378  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6910  hypothetical protein  76.42 
 
 		 248 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311344 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3553  hypothetical protein  77.42 
 
 		 248 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6579  hypothetical protein  76.92 
 
 		 248 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7401  hypothetical protein  76.52 
 
 		 248 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372247  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0946  hypothetical protein  75.4 
 
 		 248 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.596094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0982  hypothetical protein  75.4 
 
 		 264 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.501161 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  68.15 
 
 		 248 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2114  hypothetical protein  68.95 
 
 		 248 aa  365  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.308852  normal  0.355584 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  69.35 
 
 		 248 aa  361  6e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  68.15 
 
 		 248 aa  359  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3509  hypothetical protein  68.95 
 
 		 248 aa  358  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.208978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0922  hypothetical protein  76.21 
 
 		 248 aa  357  9.999999999999999e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  68.15 
 
 		 248 aa  354  7.999999999999999e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  68.15 
 
 		 248 aa  354  7.999999999999999e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  68.55 
 
 		 249 aa  352  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  67.74 
 
 		 248 aa  350  8e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0163  hypothetical protein  64.11 
 
 		 248 aa  338  5e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  62.5 
 
 		 248 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  62.1 
 
 		 248 aa  323  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  62.1 
 
 		 248 aa  323  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  62.2 
 
 		 246 aa  319  1.9999999999999998e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  60.98 
 
 		 246 aa  318  3.9999999999999996e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2762  hypothetical protein  64.23 
 
 		 246 aa  315  3e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0792169 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0337  hypothetical protein  61.94 
 
 		 248 aa  311  7.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3380  hypothetical protein  58.27 
 
 		 255 aa  306  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2907  hypothetical protein  62.25 
 
 		 253 aa  305  3e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1219  hypothetical protein  59.84 
 
 		 249 aa  304  8.000000000000001e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.854834 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2142  hypothetical protein  60.98 
 
 		 247 aa  297  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0419  hypothetical protein  56.52 
 
 		 254 aa  294  1e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.26819  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1086  hypothetical protein  61.04 
 
 		 249 aa  289  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2433  hypothetical protein  54.94 
 
 		 253 aa  287  9e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0780  hypothetical protein  58 
 
 		 251 aa  268  5e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0981369  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_002978  WD0484  hypothetical protein  55.28 
 
 		 246 aa  268  8e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  54.03 
 
 		 248 aa  263  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  51.2 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  52.63 
 
 		 247 aa  255  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  53.23 
 
 		 247 aa  251  5.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  52.23 
 
 		 246 aa  251  7e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  51.42 
 
 		 247 aa  250  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  48.99 
 
 		 247 aa  249  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  51.44 
 
 		 247 aa  249  3e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  48.99 
 
 		 247 aa  248  5e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  55.47 
 
 		 247 aa  247  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  50.4 
 
 		 249 aa  246  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  52.08 
 
 		 247 aa  246  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  47.6 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  51.82 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  51.67 
 
 		 247 aa  242  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  50.21 
 
 		 246 aa  242  5e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  49.8 
 
 		 249 aa  241  9e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2554  protein of unknown function DUF28  51.81 
 
 		 248 aa  240  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113083  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  50.61 
 
 		 250 aa  240  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  57.89 
 
 		 247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1106  hypothetical protein  51.18 
 
 		 252 aa  237  1e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  51.24 
 
 		 253 aa  236  2e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  50.81 
 
 		 248 aa  236  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2325  hypothetical protein  52.42 
 
 		 248 aa  235  6e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.667141  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2775  hypothetical protein  48.81 
 
 		 255 aa  235  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  50.41 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  50.4 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  47.79 
 
 		 251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  49.19 
 
 		 248 aa  232  5e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  47.79 
 
 		 250 aa  232  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  47.79 
 
 		 250 aa  232  5e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0704  hypothetical protein  46.96 
 
 		 248 aa  231  7.000000000000001e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  49.19 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  48.79 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0351  hypothetical protein  46.77 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  48.79 
 
 		 248 aa  228  6e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  51.28 
 
 		 243 aa  228  8e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  48.95 
 
 		 242 aa  226  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1346  hypothetical protein  46.77 
 
 		 248 aa  227  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404537  normal  0.548466 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  50.41 
 
 		 246 aa  226  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2054  hypothetical protein  48.61 
 
 		 255 aa  225  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  47.98 
 
 		 249 aa  225  6e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2028  hypothetical protein  48.61 
 
 		 255 aa  225  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  48.19 
 
 		 248 aa  225  6e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1615  hypothetical protein  48.59 
 
 		 249 aa  225  6e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  47.41 
 
 		 251 aa  224  7e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  48.76 
 
 		 250 aa  224  8e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0816  hypothetical protein  49.37 
 
 		 243 aa  224  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.177048  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  49.19 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  51.44 
 
 		 245 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1249  hypothetical protein  48.39 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1249  hypothetical protein  48.39 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  49.21 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  47.98 
 
 		 246 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  49.17 
 
 		 246 aa  223  3e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  47.98 
 
 		 246 aa  222  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  47.98 
 
 		 246 aa  222  4e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  48.39 
 
 		 248 aa  222  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>