More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2305 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2305  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  500  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119494 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0345  hypothetical protein  84.96 
 
 		 248 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  74.8 
 
 		 248 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4171  hypothetical protein  76.02 
 
 		 248 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265987  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  75.2 
 
 		 248 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3525  hypothetical protein  73.98 
 
 		 248 aa  382  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2729  hypothetical protein  74.39 
 
 		 248 aa  377  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3062  hypothetical protein  76.21 
 
 		 249 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6910  hypothetical protein  73.17 
 
 		 248 aa  362  4e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311344 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1287  hypothetical protein  73.98 
 
 		 248 aa  361  6e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  66.53 
 
 		 248 aa  355  5e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7401  hypothetical protein  71.14 
 
 		 248 aa  351  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372247  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3553  hypothetical protein  69.76 
 
 		 248 aa  350  8.999999999999999e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2114  hypothetical protein  66.94 
 
 		 248 aa  349  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.308852  normal  0.355584 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6579  hypothetical protein  69.23 
 
 		 248 aa  348  5e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  65.32 
 
 		 248 aa  345  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3509  hypothetical protein  65.32 
 
 		 248 aa  344  6e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.208978 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0946  hypothetical protein  69.35 
 
 		 248 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.596094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0982  hypothetical protein  69.35 
 
 		 264 aa  342  5e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.501161 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  64.52 
 
 		 249 aa  340  9e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  64.92 
 
 		 248 aa  340  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  65.32 
 
 		 248 aa  339  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  65.32 
 
 		 248 aa  339  2e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  64.92 
 
 		 248 aa  338  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0163  hypothetical protein  64.92 
 
 		 248 aa  331  8e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0922  hypothetical protein  68.55 
 
 		 248 aa  330  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  60.16 
 
 		 246 aa  305  6e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1219  hypothetical protein  59.44 
 
 		 249 aa  301  5.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.854834 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  58.06 
 
 		 248 aa  300  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  58.06 
 
 		 248 aa  300  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  57.66 
 
 		 248 aa  299  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  58.54 
 
 		 246 aa  298  4e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0337  hypothetical protein  58.7 
 
 		 248 aa  295  7e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0419  hypothetical protein  58.1 
 
 		 254 aa  294  8e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.26819  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2907  hypothetical protein  60.64 
 
 		 253 aa  292  4e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2762  hypothetical protein  58.13 
 
 		 246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0792169 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3380  hypothetical protein  54.55 
 
 		 255 aa  283  2.0000000000000002e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2142  hypothetical protein  58.94 
 
 		 247 aa  281  5.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1086  hypothetical protein  57.83 
 
 		 249 aa  280  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2433  hypothetical protein  53.52 
 
 		 253 aa  278  5e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0780  hypothetical protein  55.2 
 
 		 251 aa  269  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0981369  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  53.23 
 
 		 248 aa  255  6e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  53.85 
 
 		 247 aa  251  6e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  54.84 
 
 		 247 aa  249  2e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  48.8 
 
 		 250 aa  248  8e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  51.82 
 
 		 247 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  48.99 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  48.99 
 
 		 247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0484  hypothetical protein  51.41 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  50.4 
 
 		 251 aa  237  2e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  48.99 
 
 		 246 aa  236  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  51.45 
 
 		 247 aa  235  4e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  50 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  50.2 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  49.39 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  50.2 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  51.01 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  47.56 
 
 		 250 aa  230  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  49.39 
 
 		 248 aa  229  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  48.99 
 
 		 249 aa  228  5e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  48.79 
 
 		 248 aa  228  7e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  48.79 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0704  hypothetical protein  46.94 
 
 		 248 aa  225  4e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  47.58 
 
 		 249 aa  225  4e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  49.6 
 
 		 248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  49.6 
 
 		 248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  51.42 
 
 		 247 aa  225  6e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  48.79 
 
 		 248 aa  224  7e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2554  protein of unknown function DUF28  51.61 
 
 		 248 aa  224  8e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113083  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0351  hypothetical protein  46.53 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2325  hypothetical protein  48.79 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.667141  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  49.19 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  49.01 
 
 		 253 aa  223  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  51.64 
 
 		 245 aa  221  8e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  48.8 
 
 		 249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  49.19 
 
 		 250 aa  219  3e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  48.62 
 
 		 253 aa  219  3e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  44.4 
 
 		 250 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1650  protein of unknown function DUF28  44.9 
 
 		 247 aa  218  6e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0422  hypothetical protein  48.57 
 
 		 244 aa  218  8.999999999999998e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0951689  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1752  hypothetical protein  48.57 
 
 		 244 aa  218  8.999999999999998e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000585673  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  49.59 
 
 		 243 aa  217  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1346  hypothetical protein  45.97 
 
 		 248 aa  217  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404537  normal  0.548466 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  52.02 
 
 		 247 aa  216  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  46.18 
 
 		 250 aa  217  2e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2775  hypothetical protein  47.04 
 
 		 255 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1845  hypothetical protein  49.2 
 
 		 249 aa  216  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00676371  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  49.4 
 
 		 249 aa  217  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1106  hypothetical protein  48.24 
 
 		 252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  47.18 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  47.18 
 
 		 246 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1471  hypothetical protein  45.31 
 
 		 248 aa  216  4e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  47.18 
 
 		 246 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  47.18 
 
 		 246 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  47.18 
 
 		 246 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  46.99 
 
 		 248 aa  215  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  47.39 
 
 		 248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  47.43 
 
 		 252 aa  214  7e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  47.39 
 
 		 247 aa  214  7e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  48.59 
 
 		 248 aa  214  8e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>