More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0982 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0982  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  535  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.501161 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0946  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  502  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.596094 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0922  hypothetical protein  96.37 
 
 		 248 aa  442  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3553  hypothetical protein  90.32 
 
 		 248 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7401  hypothetical protein  85.37 
 
 		 248 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372247  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6579  hypothetical protein  84.55 
 
 		 248 aa  410  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  74.8 
 
 		 248 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  72.87 
 
 		 248 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4171  hypothetical protein  73.58 
 
 		 248 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265987  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2729  hypothetical protein  71.66 
 
 		 248 aa  375  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3525  hypothetical protein  69.64 
 
 		 248 aa  368  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2305  hypothetical protein  69.35 
 
 		 248 aa  362  5.0000000000000005e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6910  hypothetical protein  72.06 
 
 		 248 aa  360  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311344 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1287  hypothetical protein  73.58 
 
 		 248 aa  359  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0345  hypothetical protein  72.06 
 
 		 248 aa  353  1e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3062  hypothetical protein  75.4 
 
 		 249 aa  349  2e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  66.94 
 
 		 248 aa  348  4e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  66.13 
 
 		 248 aa  345  4e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  66.13 
 
 		 248 aa  345  4e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  66.13 
 
 		 248 aa  343  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  66.13 
 
 		 248 aa  342  5e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  64.52 
 
 		 248 aa  339  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3509  hypothetical protein  64.52 
 
 		 248 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.208978 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2114  hypothetical protein  64.11 
 
 		 248 aa  337  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.308852  normal  0.355584 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  64.11 
 
 		 249 aa  333  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0163  hypothetical protein  62.5 
 
 		 248 aa  329  3e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  60.08 
 
 		 248 aa  307  9e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  60.08 
 
 		 248 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  59.27 
 
 		 248 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  58.94 
 
 		 246 aa  301  6.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  57.72 
 
 		 246 aa  298  8e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1219  hypothetical protein  58.63 
 
 		 249 aa  296  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.854834 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0337  hypothetical protein  57.66 
 
 		 248 aa  293  3e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2907  hypothetical protein  59.13 
 
 		 253 aa  288  9e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2762  hypothetical protein  57.32 
 
 		 246 aa  287  1e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0792169 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3380  hypothetical protein  54.55 
 
 		 255 aa  285  7e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0419  hypothetical protein  54.72 
 
 		 254 aa  279  4e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.26819  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1086  hypothetical protein  58.23 
 
 		 249 aa  275  7e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2142  hypothetical protein  56.28 
 
 		 247 aa  274  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2433  hypothetical protein  54.88 
 
 		 253 aa  270  1e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  51.42 
 
 		 247 aa  256  4e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  51.82 
 
 		 247 aa  255  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0780  hypothetical protein  53.78 
 
 		 251 aa  251  7e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0981369  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  51.82 
 
 		 247 aa  249  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  51.41 
 
 		 248 aa  249  5e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0484  hypothetical protein  52.85 
 
 		 246 aa  248  7e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  51.41 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  52.02 
 
 		 247 aa  246  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  49.8 
 
 		 247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  46.4 
 
 		 250 aa  238  5.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  49.8 
 
 		 247 aa  238  8e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  49.39 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  49.8 
 
 		 246 aa  231  7.000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  50.2 
 
 		 250 aa  231  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  47.18 
 
 		 249 aa  230  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  49.4 
 
 		 250 aa  229  4e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  48.59 
 
 		 248 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0704  hypothetical protein  47.77 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  52.42 
 
 		 247 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  47.37 
 
 		 249 aa  227  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  45.6 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  50.21 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  46.18 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  46.59 
 
 		 248 aa  222  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  46.09 
 
 		 247 aa  221  8e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0351  hypothetical protein  45.56 
 
 		 248 aa  221  9e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  47.39 
 
 		 248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  49.18 
 
 		 247 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  47.18 
 
 		 248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1249  hypothetical protein  47.37 
 
 		 247 aa  219  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2325  hypothetical protein  49.8 
 
 		 248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.667141  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  47.39 
 
 		 248 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  48.77 
 
 		 247 aa  219  5e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1249  hypothetical protein  47.37 
 
 		 247 aa  218  6e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2554  protein of unknown function DUF28  46.77 
 
 		 248 aa  218  7.999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113083  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  47.6 
 
 		 247 aa  218  7.999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2018  protein of unknown function DUF28  51.23 
 
 		 245 aa  218  7.999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.687235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  50.42 
 
 		 243 aa  218  8.999999999999998e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  49.58 
 
 		 239 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  49.18 
 
 		 248 aa  218  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  46.8 
 
 		 247 aa  217  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  48.21 
 
 		 249 aa  217  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4204  hypothetical protein  48.19 
 
 		 248 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  46.37 
 
 		 247 aa  216  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2183  hypothetical protein  45.56 
 
 		 250 aa  216  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  48.61 
 
 		 246 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  46.77 
 
 		 248 aa  216  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  47.41 
 
 		 248 aa  215  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  50.61 
 
 		 245 aa  215  5e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2424  hypothetical protein  48.36 
 
 		 247 aa  215  5e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.079823  normal  0.460299 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2033  hypothetical protein  48.36 
 
 		 247 aa  215  5e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00594875  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0528  protein of unknown function DUF28  47.74 
 
 		 246 aa  215  5.9999999999999996e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1214  hypothetical protein  47.79 
 
 		 248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.480804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1243  hypothetical protein  47.79 
 
 		 248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  46.77 
 
 		 248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  47.95 
 
 		 247 aa  215  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  47.81 
 
 		 246 aa  215  7e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  52.63 
 
 		 247 aa  214  8e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2210  hypothetical protein  49.17 
 
 		 247 aa  214  9e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1385  hypothetical protein  49.17 
 
 		 242 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.823747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>