More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0986 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  499  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  84.15 
 
 
247 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2325  hypothetical protein  74.8 
 
 
248 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.667141  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  74.38 
 
 
245 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  69.11 
 
 
246 aa  362  3e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  65.18 
 
 
249 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  59.92 
 
 
247 aa  296  3e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  59.11 
 
 
247 aa  295  4e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  57.14 
 
 
249 aa  295  6e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  57.09 
 
 
250 aa  291  7e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  55.82 
 
 
251 aa  291  7e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  57.2 
 
 
246 aa  289  2e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2554  protein of unknown function DUF28  55.28 
 
 
248 aa  288  8e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113083  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  56.05 
 
 
250 aa  287  1e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  60.08 
 
 
248 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  56.45 
 
 
250 aa  283  1.0000000000000001e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  54 
 
 
253 aa  281  6.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  57.79 
 
 
247 aa  281  9e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  56.68 
 
 
250 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  54.25 
 
 
247 aa  280  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  52.99 
 
 
251 aa  280  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  56.68 
 
 
250 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  53.85 
 
 
247 aa  279  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  55.06 
 
 
247 aa  276  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  55.74 
 
 
247 aa  274  8e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  54.32 
 
 
246 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  55.02 
 
 
248 aa  266  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  50.62 
 
 
243 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  54.77 
 
 
247 aa  265  4e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1615  hypothetical protein  55.24 
 
 
249 aa  265  5.999999999999999e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  51.61 
 
 
250 aa  264  8e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  52.05 
 
 
249 aa  263  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  51.21 
 
 
250 aa  263  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  51.22 
 
 
248 aa  263  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  53.6 
 
 
248 aa  261  8e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  50.81 
 
 
250 aa  261  8.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  52.61 
 
 
248 aa  261  8.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  53.23 
 
 
252 aa  260  1e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  52.02 
 
 
251 aa  260  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  53.2 
 
 
248 aa  259  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  51.67 
 
 
242 aa  259  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  52.65 
 
 
249 aa  259  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  49.6 
 
 
250 aa  259  3e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  50.4 
 
 
250 aa  258  8e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2570  hypothetical protein  51.61 
 
 
251 aa  258  8e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15040  conserved hypothetical protein TIGR01033  51 
 
 
249 aa  257  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105495  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1779  hypothetical protein  51 
 
 
249 aa  257  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  52.02 
 
 
249 aa  257  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17500  conserved hypothetical protein TIGR01033  52.42 
 
 
252 aa  257  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268105  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  52.82 
 
 
247 aa  257  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  50 
 
 
250 aa  256  2e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  58.37 
 
 
243 aa  256  3e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3629  hypothetical protein  52.44 
 
 
252 aa  256  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000422691  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1792  hypothetical protein  51.41 
 
 
249 aa  255  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165315  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  52.42 
 
 
248 aa  255  4e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  49.6 
 
 
253 aa  255  5e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0816  hypothetical protein  50.63 
 
 
243 aa  255  5e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.177048  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  51.81 
 
 
248 aa  254  8e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1151  hypothetical protein  47.39 
 
 
250 aa  254  8e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  49.19 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1219  protein of unknown function DUF28  51.61 
 
 
250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0825  protein of unknown function DUF28  52.42 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal  0.0381393 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  52.02 
 
 
248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1219  hypothetical protein  51.01 
 
 
249 aa  253  3e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.854834 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  53.6 
 
 
249 aa  253  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  51.41 
 
 
248 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2290  hypothetical protein  50.81 
 
 
250 aa  251  7e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2251  hypothetical protein  50.81 
 
 
250 aa  251  7e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.06842  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2298  hypothetical protein  50.81 
 
 
250 aa  251  7e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1704  hypothetical protein  55.16 
 
 
252 aa  251  8.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609953  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13930  conserved hypothetical protein TIGR01033  51.61 
 
 
254 aa  251  8.000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0487372  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1752  hypothetical protein  52.03 
 
 
244 aa  251  9.000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000585673  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0422  hypothetical protein  52.03 
 
 
244 aa  251  9.000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0951689  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  50.83 
 
 
246 aa  250  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  53.56 
 
 
242 aa  250  1e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0807  hypothetical protein  52.61 
 
 
251 aa  249  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3853  protein of unknown function DUF28  56.43 
 
 
241 aa  249  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3828  hypothetical protein  50.4 
 
 
251 aa  250  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1013  hypothetical protein  50.2 
 
 
248 aa  249  2e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166545  hitchhiker  0.000108366 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15350  conserved hypothetical protein TIGR01033  52.02 
 
 
251 aa  249  2e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144785  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1989  hypothetical protein  50.6 
 
 
252 aa  250  2e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0129309 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  50.6 
 
 
248 aa  249  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.302719 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  53.01 
 
 
246 aa  249  4e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  51.21 
 
 
248 aa  249  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  53.01 
 
 
246 aa  249  4e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  52.12 
 
 
248 aa  249  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  53.01 
 
 
246 aa  249  4e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  53.01 
 
 
246 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  52.61 
 
 
246 aa  248  4e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  53.01 
 
 
246 aa  249  4e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  53.01 
 
 
246 aa  249  4e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12622  hypothetical protein  50.4 
 
 
251 aa  248  5e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1634  protein of unknown function DUF28  50 
 
 
252 aa  248  6e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  52.61 
 
 
246 aa  248  7e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  52.61 
 
 
246 aa  248  7e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  52.61 
 
 
246 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2729  hypothetical protein  50.81 
 
 
248 aa  248  8e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31246  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  52.61 
 
 
246 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2355  hypothetical protein  60.34 
 
 
241 aa  248  8e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.377653 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  52.61 
 
 
246 aa  248  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>