More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3490 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  69.11 
 
 		 247 aa  347  7e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  65.59 
 
 		 249 aa  342  2e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2325  hypothetical protein  67.89 
 
 		 248 aa  339  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.667141  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  70.73 
 
 		 247 aa  338  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  64.05 
 
 		 245 aa  317  2e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  51.41 
 
 		 251 aa  276  3e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  53.06 
 
 		 249 aa  275  5e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  53.85 
 
 		 247 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  53.44 
 
 		 247 aa  267  8.999999999999999e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2554  protein of unknown function DUF28  51.63 
 
 		 248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  51.01 
 
 		 247 aa  265  7e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  51.82 
 
 		 250 aa  263  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  52.63 
 
 		 247 aa  263  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  53.06 
 
 		 250 aa  263  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  51.01 
 
 		 247 aa  264  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  49 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  50 
 
 		 253 aa  262  3e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  52.72 
 
 		 246 aa  261  8e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  53.04 
 
 		 248 aa  256  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  51.01 
 
 		 247 aa  256  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  50.42 
 
 		 247 aa  255  4e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1615  hypothetical protein  50.4 
 
 		 249 aa  255  4e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  48.39 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  50.61 
 
 		 247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  50.61 
 
 		 250 aa  251  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  50.61 
 
 		 250 aa  251  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  51.01 
 
 		 248 aa  248  6e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  52.21 
 
 		 249 aa  247  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  48.15 
 
 		 246 aa  247  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  47.98 
 
 		 248 aa  246  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  50.83 
 
 		 250 aa  246  3e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  48.39 
 
 		 248 aa  246  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  49.8 
 
 		 248 aa  245  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  48.57 
 
 		 247 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2729  hypothetical protein  48.58 
 
 		 248 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3525  hypothetical protein  49.8 
 
 		 248 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  48.37 
 
 		 248 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  48.13 
 
 		 243 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4171  hypothetical protein  50.2 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265987  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  49.8 
 
 		 249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  51.21 
 
 		 246 aa  241  9e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  50.81 
 
 		 246 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  50.81 
 
 		 246 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  51.21 
 
 		 246 aa  241  9e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  51.21 
 
 		 246 aa  241  9e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  51.21 
 
 		 246 aa  241  9e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  50.81 
 
 		 246 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  51.21 
 
 		 246 aa  241  9e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  51.21 
 
 		 246 aa  241  9e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  50.81 
 
 		 246 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  50.81 
 
 		 246 aa  240  1e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  48.33 
 
 		 250 aa  241  1e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  49.39 
 
 		 248 aa  240  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  47.33 
 
 		 249 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  50.81 
 
 		 246 aa  240  1e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  50.81 
 
 		 246 aa  241  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  47.98 
 
 		 250 aa  240  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  47.58 
 
 		 250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  47.58 
 
 		 248 aa  239  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  48.79 
 
 		 248 aa  238  5e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  49.38 
 
 		 250 aa  238  5e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  47.92 
 
 		 242 aa  238  5e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  50.4 
 
 		 246 aa  238  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  48.33 
 
 		 246 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3853  protein of unknown function DUF28  52.5 
 
 		 241 aa  238  8e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  45.97 
 
 		 253 aa  237  1e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  49.19 
 
 		 248 aa  237  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1219  hypothetical protein  48.56 
 
 		 249 aa  236  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.854834 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  47.98 
 
 		 252 aa  236  3e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  48.79 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2305  hypothetical protein  48.99 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119494 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  47.58 
 
 		 248 aa  235  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  47.58 
 
 		 248 aa  235  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  45.97 
 
 		 248 aa  235  4e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  49.39 
 
 		 250 aa  235  4e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1106  hypothetical protein  49.58 
 
 		 252 aa  235  4e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  47.5 
 
 		 250 aa  235  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  45.97 
 
 		 249 aa  235  5.0000000000000005e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  49.6 
 
 		 249 aa  234  7e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  45.16 
 
 		 253 aa  234  8e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0807  hypothetical protein  49.19 
 
 		 251 aa  234  9e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2210  hypothetical protein  50.2 
 
 		 247 aa  234  9e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3629  hypothetical protein  49.17 
 
 		 252 aa  233  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000422691  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1287  hypothetical protein  50.61 
 
 		 248 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0816  hypothetical protein  45.61 
 
 		 243 aa  232  4.0000000000000004e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.177048  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1703  hypothetical protein  51.25 
 
 		 239 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24862  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1898  hypothetical protein  51.25 
 
 		 239 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484547  normal  0.228214 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1634  protein of unknown function DUF28  45.97 
 
 		 252 aa  231  6e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  46.37 
 
 		 248 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  46.37 
 
 		 248 aa  231  7.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  46.37 
 
 		 248 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  46.37 
 
 		 248 aa  230  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1219  protein of unknown function DUF28  47.18 
 
 		 250 aa  231  1e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  47.18 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2399  protein of unknown function DUF28  45.31 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42546  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0825  protein of unknown function DUF28  48.39 
 
 		 249 aa  230  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal  0.0381393 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  48.58 
 
 		 248 aa  229  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  48.18 
 
 		 249 aa  229  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  44.49 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>