More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3313 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  507  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  99.19 
 
 		 247 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  87.45 
 
 		 247 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  82.59 
 
 		 247 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  83 
 
 		 247 aa  433  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  79.35 
 
 		 247 aa  420  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  77.33 
 
 		 247 aa  414  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  63.16 
 
 		 248 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  64.73 
 
 		 246 aa  327  8e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  62.5 
 
 		 249 aa  324  8.000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  59.76 
 
 		 250 aa  318  7e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  59.76 
 
 		 250 aa  318  7e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  56.45 
 
 		 250 aa  300  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  57.85 
 
 		 250 aa  298  7e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  56.68 
 
 		 248 aa  291  5e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  55.87 
 
 		 248 aa  290  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  55.87 
 
 		 248 aa  289  4e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  55.65 
 
 		 250 aa  288  5.0000000000000004e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  55.87 
 
 		 248 aa  288  6e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  56.28 
 
 		 248 aa  287  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  56.68 
 
 		 248 aa  286  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  55.87 
 
 		 248 aa  287  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  56.68 
 
 		 248 aa  287  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  55.82 
 
 		 251 aa  287  1e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  56.68 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  56.68 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  55.47 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  55.47 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  55.47 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  56.28 
 
 		 247 aa  286  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  55.47 
 
 		 248 aa  285  5e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  55.19 
 
 		 247 aa  285  7e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  54.66 
 
 		 248 aa  285  7e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  56.28 
 
 		 248 aa  284  8e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  56.28 
 
 		 248 aa  284  9e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  54.32 
 
 		 243 aa  283  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  53.23 
 
 		 250 aa  283  1.0000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  53.63 
 
 		 250 aa  281  7.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  56.2 
 
 		 246 aa  281  9e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  55.79 
 
 		 248 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  55.37 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  56.61 
 
 		 246 aa  279  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  51.42 
 
 		 249 aa  279  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  53.6 
 
 		 253 aa  279  3e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  54.66 
 
 		 248 aa  278  4e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  54.96 
 
 		 247 aa  278  4e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  52.82 
 
 		 250 aa  278  6e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  59.83 
 
 		 240 aa  278  7e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1151  hypothetical protein  53.23 
 
 		 250 aa  277  1e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  54.07 
 
 		 249 aa  277  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  52.42 
 
 		 250 aa  276  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  54.96 
 
 		 248 aa  275  3e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  54.66 
 
 		 247 aa  276  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  51.61 
 
 		 250 aa  275  4e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  51.81 
 
 		 252 aa  275  4e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  49.8 
 
 		 253 aa  275  4e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  51.85 
 
 		 246 aa  275  5e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  53.33 
 
 		 242 aa  275  6e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0508  hypothetical protein  56.2 
 
 		 246 aa  275  6e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  53.04 
 
 		 248 aa  275  6e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  54.13 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  53.44 
 
 		 247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  54.13 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  54.13 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1615  hypothetical protein  52.42 
 
 		 249 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2183  hypothetical protein  53.04 
 
 		 250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  54.13 
 
 		 246 aa  273  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  49.4 
 
 		 253 aa  273  3e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2325  hypothetical protein  54.25 
 
 		 248 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.667141  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  53.72 
 
 		 246 aa  271  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  54.25 
 
 		 247 aa  271  7e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.226909 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  53.72 
 
 		 246 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  53.72 
 
 		 246 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  53.72 
 
 		 246 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  53.72 
 
 		 246 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  53.72 
 
 		 246 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  53.72 
 
 		 246 aa  271  8.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  57.14 
 
 		 243 aa  271  9e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0612934 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  53.31 
 
 		 246 aa  270  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  53.31 
 
 		 246 aa  270  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1301  hypothetical protein  59.92 
 
 		 242 aa  270  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17975  normal  0.117692 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  53.31 
 
 		 246 aa  270  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3259  hypothetical protein  59.92 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3853  protein of unknown function DUF28  55.6 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  53.63 
 
 		 250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  52.89 
 
 		 247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  52.02 
 
 		 250 aa  267  1e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2190  hypothetical protein  59.34 
 
 		 241 aa  266  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2424  hypothetical protein  53.31 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.079823  normal  0.460299 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0496  hypothetical protein  52.02 
 
 		 250 aa  266  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.813063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2033  hypothetical protein  53.31 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00594875  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  52.02 
 
 		 251 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  51.01 
 
 		 248 aa  265  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  53.97 
 
 		 239 aa  265  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1988  hypothetical protein  59.75 
 
 		 241 aa  265  7e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2146  hypothetical protein  52.89 
 
 		 247 aa  265  7e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2388  hypothetical protein  59.75 
 
 		 241 aa  265  7e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  50.61 
 
 		 248 aa  264  8e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4204  hypothetical protein  55.47 
 
 		 248 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  51.01 
 
 		 246 aa  264  1e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>