More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0501 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  100 
 
 
249 aa  505  9.999999999999999e-143  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  54.22 
 
 
251 aa  277  9e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  54.8 
 
 
248 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  54.4 
 
 
248 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  55.02 
 
 
248 aa  271  6e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  54 
 
 
248 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  54 
 
 
248 aa  269  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  53.6 
 
 
248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  54 
 
 
248 aa  265  5e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  54 
 
 
248 aa  265  5e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  54 
 
 
248 aa  265  5e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  54 
 
 
248 aa  264  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  53.82 
 
 
248 aa  264  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  51.81 
 
 
246 aa  258  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  51.81 
 
 
246 aa  258  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  51.81 
 
 
246 aa  258  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  51.81 
 
 
246 aa  258  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  52.61 
 
 
247 aa  258  6e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  51.81 
 
 
246 aa  258  9e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  51.81 
 
 
246 aa  258  9e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  53.41 
 
 
248 aa  257  9e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  51.81 
 
 
246 aa  258  9e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  51.81 
 
 
246 aa  258  9e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  51.81 
 
 
246 aa  258  9e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  51.81 
 
 
246 aa  258  9e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  51.81 
 
 
246 aa  258  9e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  51.41 
 
 
246 aa  257  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  51.41 
 
 
246 aa  257  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  51.81 
 
 
247 aa  257  1e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  52.4 
 
 
248 aa  256  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3629  hypothetical protein  52.48 
 
 
252 aa  256  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000422691  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  51.81 
 
 
247 aa  256  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  51.41 
 
 
246 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2146  hypothetical protein  52.21 
 
 
247 aa  255  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2033  hypothetical protein  52.21 
 
 
247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00594875  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  51.41 
 
 
247 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2424  hypothetical protein  52.21 
 
 
247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.079823  normal  0.460299 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2432  hypothetical protein  51 
 
 
246 aa  254  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  48.58 
 
 
253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  51.2 
 
 
248 aa  252  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  51.43 
 
 
247 aa  252  5.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  51.2 
 
 
248 aa  251  7e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  49.79 
 
 
247 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  50 
 
 
247 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  50.2 
 
 
248 aa  250  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  50.42 
 
 
247 aa  249  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  50.42 
 
 
247 aa  249  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  50 
 
 
248 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  49.6 
 
 
249 aa  249  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  50.4 
 
 
248 aa  249  4e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  51.02 
 
 
247 aa  248  5e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  50.4 
 
 
248 aa  248  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  48.97 
 
 
247 aa  248  5e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  49.6 
 
 
248 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  51 
 
 
248 aa  247  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  49.58 
 
 
246 aa  247  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  49.17 
 
 
247 aa  247  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  47.18 
 
 
250 aa  247  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  49.8 
 
 
246 aa  246  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  50 
 
 
247 aa  246  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  49.17 
 
 
247 aa  247  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  48.8 
 
 
248 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  46.94 
 
 
249 aa  246  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  49 
 
 
249 aa  246  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1013  hypothetical protein  47.79 
 
 
248 aa  245  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166545  hitchhiker  0.000108366 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1634  protein of unknown function DUF28  49.59 
 
 
252 aa  244  8e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1151  hypothetical protein  46.53 
 
 
250 aa  244  9e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1346  hypothetical protein  47.77 
 
 
248 aa  244  9e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404537  normal  0.548466 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  50 
 
 
245 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  49.38 
 
 
250 aa  244  9.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  47.72 
 
 
242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  45.97 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  46.59 
 
 
250 aa  241  7e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  47.79 
 
 
250 aa  241  7e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1615  hypothetical protein  51.41 
 
 
249 aa  241  7.999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  48.39 
 
 
250 aa  241  9e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  48.99 
 
 
246 aa  241  9e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1219  protein of unknown function DUF28  47.35 
 
 
250 aa  241  1e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0508  hypothetical protein  49.8 
 
 
246 aa  240  1e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2183  hypothetical protein  50.2 
 
 
250 aa  241  1e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2554  protein of unknown function DUF28  46.77 
 
 
248 aa  240  2e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113083  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  46.22 
 
 
251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  47.2 
 
 
250 aa  238  5.999999999999999e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  46.18 
 
 
251 aa  237  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  51.82 
 
 
250 aa  237  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  43.44 
 
 
249 aa  237  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1214  hypothetical protein  50 
 
 
248 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.480804  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  47.43 
 
 
253 aa  236  2e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0422  hypothetical protein  49.59 
 
 
244 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0951689  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1243  hypothetical protein  50 
 
 
248 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362221  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  45.78 
 
 
250 aa  237  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  46.77 
 
 
246 aa  236  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4204  hypothetical protein  50 
 
 
248 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300828  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  46.37 
 
 
250 aa  236  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1752  hypothetical protein  49.59 
 
 
244 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000585673  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  47.79 
 
 
247 aa  236  2e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  47.58 
 
 
250 aa  236  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  47.58 
 
 
250 aa  236  3e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0807  hypothetical protein  48 
 
 
251 aa  235  4e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  45.97 
 
 
246 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>