More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0657 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  508  1e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  87.2 
 
 		 250 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  85.54 
 
 		 250 aa  443  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  86.29 
 
 		 250 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  84.8 
 
 		 250 aa  437  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  76.71 
 
 		 250 aa  396  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0496  hypothetical protein  76.71 
 
 		 250 aa  389  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.813063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  56.38 
 
 		 246 aa  297  1e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  53.23 
 
 		 247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  53.63 
 
 		 247 aa  281  5.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  54.55 
 
 		 253 aa  281  5.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  53.63 
 
 		 247 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  53.23 
 
 		 247 aa  278  6e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  51.61 
 
 		 247 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  50.4 
 
 		 250 aa  271  5.000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  51.61 
 
 		 247 aa  271  5.000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  51.21 
 
 		 248 aa  270  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  49.4 
 
 		 251 aa  268  7e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  52.07 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  50.81 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  53.23 
 
 		 250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  53.23 
 
 		 250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  49 
 
 		 249 aa  263  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  51.24 
 
 		 249 aa  259  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  51.21 
 
 		 248 aa  259  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  48.79 
 
 		 248 aa  256  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  50.81 
 
 		 247 aa  255  6e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  50 
 
 		 251 aa  254  8e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  48.39 
 
 		 249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  48.8 
 
 		 250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0618  hypothetical protein  51.9 
 
 		 239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.979417  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  49.2 
 
 		 249 aa  251  9.000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  50.81 
 
 		 248 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  50.81 
 
 		 248 aa  249  2e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  50.81 
 
 		 248 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  52.21 
 
 		 250 aa  250  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1346  hypothetical protein  49.8 
 
 		 248 aa  250  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404537  normal  0.548466 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  50.81 
 
 		 248 aa  249  3e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2066  hypothetical protein  49.4 
 
 		 250 aa  249  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  50.4 
 
 		 248 aa  248  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1779  hypothetical protein  48.59 
 
 		 249 aa  248  5e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  50.4 
 
 		 251 aa  248  5e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  50.81 
 
 		 248 aa  248  6e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  50.81 
 
 		 248 aa  248  6e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  50.81 
 
 		 248 aa  248  6e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  50.81 
 
 		 248 aa  248  7e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2570  hypothetical protein  49 
 
 		 251 aa  248  8e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  51.25 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  51.04 
 
 		 242 aa  247  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  48.78 
 
 		 250 aa  247  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  51.04 
 
 		 246 aa  247  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  47.98 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15040  conserved hypothetical protein TIGR01033  47.39 
 
 		 249 aa  246  3e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0839  DNA-binding regulatory protein, YebC/PmpR family  52.19 
 
 		 252 aa  246  3e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0661  hypothetical protein  48.59 
 
 		 248 aa  245  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  48.59 
 
 		 252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2325  hypothetical protein  48.4 
 
 		 248 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.667141  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3853  protein of unknown function DUF28  50.41 
 
 		 241 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  48.39 
 
 		 248 aa  245  6e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  51.61 
 
 		 247 aa  245  6e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1792  hypothetical protein  48.19 
 
 		 249 aa  245  6e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  50.83 
 
 		 245 aa  244  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2290  hypothetical protein  48.61 
 
 		 250 aa  244  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2251  hypothetical protein  48.61 
 
 		 250 aa  244  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.06842  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2298  hypothetical protein  48.61 
 
 		 250 aa  244  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1371  protein of unknown function DUF28  49 
 
 		 252 aa  244  8e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.82714  normal  0.0256064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2351  protein of unknown function DUF28  48.61 
 
 		 251 aa  243  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0825  protein of unknown function DUF28  47.43 
 
 		 249 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal  0.0381393 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  48.15 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  46.18 
 
 		 253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2399  protein of unknown function DUF28  45.38 
 
 		 248 aa  242  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42546  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  48.77 
 
 		 243 aa  242  3e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3828  hypothetical protein  47.6 
 
 		 251 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1989  hypothetical protein  46.83 
 
 		 252 aa  242  5e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0129309 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17500  conserved hypothetical protein TIGR01033  47.79 
 
 		 252 aa  242  5e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268105  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15350  conserved hypothetical protein TIGR01033  47.41 
 
 		 251 aa  241  7e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1219  protein of unknown function DUF28  47.39 
 
 		 250 aa  241  7.999999999999999e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0450  hypothetical protein  52.19 
 
 		 251 aa  241  9e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6116  hypothetical protein  48 
 
 		 250 aa  241  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal  0.165467 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1151  hypothetical protein  45.42 
 
 		 250 aa  241  9e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12622  hypothetical protein  46.61 
 
 		 251 aa  241  1e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  46.4 
 
 		 250 aa  241  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1634  protein of unknown function DUF28  48.4 
 
 		 252 aa  240  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3179  protein of unknown function DUF28  48.8 
 
 		 250 aa  240  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  48.19 
 
 		 248 aa  239  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  45.78 
 
 		 253 aa  239  2e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  47.58 
 
 		 246 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  50.21 
 
 		 243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1368  hypothetical protein  48.58 
 
 		 251 aa  239  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3629  hypothetical protein  50.41 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000422691  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1704  hypothetical protein  50.4 
 
 		 252 aa  238  5e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609953  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0816  hypothetical protein  46.91 
 
 		 243 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.177048  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  47.58 
 
 		 248 aa  237  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2554  protein of unknown function DUF28  47.6 
 
 		 248 aa  237  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113083  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  45.78 
 
 		 249 aa  237  2e-61  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2110  protein of unknown function DUF28  49 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190247  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1845  hypothetical protein  47.79 
 
 		 249 aa  236  3e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00676371  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3057  protein of unknown function DUF28  47.04 
 
 		 253 aa  236  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205438  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3398  protein of unknown function DUF28  48.03 
 
 		 255 aa  236  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438869  decreased coverage  0.000000218577 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1898  hypothetical protein  48.75 
 
 		 239 aa  236  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484547  normal  0.228214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>