More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0060 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  503  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  503  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  61.79 
 
 		 247 aa  322  5e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  60.57 
 
 		 247 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  62.2 
 
 		 247 aa  318  6e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  61.38 
 
 		 248 aa  318  7e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  59.76 
 
 		 247 aa  318  7e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  61.79 
 
 		 247 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  61.38 
 
 		 247 aa  310  1e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  59.92 
 
 		 248 aa  304  8.000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  59.92 
 
 		 248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  60 
 
 		 250 aa  303  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  58.54 
 
 		 247 aa  300  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  60.73 
 
 		 248 aa  297  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  60.08 
 
 		 248 aa  296  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  59.51 
 
 		 248 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  59.11 
 
 		 248 aa  293  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  59.11 
 
 		 248 aa  293  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  57.96 
 
 		 250 aa  293  2e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  59.11 
 
 		 248 aa  293  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  59.11 
 
 		 248 aa  292  4e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1703  hypothetical protein  59.41 
 
 		 239 aa  291  8e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24862  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1898  hypothetical protein  59.41 
 
 		 239 aa  291  8e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484547  normal  0.228214 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2237  hypothetical protein  63.05 
 
 		 249 aa  289  4e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  59.51 
 
 		 248 aa  288  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  59.11 
 
 		 248 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  58.7 
 
 		 248 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  59.68 
 
 		 247 aa  288  6e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  59.11 
 
 		 248 aa  287  9e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  57.74 
 
 		 239 aa  287  9e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  60.26 
 
 		 240 aa  287  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  57.49 
 
 		 248 aa  287  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3203  hypothetical protein  59.75 
 
 		 239 aa  287  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  57.09 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  57.09 
 
 		 248 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  56.68 
 
 		 248 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  57.83 
 
 		 249 aa  284  7e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  56.68 
 
 		 248 aa  283  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  57.26 
 
 		 248 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  56.45 
 
 		 248 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  55.6 
 
 		 251 aa  281  6.000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  59.11 
 
 		 246 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  59.11 
 
 		 246 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  59.11 
 
 		 246 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  59.11 
 
 		 246 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  55.65 
 
 		 248 aa  278  4e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1953  hypothetical protein  57.63 
 
 		 241 aa  278  5e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  58.3 
 
 		 246 aa  278  8e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  58.3 
 
 		 246 aa  278  8e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  58.3 
 
 		 246 aa  278  8e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  58.3 
 
 		 246 aa  278  8e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  58.3 
 
 		 246 aa  278  8e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  58.3 
 
 		 246 aa  278  8e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  58.3 
 
 		 246 aa  277  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  58.7 
 
 		 246 aa  277  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2683  hypothetical protein  60.58 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0166157  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  58.3 
 
 		 246 aa  277  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  57.44 
 
 		 249 aa  277  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  58.3 
 
 		 246 aa  277  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2325  hypothetical protein  55.24 
 
 		 248 aa  276  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.667141  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  54.4 
 
 		 253 aa  276  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  56.38 
 
 		 243 aa  276  3e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2183  hypothetical protein  54.44 
 
 		 250 aa  276  3e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2432  hypothetical protein  57.89 
 
 		 246 aa  276  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  56.68 
 
 		 247 aa  275  4e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3853  protein of unknown function DUF28  57.2 
 
 		 241 aa  275  7e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0422  hypothetical protein  57.02 
 
 		 244 aa  275  7e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0951689  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1752  hypothetical protein  57.02 
 
 		 244 aa  275  7e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000585673  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  56.45 
 
 		 248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  56.05 
 
 		 249 aa  274  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  55.2 
 
 		 252 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  54.22 
 
 		 250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  55.79 
 
 		 247 aa  272  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  56.05 
 
 		 247 aa  271  6e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  54.25 
 
 		 250 aa  270  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  55.47 
 
 		 247 aa  270  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  54.77 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2522  hypothetical protein  58.9 
 
 		 241 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  54.66 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1301  hypothetical protein  58.68 
 
 		 242 aa  270  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17975  normal  0.117692 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3259  hypothetical protein  58.68 
 
 		 242 aa  269  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  54.96 
 
 		 247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  54.77 
 
 		 246 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  53.91 
 
 		 246 aa  268  4e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0528  protein of unknown function DUF28  55.28 
 
 		 246 aa  268  5e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2424  hypothetical protein  55.06 
 
 		 247 aa  268  7e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.079823  normal  0.460299 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2033  hypothetical protein  55.06 
 
 		 247 aa  268  7e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00594875  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1249  hypothetical protein  54.36 
 
 		 247 aa  267  1e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1728  hypothetical protein  58.09 
 
 		 241 aa  267  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.359816 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  54 
 
 		 250 aa  266  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  54.25 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  52.7 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2146  hypothetical protein  54.66 
 
 		 247 aa  266  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1013  hypothetical protein  54.66 
 
 		 248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166545  hitchhiker  0.000108366 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2031  hypothetical protein  58.47 
 
 		 248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0016605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  53.23 
 
 		 250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1249  hypothetical protein  53.94 
 
 		 247 aa  265  5e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1106  hypothetical protein  55.34 
 
 		 252 aa  265  5e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4204  hypothetical protein  56.28 
 
 		 248 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300828  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1214  hypothetical protein  56.28 
 
 		 248 aa  265  7e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.480804  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>