More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1487 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  498  1e-140  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  62.76 
 
 		 247 aa  313  9.999999999999999e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  62.34 
 
 		 247 aa  311  4.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  61.32 
 
 		 247 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  58.68 
 
 		 250 aa  298  4e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  59.83 
 
 		 247 aa  296  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  60.33 
 
 		 247 aa  295  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  58.09 
 
 		 247 aa  296  3e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  57.85 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  55.19 
 
 		 247 aa  286  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  55.19 
 
 		 247 aa  285  7e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  57.44 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  58.92 
 
 		 248 aa  281  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  55.37 
 
 		 250 aa  281  9e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  56.61 
 
 		 248 aa  280  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  57.44 
 
 		 248 aa  280  1e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  56.61 
 
 		 248 aa  280  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  56.2 
 
 		 248 aa  280  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  53.28 
 
 		 253 aa  280  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  56.2 
 
 		 248 aa  279  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  56.2 
 
 		 249 aa  279  3e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  56.2 
 
 		 248 aa  278  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  56.2 
 
 		 248 aa  278  4e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  56.2 
 
 		 248 aa  278  4e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  56.2 
 
 		 248 aa  278  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  54.55 
 
 		 250 aa  278  6e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  56.2 
 
 		 248 aa  278  8e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  55.79 
 
 		 248 aa  277  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  53.94 
 
 		 246 aa  276  2e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  55.83 
 
 		 246 aa  275  7e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  55.37 
 
 		 248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2183  hypothetical protein  55.37 
 
 		 250 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  53.72 
 
 		 250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  57.02 
 
 		 248 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  58.68 
 
 		 248 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  58.26 
 
 		 248 aa  271  7e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  54.13 
 
 		 250 aa  270  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  55.37 
 
 		 248 aa  270  2e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  54.77 
 
 		 250 aa  270  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  54.77 
 
 		 250 aa  270  2e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  56.28 
 
 		 245 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  53.31 
 
 		 248 aa  268  4e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  55.37 
 
 		 248 aa  268  4e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  53.25 
 
 		 250 aa  268  7e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  55.37 
 
 		 248 aa  268  8e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  56.61 
 
 		 248 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  52.07 
 
 		 250 aa  266  2e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0025  hypothetical protein  54.77 
 
 		 243 aa  266  2e-70  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  55 
 
 		 246 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  56.56 
 
 		 243 aa  265  4e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  51.65 
 
 		 250 aa  265  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  56.79 
 
 		 249 aa  265  5.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  54.13 
 
 		 250 aa  265  5.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1151  hypothetical protein  52.48 
 
 		 250 aa  264  1e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  51.84 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1615  hypothetical protein  56.2 
 
 		 249 aa  263  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0496  hypothetical protein  56.2 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.813063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2432  hypothetical protein  55.37 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0816  hypothetical protein  51.46 
 
 		 243 aa  262  4e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.177048  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  53.11 
 
 		 246 aa  262  4e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  52.89 
 
 		 250 aa  262  4e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  52.26 
 
 		 248 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  54.96 
 
 		 247 aa  261  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  54.55 
 
 		 246 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  54.55 
 
 		 246 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  54.55 
 
 		 246 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  54.13 
 
 		 247 aa  259  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  54.55 
 
 		 246 aa  259  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  53.72 
 
 		 247 aa  260  2e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2729  hypothetical protein  52.67 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  53.62 
 
 		 248 aa  259  3e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  53.72 
 
 		 246 aa  259  4e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  53.72 
 
 		 246 aa  259  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  53.31 
 
 		 247 aa  259  4e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  53.72 
 
 		 246 aa  259  4e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  53.31 
 
 		 246 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  52.89 
 
 		 247 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  53.31 
 
 		 246 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  51.04 
 
 		 248 aa  258  5.0000000000000005e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  53.31 
 
 		 246 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  53.31 
 
 		 246 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  53.31 
 
 		 246 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  53.31 
 
 		 246 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  54.77 
 
 		 247 aa  258  6e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  52.67 
 
 		 248 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  51.45 
 
 		 249 aa  258  7e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  50.62 
 
 		 243 aa  257  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  54.13 
 
 		 246 aa  257  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2018  protein of unknown function DUF28  54.73 
 
 		 245 aa  255  4e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.687235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  55.19 
 
 		 247 aa  255  4e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  55.51 
 
 		 240 aa  255  4e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  50.42 
 
 		 246 aa  255  4e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3853  protein of unknown function DUF28  54.13 
 
 		 241 aa  255  5e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  49.38 
 
 		 249 aa  255  5e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1214  hypothetical protein  55.37 
 
 		 248 aa  254  8e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.480804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4204  hypothetical protein  55.37 
 
 		 248 aa  254  8e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1243  hypothetical protein  55.37 
 
 		 248 aa  254  8e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2031  hypothetical protein  55.37 
 
 		 248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0016605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1752  hypothetical protein  53.72 
 
 		 244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000585673  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0422  hypothetical protein  53.72 
 
 		 244 aa  254  1.0000000000000001e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0951689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>