More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4273 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4171  hypothetical protein  95.56 
 
 		 248 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265987  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1287  hypothetical protein  95.56 
 
 		 248 aa  467  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2729  hypothetical protein  88.31 
 
 		 248 aa  456  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  88.31 
 
 		 248 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3525  hypothetical protein  87.1 
 
 		 248 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6910  hypothetical protein  85.08 
 
 		 248 aa  418  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311344 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2305  hypothetical protein  75.2 
 
 		 248 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119494 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2114  hypothetical protein  69.23 
 
 		 248 aa  371  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.308852  normal  0.355584 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7401  hypothetical protein  76.02 
 
 		 248 aa  370  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372247  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6579  hypothetical protein  75.2 
 
 		 248 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3062  hypothetical protein  77.64 
 
 		 249 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0946  hypothetical protein  74.8 
 
 		 248 aa  363  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.596094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0982  hypothetical protein  74.8 
 
 		 264 aa  362  2e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.501161 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0345  hypothetical protein  74.39 
 
 		 248 aa  361  6e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3553  hypothetical protein  74.39 
 
 		 248 aa  360  1e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0922  hypothetical protein  74.8 
 
 		 248 aa  353  1e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  67.21 
 
 		 248 aa  348  4e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  66.4 
 
 		 248 aa  341  5.999999999999999e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  66.8 
 
 		 248 aa  340  1e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  66.8 
 
 		 248 aa  340  1e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  66.8 
 
 		 249 aa  338  4e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  65.99 
 
 		 248 aa  335  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0163  hypothetical protein  64.37 
 
 		 248 aa  335  5.999999999999999e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  64.78 
 
 		 248 aa  334  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3509  hypothetical protein  64.78 
 
 		 248 aa  332  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.208978 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  61.79 
 
 		 246 aa  317  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  61.79 
 
 		 248 aa  315  4e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  61.38 
 
 		 246 aa  314  7e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  61.79 
 
 		 248 aa  314  9e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  61.79 
 
 		 248 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0337  hypothetical protein  62.35 
 
 		 248 aa  310  1e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1219  hypothetical protein  60.89 
 
 		 249 aa  310  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.854834 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2762  hypothetical protein  61.79 
 
 		 246 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0792169 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2907  hypothetical protein  62.5 
 
 		 253 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3380  hypothetical protein  57.09 
 
 		 255 aa  301  9e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2142  hypothetical protein  61.38 
 
 		 247 aa  298  7e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0419  hypothetical protein  55.34 
 
 		 254 aa  290  1e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.26819  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1086  hypothetical protein  61.13 
 
 		 249 aa  288  4e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2433  hypothetical protein  55.56 
 
 		 253 aa  286  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0780  hypothetical protein  60 
 
 		 251 aa  277  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0981369  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  54.25 
 
 		 247 aa  268  7e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  55.65 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  51.01 
 
 		 247 aa  259  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  51.01 
 
 		 247 aa  259  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  53.85 
 
 		 247 aa  259  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  52.67 
 
 		 247 aa  258  7e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  53.44 
 
 		 247 aa  258  7e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  48.59 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  52.23 
 
 		 247 aa  255  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  51.41 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  50.81 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0484  hypothetical protein  52.85 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  51.01 
 
 		 246 aa  248  6e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  48.39 
 
 		 250 aa  244  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  49.79 
 
 		 246 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  50.81 
 
 		 248 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  49.8 
 
 		 250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  48.61 
 
 		 251 aa  239  4e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  51.65 
 
 		 246 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2775  hypothetical protein  48.81 
 
 		 255 aa  238  9e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  51.6 
 
 		 247 aa  238  9e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2325  hypothetical protein  50 
 
 		 248 aa  236  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.667141  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  51 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  53.19 
 
 		 243 aa  236  3e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  49.59 
 
 		 246 aa  236  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  49.19 
 
 		 248 aa  235  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  47.98 
 
 		 249 aa  234  9e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  48.39 
 
 		 248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  54 
 
 		 247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  49.19 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  48.41 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  49.19 
 
 		 248 aa  232  5e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  48.8 
 
 		 249 aa  231  7.000000000000001e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  50 
 
 		 247 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  49.59 
 
 		 247 aa  230  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  51 
 
 		 249 aa  230  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  49.6 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  51.68 
 
 		 245 aa  229  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  48.79 
 
 		 247 aa  229  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  47.79 
 
 		 248 aa  228  6e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4204  hypothetical protein  50 
 
 		 248 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  48.16 
 
 		 247 aa  228  7e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  48.79 
 
 		 248 aa  228  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  47.98 
 
 		 246 aa  228  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  47.98 
 
 		 246 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  47.98 
 
 		 246 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  47.98 
 
 		 246 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  47.98 
 
 		 246 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  47.98 
 
 		 248 aa  228  9e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2424  hypothetical protein  47.98 
 
 		 247 aa  227  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.079823  normal  0.460299 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2033  hypothetical protein  47.98 
 
 		 247 aa  227  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00594875  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1214  hypothetical protein  49.6 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.480804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1243  hypothetical protein  49.6 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  47.58 
 
 		 253 aa  226  2e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0704  hypothetical protein  48.57 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  47.58 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  50.2 
 
 		 249 aa  226  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  46.56 
 
 		 250 aa  227  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0025  hypothetical protein  47.95 
 
 		 243 aa  226  2e-58  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>