More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0685 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  509  1e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  56.97 
 
 
253 aa  302  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  59.84 
 
 
247 aa  300  1e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  56.22 
 
 
249 aa  295  7e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  57.83 
 
 
247 aa  293  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  56.22 
 
 
247 aa  288  5.0000000000000004e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  56.63 
 
 
247 aa  287  9e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  55.82 
 
 
247 aa  287  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  55.42 
 
 
247 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  55.82 
 
 
247 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  53.01 
 
 
249 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  55.6 
 
 
250 aa  281  6.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  55.6 
 
 
250 aa  281  6.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  55.02 
 
 
248 aa  281  7.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  55.82 
 
 
247 aa  281  7.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  55.06 
 
 
246 aa  281  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  56.8 
 
 
247 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1704  hypothetical protein  59.92 
 
 
252 aa  279  3e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609953  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  54.22 
 
 
249 aa  277  9e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  56.25 
 
 
242 aa  276  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  54.8 
 
 
250 aa  276  2e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  54.69 
 
 
243 aa  276  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1615  hypothetical protein  57.6 
 
 
249 aa  276  3e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  51.41 
 
 
246 aa  276  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1634  protein of unknown function DUF28  55.6 
 
 
252 aa  275  4e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1151  hypothetical protein  51.41 
 
 
250 aa  275  5e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  54.3 
 
 
252 aa  275  7e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  52.8 
 
 
250 aa  275  7e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0661  hypothetical protein  53.01 
 
 
248 aa  274  8e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135239  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  53.78 
 
 
248 aa  271  9e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  48.59 
 
 
250 aa  270  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  56.96 
 
 
240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  52.78 
 
 
251 aa  269  2.9999999999999997e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  49.4 
 
 
250 aa  268  8e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  53.91 
 
 
253 aa  268  8.999999999999999e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  51.6 
 
 
250 aa  266  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  53.91 
 
 
253 aa  267  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  52.92 
 
 
248 aa  265  4e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  50 
 
 
250 aa  265  5.999999999999999e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2325  hypothetical protein  51.2 
 
 
248 aa  265  7e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.667141  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  51 
 
 
248 aa  265  8e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  52.8 
 
 
246 aa  263  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  48.21 
 
 
250 aa  264  1e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  51.84 
 
 
247 aa  263  2e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  50.8 
 
 
248 aa  263  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  52.63 
 
 
245 aa  262  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  49.4 
 
 
250 aa  261  4.999999999999999e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  51 
 
 
248 aa  261  6e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  56.2 
 
 
246 aa  261  6e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1219  protein of unknown function DUF28  49.8 
 
 
250 aa  261  1e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  51 
 
 
248 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  52.38 
 
 
250 aa  260  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  51.19 
 
 
249 aa  260  1e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  52.07 
 
 
242 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  52.24 
 
 
243 aa  259  2e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  51.41 
 
 
248 aa  259  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  49.19 
 
 
249 aa  259  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  50.8 
 
 
249 aa  259  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  51.2 
 
 
248 aa  259  4e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  49.6 
 
 
247 aa  259  4e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3629  hypothetical protein  53.01 
 
 
252 aa  258  6e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000422691  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3853  protein of unknown function DUF28  52.26 
 
 
241 aa  258  8e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  48.8 
 
 
248 aa  258  8e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.302719 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  51.81 
 
 
246 aa  258  9e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  51.81 
 
 
246 aa  258  9e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  51.81 
 
 
246 aa  258  9e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  51.81 
 
 
246 aa  258  9e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  51.81 
 
 
246 aa  258  9e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  51.81 
 
 
246 aa  258  9e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  51.81 
 
 
246 aa  258  9e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  51.41 
 
 
246 aa  257  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  51.41 
 
 
246 aa  257  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  48 
 
 
250 aa  256  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  51.03 
 
 
250 aa  256  2e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  51.41 
 
 
246 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  51.41 
 
 
246 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  51.41 
 
 
248 aa  256  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  51.41 
 
 
246 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  51.41 
 
 
246 aa  256  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  51.81 
 
 
246 aa  255  4e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  50.6 
 
 
248 aa  255  4e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  50.2 
 
 
248 aa  255  5e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  50.2 
 
 
248 aa  255  5e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  50.2 
 
 
248 aa  255  5e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0816  hypothetical protein  52.28 
 
 
243 aa  254  6e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.177048  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  49.8 
 
 
248 aa  254  7e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1106  hypothetical protein  52.73 
 
 
252 aa  254  7e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  49.2 
 
 
248 aa  254  8e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  52.07 
 
 
239 aa  254  9e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  50.2 
 
 
248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  49.8 
 
 
248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  49.8 
 
 
248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  51 
 
 
246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  49.8 
 
 
248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1703  hypothetical protein  51.65 
 
 
239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24862  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1898  hypothetical protein  51.65 
 
 
239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484547  normal  0.228214 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2399  protein of unknown function DUF28  51.42 
 
 
248 aa  253  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42546  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  50.6 
 
 
248 aa  252  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0925  protein of unknown function DUF28  50.8 
 
 
250 aa  252  3e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.488101  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  49.4 
 
 
248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>