More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2075 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  496  1e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  71.55 
 
 		 248 aa  372  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0816  hypothetical protein  68.62 
 
 		 243 aa  342  2.9999999999999997e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.177048  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  60.5 
 
 		 246 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2507  hypothetical protein  62.08 
 
 		 242 aa  298  4e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.153457  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  54.58 
 
 		 243 aa  281  9e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  56.25 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  56.85 
 
 		 251 aa  273  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  55.65 
 
 		 246 aa  272  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  54.17 
 
 		 242 aa  272  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  56.07 
 
 		 246 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2210  hypothetical protein  62.61 
 
 		 245 aa  271  6e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1922  hypothetical protein  62.61 
 
 		 245 aa  271  6e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.541871  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  55.23 
 
 		 247 aa  265  4e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  53.97 
 
 		 247 aa  261  8e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  53.97 
 
 		 247 aa  259  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  51.04 
 
 		 250 aa  258  8e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  50 
 
 		 253 aa  257  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  51.88 
 
 		 247 aa  256  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3629  hypothetical protein  53.33 
 
 		 252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000422691  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  51.88 
 
 		 249 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  52.08 
 
 		 252 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1634  protein of unknown function DUF28  51.88 
 
 		 252 aa  250  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  50.42 
 
 		 250 aa  249  3e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  51.48 
 
 		 243 aa  248  4e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  53.14 
 
 		 247 aa  248  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  51.88 
 
 		 247 aa  248  5e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  53.14 
 
 		 248 aa  248  9e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  50.63 
 
 		 247 aa  247  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  51.03 
 
 		 253 aa  247  1e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  51.68 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  53.75 
 
 		 248 aa  246  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  52.72 
 
 		 249 aa  246  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  50.42 
 
 		 246 aa  246  2e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  50.21 
 
 		 247 aa  246  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  50 
 
 		 253 aa  245  4e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1704  hypothetical protein  53.97 
 
 		 252 aa  245  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609953  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1210  protein of unknown function DUF28  52.72 
 
 		 243 aa  245  4.9999999999999997e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1013  hypothetical protein  52.52 
 
 		 248 aa  245  4.9999999999999997e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166545  hitchhiker  0.000108366 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  50.63 
 
 		 248 aa  243  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2554  protein of unknown function DUF28  51.05 
 
 		 248 aa  242  5e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113083  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  52.72 
 
 		 248 aa  241  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  51.65 
 
 		 248 aa  241  7e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  51.67 
 
 		 248 aa  240  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1615  hypothetical protein  50.63 
 
 		 249 aa  240  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  49.37 
 
 		 248 aa  240  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  53.56 
 
 		 247 aa  239  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2054  hypothetical protein  50.2 
 
 		 255 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2028  hypothetical protein  50.2 
 
 		 255 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  53.14 
 
 		 248 aa  238  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  52.72 
 
 		 248 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  50.63 
 
 		 246 aa  238  9e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  50.63 
 
 		 246 aa  238  9e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  50.63 
 
 		 246 aa  238  9e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  50.63 
 
 		 246 aa  238  9e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  50.63 
 
 		 246 aa  238  9e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  50.63 
 
 		 246 aa  238  9e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  50.21 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  50.21 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1151  hypothetical protein  47.28 
 
 		 250 aa  237  1e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  50.21 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  50.41 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  50.41 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  50.41 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  50.41 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  51.05 
 
 		 248 aa  235  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  48.12 
 
 		 248 aa  234  7e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  50 
 
 		 246 aa  234  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  51.05 
 
 		 248 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  48.95 
 
 		 250 aa  233  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1228  hypothetical protein  48.76 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0508  hypothetical protein  51.65 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1898  hypothetical protein  50.21 
 
 		 239 aa  232  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484547  normal  0.228214 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  49.16 
 
 		 248 aa  233  3e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  47.28 
 
 		 249 aa  233  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1703  hypothetical protein  50.21 
 
 		 239 aa  232  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24862  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4204  hypothetical protein  52.3 
 
 		 248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  50.63 
 
 		 249 aa  232  5e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  47.7 
 
 		 252 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2775  hypothetical protein  47.35 
 
 		 255 aa  231  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1214  hypothetical protein  51.88 
 
 		 248 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.480804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1243  hypothetical protein  51.88 
 
 		 248 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  50.63 
 
 		 248 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  46.25 
 
 		 249 aa  231  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  50.21 
 
 		 240 aa  230  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  48.54 
 
 		 250 aa  229  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1953  hypothetical protein  49.79 
 
 		 241 aa  230  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2183  hypothetical protein  48.54 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1479  hypothetical protein  50.84 
 
 		 249 aa  229  4e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  48.54 
 
 		 248 aa  228  8e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  48.54 
 
 		 239 aa  227  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  48.95 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  48.54 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  46.44 
 
 		 246 aa  227  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0938  hypothetical protein  50.42 
 
 		 249 aa  226  3e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.879867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  47.28 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  48.54 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2117  protein of unknown function DUF28  47.06 
 
 		 247 aa  226  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.892674  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2432  hypothetical protein  50 
 
 		 246 aa  225  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  48.12 
 
 		 248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>