More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2399 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2399  protein of unknown function DUF28  100 
 
 		 248 aa  500  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42546  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  55.65 
 
 		 253 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  56.05 
 
 		 253 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  51.61 
 
 		 250 aa  266  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  53.63 
 
 		 252 aa  262  3e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  49.17 
 
 		 246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  51.67 
 
 		 249 aa  253  3e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  51.42 
 
 		 251 aa  253  3e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1106  hypothetical protein  50.81 
 
 		 252 aa  250  1e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  50 
 
 		 247 aa  250  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  47.98 
 
 		 248 aa  245  6e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  47.5 
 
 		 247 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  48.33 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  45.38 
 
 		 250 aa  242  3e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  46.59 
 
 		 250 aa  242  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  48.18 
 
 		 250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  48.18 
 
 		 250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  50 
 
 		 248 aa  242  5e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  48.13 
 
 		 247 aa  241  1e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  45.56 
 
 		 250 aa  240  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  48.75 
 
 		 247 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  43.78 
 
 		 250 aa  240  1e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  51.41 
 
 		 250 aa  240  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  47.74 
 
 		 247 aa  240  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1615  hypothetical protein  51.41 
 
 		 249 aa  239  2e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  47.08 
 
 		 247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  46.67 
 
 		 247 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  48.19 
 
 		 248 aa  238  8e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  46.67 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  46.28 
 
 		 246 aa  237  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  43.95 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  43.37 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1650  protein of unknown function DUF28  44.96 
 
 		 247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  48.37 
 
 		 250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  47.33 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  44.49 
 
 		 243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0925  protein of unknown function DUF28  50.81 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.488101  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  48.59 
 
 		 249 aa  233  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  48.74 
 
 		 248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1371  protein of unknown function DUF28  48.13 
 
 		 252 aa  232  5e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.82714  normal  0.0256064 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  47.15 
 
 		 246 aa  231  9e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  45.31 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  48.51 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  48.13 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  47.58 
 
 		 248 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0496  hypothetical protein  46.77 
 
 		 250 aa  228  5e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.813063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  47.3 
 
 		 249 aa  228  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  47.18 
 
 		 248 aa  228  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  48.51 
 
 		 248 aa  228  7e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12622  hypothetical protein  49.4 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1346  hypothetical protein  47.18 
 
 		 248 aa  228  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404537  normal  0.548466 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  48.19 
 
 		 249 aa  226  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1989  hypothetical protein  46.18 
 
 		 252 aa  226  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0129309 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  46.99 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0422  hypothetical protein  46.94 
 
 		 244 aa  226  3e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0951689  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1752  hypothetical protein  46.94 
 
 		 244 aa  226  3e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000585673  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  46.75 
 
 		 246 aa  225  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0709  protein of unknown function DUF28  50.41 
 
 		 251 aa  225  4e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2325  hypothetical protein  44.94 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.667141  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  44.76 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2117  protein of unknown function DUF28  47.9 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.892674  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  46.22 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  47.68 
 
 		 243 aa  224  1e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0025  hypothetical protein  46.28 
 
 		 243 aa  223  2e-57  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  48.52 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15040  conserved hypothetical protein TIGR01033  46.37 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  42.17 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  45.56 
 
 		 248 aa  222  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1634  protein of unknown function DUF28  52.07 
 
 		 252 aa  222  4e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  47.68 
 
 		 248 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  46.06 
 
 		 245 aa  221  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  48.35 
 
 		 240 aa  221  6e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3057  protein of unknown function DUF28  46.4 
 
 		 253 aa  221  6e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205438  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2066  hypothetical protein  49.38 
 
 		 250 aa  221  7e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1219  protein of unknown function DUF28  48.55 
 
 		 250 aa  221  9e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  46.61 
 
 		 248 aa  221  9e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3179  protein of unknown function DUF28  48.18 
 
 		 250 aa  221  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17500  conserved hypothetical protein TIGR01033  46.47 
 
 		 252 aa  220  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268105  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1219  hypothetical protein  48.33 
 
 		 249 aa  219  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.854834 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3629  hypothetical protein  48.76 
 
 		 252 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000422691  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  46.77 
 
 		 249 aa  220  1.9999999999999999e-56  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2251  hypothetical protein  46.99 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.06842  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2554  protein of unknown function DUF28  45.56 
 
 		 248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2298  hypothetical protein  46.99 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  44.53 
 
 		 247 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2290  hypothetical protein  46.99 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1249  hypothetical protein  43.55 
 
 		 247 aa  219  3e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2570  hypothetical protein  47.01 
 
 		 251 aa  219  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  47.23 
 
 		 247 aa  219  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0807  hypothetical protein  48.16 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  47.48 
 
 		 242 aa  219  5e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  46.84 
 
 		 248 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2108  protein of unknown function DUF28  46.77 
 
 		 249 aa  218  6e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00811013  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1210  protein of unknown function DUF28  43.21 
 
 		 243 aa  218  7e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  44.08 
 
 		 242 aa  218  7e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  47.66 
 
 		 247 aa  218  7.999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  46.81 
 
 		 247 aa  217  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  47.46 
 
 		 248 aa  217  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  47.46 
 
 		 248 aa  217  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1471  hypothetical protein  44.94 
 
 		 248 aa  217  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.503322  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>