More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1210 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1210  protein of unknown function DUF28  100 
 
 
243 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  53.5 
 
 
247 aa  265  5e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  52.24 
 
 
246 aa  260  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  51.85 
 
 
247 aa  259  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  52.48 
 
 
246 aa  259  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  52.67 
 
 
247 aa  251  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  51.03 
 
 
247 aa  250  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  50.62 
 
 
247 aa  251  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  50.62 
 
 
247 aa  249  4e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  49.79 
 
 
251 aa  247  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  52.74 
 
 
246 aa  246  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  52.67 
 
 
248 aa  246  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  50.62 
 
 
253 aa  246  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  52.72 
 
 
242 aa  245  4.9999999999999997e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  51.03 
 
 
247 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  48.56 
 
 
250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  49.37 
 
 
253 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  49.79 
 
 
253 aa  243  3e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  49.38 
 
 
250 aa  242  5e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  48.35 
 
 
249 aa  238  9e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  51.64 
 
 
250 aa  237  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  47.9 
 
 
248 aa  236  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15040  conserved hypothetical protein TIGR01033  47.33 
 
 
249 aa  234  7e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105495  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  51.64 
 
 
248 aa  234  8e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1779  hypothetical protein  46.91 
 
 
249 aa  234  9e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  50 
 
 
248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  49.15 
 
 
246 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  49.58 
 
 
247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0774  protein of unknown function DUF28  53.39 
 
 
238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  47.13 
 
 
243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  47.33 
 
 
248 aa  233  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2629  hypothetical protein  47.54 
 
 
251 aa  232  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1346  hypothetical protein  45.64 
 
 
248 aa  233  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404537  normal  0.548466 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  49.17 
 
 
248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1615  hypothetical protein  49.79 
 
 
249 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  48.95 
 
 
248 aa  231  6e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1792  hypothetical protein  46.09 
 
 
249 aa  231  8.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165315  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  49.38 
 
 
249 aa  231  8.000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17500  conserved hypothetical protein TIGR01033  46.09 
 
 
252 aa  230  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268105  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  47.33 
 
 
248 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  47.33 
 
 
248 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  47.33 
 
 
248 aa  231  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  47.3 
 
 
248 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0816  hypothetical protein  47.74 
 
 
243 aa  230  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.177048  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  47.68 
 
 
248 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  46.44 
 
 
249 aa  230  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1989  hypothetical protein  46.31 
 
 
252 aa  230  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0129309 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  47.3 
 
 
248 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1106  hypothetical protein  49.37 
 
 
252 aa  230  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0807  hypothetical protein  47.7 
 
 
251 aa  230  2e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  51.02 
 
 
249 aa  229  3e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  46.89 
 
 
248 aa  228  5e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4204  hypothetical protein  50.62 
 
 
248 aa  228  5e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300828  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  48.77 
 
 
247 aa  228  6e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  47.68 
 
 
248 aa  228  8e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2066  hypothetical protein  44.44 
 
 
250 aa  227  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2108  protein of unknown function DUF28  45.68 
 
 
249 aa  227  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00811013  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1214  hypothetical protein  50.21 
 
 
248 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.480804  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  47.72 
 
 
250 aa  227  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1243  hypothetical protein  50.21 
 
 
248 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362221  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  46.89 
 
 
242 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  48.15 
 
 
247 aa  226  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  47.92 
 
 
251 aa  226  2e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  48.56 
 
 
247 aa  226  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2117  protein of unknown function DUF28  44.96 
 
 
247 aa  226  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.892674  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  48.75 
 
 
251 aa  226  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  46.91 
 
 
248 aa  225  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2210  hypothetical protein  45.68 
 
 
247 aa  225  4e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  47.15 
 
 
247 aa  225  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  47.15 
 
 
246 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  47.15 
 
 
246 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  48.15 
 
 
248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  50.42 
 
 
248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  46.47 
 
 
248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  47.15 
 
 
246 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  47.33 
 
 
247 aa  225  5.0000000000000005e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  47.15 
 
 
246 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  46.86 
 
 
252 aa  224  8e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1249  hypothetical protein  46.67 
 
 
247 aa  224  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  47.15 
 
 
246 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  46.75 
 
 
246 aa  223  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  44.77 
 
 
249 aa  223  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  47.74 
 
 
250 aa  223  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  47.15 
 
 
246 aa  223  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3179  protein of unknown function DUF28  45.9 
 
 
250 aa  223  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  47.33 
 
 
247 aa  223  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  46.75 
 
 
246 aa  223  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  46.75 
 
 
246 aa  223  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0618  hypothetical protein  47.26 
 
 
239 aa  223  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.979417  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  47.15 
 
 
246 aa  223  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  47.15 
 
 
246 aa  223  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0825  protein of unknown function DUF28  45.19 
 
 
249 aa  223  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal  0.0381393 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  47.15 
 
 
246 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  47.74 
 
 
250 aa  223  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  47.15 
 
 
246 aa  223  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  46.75 
 
 
246 aa  223  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1249  hypothetical protein  46.25 
 
 
247 aa  222  4e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  48.1 
 
 
240 aa  221  6e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  49.37 
 
 
248 aa  221  7e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2033  hypothetical protein  46.5 
 
 
247 aa  221  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00594875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>