More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1276 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  499  1e-140  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0768  hypothetical protein  63.18 
 
 
240 aa  315  3e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0981887  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  61.18 
 
 
246 aa  311  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  61.6 
 
 
246 aa  310  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0552  hypothetical protein  63.16 
 
 
248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1461  hypothetical protein  59 
 
 
240 aa  293  2e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  53.81 
 
 
247 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  53.39 
 
 
247 aa  258  6e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  50.41 
 
 
246 aa  258  6e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  52.54 
 
 
247 aa  254  6e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  52.97 
 
 
247 aa  254  7e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  51.9 
 
 
247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  51.9 
 
 
248 aa  253  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  51.48 
 
 
242 aa  248  4e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  51.69 
 
 
247 aa  248  5e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  51.27 
 
 
247 aa  248  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  50.82 
 
 
250 aa  246  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  52.08 
 
 
248 aa  246  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  52.54 
 
 
248 aa  246  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  47.26 
 
 
242 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1615  hypothetical protein  50.85 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  50.21 
 
 
246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  50.61 
 
 
248 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  53.81 
 
 
248 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  52.34 
 
 
249 aa  239  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  51.49 
 
 
247 aa  239  4e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1106  hypothetical protein  52.12 
 
 
252 aa  239  4e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  46.86 
 
 
253 aa  238  5e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  50 
 
 
250 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  50 
 
 
250 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  49.8 
 
 
248 aa  237  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0816  hypothetical protein  47.95 
 
 
243 aa  237  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.177048  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  51.02 
 
 
247 aa  237  1e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  50.2 
 
 
248 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  49.8 
 
 
248 aa  236  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4204  hypothetical protein  51.84 
 
 
248 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300828  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  53.19 
 
 
248 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  49.39 
 
 
249 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  46.19 
 
 
243 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  50.21 
 
 
250 aa  234  6e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  48.56 
 
 
253 aa  234  7e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  48.97 
 
 
253 aa  234  7e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1013  hypothetical protein  50.42 
 
 
248 aa  234  9e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166545  hitchhiker  0.000108366 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  49.8 
 
 
248 aa  234  9e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1214  hypothetical protein  51.43 
 
 
248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.480804  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1243  hypothetical protein  51.43 
 
 
248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362221  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  49.79 
 
 
248 aa  233  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  51.24 
 
 
243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1210  protein of unknown function DUF28  47.13 
 
 
243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4362  hypothetical protein  52.7 
 
 
255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.144565 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  45.53 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0718  hypothetical protein  52.28 
 
 
255 aa  232  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  49.17 
 
 
250 aa  232  3e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  49.38 
 
 
240 aa  232  5e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  50.85 
 
 
248 aa  232  5e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  48.16 
 
 
248 aa  232  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  51.27 
 
 
248 aa  231  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  51.69 
 
 
245 aa  231  6e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2183  hypothetical protein  49.79 
 
 
250 aa  231  9e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  50.85 
 
 
248 aa  231  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  50.85 
 
 
248 aa  231  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  50.41 
 
 
249 aa  230  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1989  hypothetical protein  50.21 
 
 
252 aa  230  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0129309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  50.21 
 
 
249 aa  231  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  47.76 
 
 
248 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  47.76 
 
 
248 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  47.76 
 
 
248 aa  230  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  47.46 
 
 
249 aa  229  3e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  48.52 
 
 
248 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  48.97 
 
 
246 aa  229  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  49.16 
 
 
250 aa  229  4e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3179  protein of unknown function DUF28  49.37 
 
 
250 aa  228  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  47.76 
 
 
248 aa  228  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2729  hypothetical protein  51.49 
 
 
248 aa  228  5e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31246  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4171  hypothetical protein  51.69 
 
 
248 aa  228  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265987  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  48.52 
 
 
248 aa  228  5e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  48.52 
 
 
248 aa  228  5e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  49.17 
 
 
248 aa  228  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1228  hypothetical protein  49.37 
 
 
252 aa  228  7e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150429  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  49.59 
 
 
249 aa  228  7e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13930  conserved hypothetical protein TIGR01033  48.74 
 
 
254 aa  228  7e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0487372  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2507  hypothetical protein  51.94 
 
 
242 aa  228  8e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.153457  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  49.15 
 
 
246 aa  227  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2594  hypothetical protein  49.58 
 
 
252 aa  227  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000460429 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  48.52 
 
 
248 aa  227  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  49.37 
 
 
248 aa  227  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  48.75 
 
 
248 aa  227  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  49.37 
 
 
250 aa  227  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  49.57 
 
 
246 aa  227  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2570  hypothetical protein  49.58 
 
 
251 aa  227  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6116  hypothetical protein  49.37 
 
 
250 aa  227  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal  0.165467 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  51.69 
 
 
247 aa  226  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  49.58 
 
 
252 aa  226  2e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  48.1 
 
 
248 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  50 
 
 
248 aa  227  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0925  protein of unknown function DUF28  48.99 
 
 
250 aa  226  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.488101  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  48.1 
 
 
251 aa  226  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15040  conserved hypothetical protein TIGR01033  48.32 
 
 
249 aa  226  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105495  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  48.52 
 
 
249 aa  226  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1368  hypothetical protein  46.84 
 
 
251 aa  226  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.251758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>