More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0371 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  66.67 
 
 
247 aa  331  7.000000000000001e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  63.93 
 
 
249 aa  329  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  66.67 
 
 
247 aa  329  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  64.73 
 
 
247 aa  327  8e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  64.32 
 
 
247 aa  327  8e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  65.83 
 
 
247 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  65.15 
 
 
247 aa  324  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  65 
 
 
247 aa  322  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  56.38 
 
 
250 aa  297  1e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  56.15 
 
 
250 aa  296  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  58.58 
 
 
248 aa  292  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  54.73 
 
 
250 aa  289  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  52.42 
 
 
250 aa  288  4e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  54.47 
 
 
250 aa  288  8e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  53.91 
 
 
250 aa  287  1e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  53.31 
 
 
250 aa  285  4e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  52.67 
 
 
250 aa  282  3.0000000000000004e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  55.06 
 
 
251 aa  281  9e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  53.88 
 
 
249 aa  280  1e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  55.6 
 
 
248 aa  280  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  53.23 
 
 
253 aa  280  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  57.2 
 
 
247 aa  278  5e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  56.97 
 
 
248 aa  278  6e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  53.78 
 
 
243 aa  277  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  53.94 
 
 
247 aa  276  2e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  55.04 
 
 
242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  56.56 
 
 
243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  54.88 
 
 
247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  55.33 
 
 
248 aa  269  2e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  52.05 
 
 
250 aa  269  2e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  54.77 
 
 
250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  55.92 
 
 
245 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  54.77 
 
 
250 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0496  hypothetical protein  54.55 
 
 
250 aa  268  5e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.813063  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  50.41 
 
 
253 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  53.72 
 
 
250 aa  267  1e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  50 
 
 
253 aa  266  2e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1615  hypothetical protein  54.92 
 
 
249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  52.87 
 
 
248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  54.58 
 
 
240 aa  265  4e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  51.64 
 
 
246 aa  265  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  52.63 
 
 
248 aa  264  8.999999999999999e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  51.23 
 
 
246 aa  263  2e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  51.23 
 
 
246 aa  263  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  51.23 
 
 
246 aa  263  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  51.23 
 
 
246 aa  263  2e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  51.23 
 
 
246 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0618  hypothetical protein  53.75 
 
 
239 aa  263  2e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.979417  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  51.23 
 
 
246 aa  263  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  51.23 
 
 
246 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  51.23 
 
 
246 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  51.23 
 
 
246 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  51.23 
 
 
246 aa  263  2e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  50.82 
 
 
246 aa  262  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  53.69 
 
 
248 aa  262  3e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  50.82 
 
 
246 aa  262  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  52.48 
 
 
246 aa  263  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  50.41 
 
 
246 aa  262  4e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  53.69 
 
 
248 aa  261  6e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  53.69 
 
 
248 aa  261  6e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  52.72 
 
 
246 aa  261  8e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  53.28 
 
 
248 aa  260  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  55.14 
 
 
247 aa  260  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  52.23 
 
 
246 aa  259  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  52.46 
 
 
248 aa  260  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0508  hypothetical protein  51.23 
 
 
246 aa  259  2e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  51.43 
 
 
249 aa  259  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1346  hypothetical protein  49.59 
 
 
248 aa  258  4e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404537  normal  0.548466 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1249  hypothetical protein  50.81 
 
 
247 aa  258  5.0000000000000005e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  52.87 
 
 
248 aa  258  6e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  51.22 
 
 
248 aa  258  6e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  50.81 
 
 
247 aa  258  7e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  52.23 
 
 
248 aa  258  7e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  52.23 
 
 
248 aa  258  7e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  52.23 
 
 
248 aa  258  7e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0807  hypothetical protein  55.06 
 
 
251 aa  258  8e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  52.23 
 
 
248 aa  257  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1249  hypothetical protein  50.81 
 
 
247 aa  257  1e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3853  protein of unknown function DUF28  53.33 
 
 
241 aa  257  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3179  protein of unknown function DUF28  52.42 
 
 
250 aa  257  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  51.01 
 
 
251 aa  257  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  52.23 
 
 
246 aa  256  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1151  hypothetical protein  49.59 
 
 
250 aa  256  3e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  50.41 
 
 
251 aa  255  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  50.82 
 
 
247 aa  255  5e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  50.82 
 
 
247 aa  255  5e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  49.59 
 
 
247 aa  254  7e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0422  hypothetical protein  52.87 
 
 
244 aa  254  7e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0951689  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1752  hypothetical protein  52.87 
 
 
244 aa  254  7e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000585673  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2432  hypothetical protein  50.82 
 
 
246 aa  254  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2355  hypothetical protein  54.55 
 
 
241 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.377653 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2237  hypothetical protein  54.25 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2399  protein of unknown function DUF28  49.17 
 
 
248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42546  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1703  hypothetical protein  52.92 
 
 
239 aa  252  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24862  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  54.92 
 
 
250 aa  252  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1898  hypothetical protein  52.92 
 
 
239 aa  252  3e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484547  normal  0.228214 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  50.41 
 
 
249 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  49.59 
 
 
247 aa  251  5.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2570  hypothetical protein  50.61 
 
 
251 aa  251  6e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>