More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0479 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  100 
 
 
250 aa  517  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  61.29 
 
 
247 aa  319  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  59.68 
 
 
247 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  62.04 
 
 
248 aa  310  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  57.66 
 
 
247 aa  308  4e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  57.66 
 
 
247 aa  304  7e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  60 
 
 
250 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  60 
 
 
250 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  58.06 
 
 
247 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  56.85 
 
 
247 aa  301  7.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  58.23 
 
 
248 aa  300  1e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  59.04 
 
 
248 aa  299  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  56.45 
 
 
247 aa  300  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  62.04 
 
 
243 aa  299  3e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  58.68 
 
 
247 aa  298  4e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  56.57 
 
 
250 aa  296  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  55.2 
 
 
249 aa  294  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3853  protein of unknown function DUF28  61.16 
 
 
241 aa  293  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  56.63 
 
 
248 aa  292  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  54.47 
 
 
246 aa  288  8e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  60.17 
 
 
240 aa  287  9e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  53.01 
 
 
249 aa  287  1e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  56.97 
 
 
250 aa  286  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  57.83 
 
 
248 aa  284  7e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  56.22 
 
 
248 aa  284  8e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0618  hypothetical protein  60.08 
 
 
239 aa  282  3.0000000000000004e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.979417  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2355  hypothetical protein  61.44 
 
 
241 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.377653 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2237  hypothetical protein  58.96 
 
 
249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  56.22 
 
 
248 aa  282  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  55.82 
 
 
247 aa  280  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1703  hypothetical protein  57.68 
 
 
239 aa  275  5e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24862  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1898  hypothetical protein  57.68 
 
 
239 aa  275  5e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484547  normal  0.228214 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  55.42 
 
 
248 aa  275  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  58.8 
 
 
249 aa  275  6e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  53.6 
 
 
250 aa  275  7e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  52.8 
 
 
251 aa  275  7e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1615  hypothetical protein  56 
 
 
249 aa  274  8e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  55.02 
 
 
248 aa  274  9e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  55.02 
 
 
248 aa  274  9e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  55.02 
 
 
248 aa  274  9e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  55.02 
 
 
248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  55.82 
 
 
248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  57.03 
 
 
248 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  56.85 
 
 
239 aa  274  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  55.42 
 
 
248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  56.45 
 
 
247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  54.62 
 
 
248 aa  271  6e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4067  hypothetical protein  56.79 
 
 
241 aa  271  7e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.751245  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  56.22 
 
 
248 aa  270  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  51.59 
 
 
253 aa  270  1e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3203  hypothetical protein  58.4 
 
 
239 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258342  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  52.61 
 
 
247 aa  268  5.9999999999999995e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  56.45 
 
 
247 aa  268  7e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2432  hypothetical protein  55.02 
 
 
246 aa  268  7e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2183  hypothetical protein  52.21 
 
 
250 aa  267  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2018  protein of unknown function DUF28  55.92 
 
 
245 aa  267  1e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.687235  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  53.01 
 
 
248 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1845  hypothetical protein  53.2 
 
 
249 aa  266  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00676371  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4204  hypothetical protein  57.03 
 
 
248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300828  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  53.01 
 
 
248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  53.01 
 
 
248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  52.61 
 
 
247 aa  265  5e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  53.01 
 
 
248 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2325  hypothetical protein  53.88 
 
 
248 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.667141  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1243  hypothetical protein  56.63 
 
 
248 aa  264  8e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362221  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1214  hypothetical protein  56.63 
 
 
248 aa  264  8e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.480804  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2190  hypothetical protein  60.92 
 
 
241 aa  264  8e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1249  hypothetical protein  50.6 
 
 
247 aa  264  8e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2683  hypothetical protein  59.26 
 
 
241 aa  264  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0166157  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  53.01 
 
 
248 aa  264  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1752  hypothetical protein  54.47 
 
 
244 aa  263  1e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000585673  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  53.01 
 
 
248 aa  264  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0422  hypothetical protein  54.47 
 
 
244 aa  263  1e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0951689  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  52.46 
 
 
246 aa  263  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1988  hypothetical protein  59.66 
 
 
241 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325279  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  53.06 
 
 
246 aa  263  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2388  hypothetical protein  59.66 
 
 
241 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1249  hypothetical protein  50.2 
 
 
247 aa  262  4e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1953  hypothetical protein  55.88 
 
 
241 aa  262  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0984  hypothetical protein  59.84 
 
 
242 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.182655  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  51.81 
 
 
247 aa  261  4.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  50.82 
 
 
243 aa  261  6e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  51.81 
 
 
247 aa  261  6.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  52.61 
 
 
248 aa  261  6.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  51.41 
 
 
247 aa  260  1e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2522  hypothetical protein  60.5 
 
 
241 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  53.41 
 
 
246 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1151  hypothetical protein  47.2 
 
 
250 aa  261  1e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  53.41 
 
 
246 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  53.41 
 
 
246 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  53.41 
 
 
246 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  53.66 
 
 
245 aa  260  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1301  hypothetical protein  58.61 
 
 
242 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17975  normal  0.117692 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3259  hypothetical protein  58.61 
 
 
242 aa  259  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1728  hypothetical protein  56.38 
 
 
241 aa  259  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.359816 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2210  hypothetical protein  59.84 
 
 
242 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.495132  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1015  hypothetical protein  60.5 
 
 
242 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  53.01 
 
 
246 aa  258  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  52.61 
 
 
246 aa  258  6e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  52.61 
 
 
246 aa  258  6e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>