More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0985 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  509  1e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1106  hypothetical protein  80.16 
 
 
252 aa  419  1e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  76.68 
 
 
253 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  75.89 
 
 
253 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0807  hypothetical protein  64.14 
 
 
251 aa  324  1e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  55.42 
 
 
247 aa  291  8e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1615  hypothetical protein  58.47 
 
 
249 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  55.02 
 
 
247 aa  285  4e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  54.22 
 
 
247 aa  281  6.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  56.05 
 
 
250 aa  280  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  53.82 
 
 
247 aa  281  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  53.82 
 
 
247 aa  280  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  55.6 
 
 
248 aa  279  4e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  52.21 
 
 
247 aa  276  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  51.81 
 
 
247 aa  275  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  53.66 
 
 
246 aa  275  5e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  54.3 
 
 
251 aa  275  7e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  55.2 
 
 
250 aa  273  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  55.2 
 
 
250 aa  273  1.0000000000000001e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  53.39 
 
 
253 aa  271  5.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  55.24 
 
 
249 aa  271  7e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2399  protein of unknown function DUF28  53.63 
 
 
248 aa  262  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42546  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  50.2 
 
 
250 aa  257  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  48.97 
 
 
243 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  51.41 
 
 
249 aa  256  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  52.8 
 
 
247 aa  256  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  52.5 
 
 
246 aa  255  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1634  protein of unknown function DUF28  52.78 
 
 
252 aa  254  6e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  51.18 
 
 
248 aa  254  9e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  52.57 
 
 
248 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  50.2 
 
 
250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  50.83 
 
 
242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  50.2 
 
 
250 aa  253  3e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  53.23 
 
 
247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  51.25 
 
 
246 aa  251  7e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  50 
 
 
246 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  50.59 
 
 
248 aa  250  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0661  hypothetical protein  50.6 
 
 
248 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135239  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  50.59 
 
 
248 aa  249  2e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  51.45 
 
 
250 aa  249  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  50.2 
 
 
248 aa  249  3e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  51.67 
 
 
247 aa  246  2e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  49.61 
 
 
248 aa  246  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  51.81 
 
 
248 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2183  hypothetical protein  50.2 
 
 
250 aa  246  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  50.59 
 
 
251 aa  246  4e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  50.4 
 
 
250 aa  245  4.9999999999999997e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  48.59 
 
 
250 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  50.78 
 
 
250 aa  245  4.9999999999999997e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  49.4 
 
 
248 aa  245  6e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  49.2 
 
 
250 aa  244  6.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  49.2 
 
 
250 aa  244  6.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  48.37 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1219  protein of unknown function DUF28  50 
 
 
250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  51 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2117  protein of unknown function DUF28  51.46 
 
 
247 aa  243  3e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.892674  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  51.85 
 
 
240 aa  243  3e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  50.59 
 
 
250 aa  243  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  49 
 
 
248 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  49 
 
 
248 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  49 
 
 
248 aa  243  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  51.76 
 
 
248 aa  242  5e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0816  hypothetical protein  48.56 
 
 
243 aa  241  7.999999999999999e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.177048  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  52.08 
 
 
245 aa  240  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  52.21 
 
 
249 aa  241  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  51.78 
 
 
247 aa  239  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  48.77 
 
 
246 aa  238  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  48.77 
 
 
246 aa  238  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  48.77 
 
 
246 aa  238  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  48.77 
 
 
246 aa  238  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  48.22 
 
 
248 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  47.95 
 
 
246 aa  236  3e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  47.83 
 
 
248 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  47.95 
 
 
246 aa  236  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  47.98 
 
 
246 aa  236  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  48.36 
 
 
246 aa  236  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  47.95 
 
 
246 aa  236  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  47.95 
 
 
246 aa  236  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  47.95 
 
 
246 aa  236  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  47.95 
 
 
246 aa  236  3e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0025  hypothetical protein  51.05 
 
 
243 aa  236  3e-61  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3179  protein of unknown function DUF28  47.39 
 
 
250 aa  236  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2325  hypothetical protein  47.43 
 
 
248 aa  235  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.667141  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  47.43 
 
 
246 aa  235  4e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  47.54 
 
 
246 aa  235  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  47.83 
 
 
248 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  47.54 
 
 
246 aa  235  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  48.24 
 
 
248 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2424  hypothetical protein  49.19 
 
 
247 aa  235  6e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.079823  normal  0.460299 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2033  hypothetical protein  49.19 
 
 
247 aa  235  6e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00594875  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1845  hypothetical protein  50.2 
 
 
249 aa  234  8e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00676371  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2146  hypothetical protein  49.19 
 
 
247 aa  234  9e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2432  hypothetical protein  48.36 
 
 
246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1013  hypothetical protein  48.62 
 
 
248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166545  hitchhiker  0.000108366 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  47.79 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  49.2 
 
 
249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  49.17 
 
 
239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1703  hypothetical protein  51.02 
 
 
239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24862  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1898  hypothetical protein  51.02 
 
 
239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484547  normal  0.228214 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  48.22 
 
 
248 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>