More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4171 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4171  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265987  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  95.56 
 
 		 248 aa  486  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1287  hypothetical protein  93.55 
 
 		 248 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  88.31 
 
 		 248 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2729  hypothetical protein  86.69 
 
 		 248 aa  449  1e-125  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3525  hypothetical protein  86.29 
 
 		 248 aa  447  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6910  hypothetical protein  85.48 
 
 		 248 aa  424  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311344 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2305  hypothetical protein  76.02 
 
 		 248 aa  385  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119494 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7401  hypothetical protein  75.2 
 
 		 248 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372247  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6579  hypothetical protein  74.39 
 
 		 248 aa  364  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3062  hypothetical protein  77.24 
 
 		 249 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0345  hypothetical protein  75.2 
 
 		 248 aa  365  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0946  hypothetical protein  73.58 
 
 		 248 aa  359  2e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.596094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0982  hypothetical protein  73.58 
 
 		 264 aa  358  3e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.501161 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3553  hypothetical protein  73.58 
 
 		 248 aa  358  4e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2114  hypothetical protein  67.21 
 
 		 248 aa  358  6e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.308852  normal  0.355584 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0922  hypothetical protein  73.58 
 
 		 248 aa  352  5e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  65.59 
 
 		 248 aa  338  5.9999999999999996e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  65.59 
 
 		 248 aa  336  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  65.59 
 
 		 248 aa  332  3e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  65.59 
 
 		 249 aa  332  3e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  65.59 
 
 		 248 aa  332  3e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0163  hypothetical protein  64.37 
 
 		 248 aa  329  2e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  64.78 
 
 		 248 aa  328  7e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3509  hypothetical protein  63.16 
 
 		 248 aa  323  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.208978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  63.16 
 
 		 248 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1219  hypothetical protein  61.29 
 
 		 249 aa  313  1.9999999999999998e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.854834 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  61.38 
 
 		 248 aa  310  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  61.38 
 
 		 246 aa  310  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  61.38 
 
 		 248 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  60.98 
 
 		 246 aa  309  2.9999999999999997e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  61.38 
 
 		 248 aa  308  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2907  hypothetical protein  63.31 
 
 		 253 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0337  hypothetical protein  60.32 
 
 		 248 aa  302  3.0000000000000004e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3380  hypothetical protein  57.48 
 
 		 255 aa  300  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2762  hypothetical protein  60.57 
 
 		 246 aa  300  2e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0792169 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2142  hypothetical protein  60.16 
 
 		 247 aa  296  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2433  hypothetical protein  55.56 
 
 		 253 aa  288  7e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1086  hypothetical protein  60.32 
 
 		 249 aa  287  9e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0419  hypothetical protein  54.15 
 
 		 254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.26819  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0780  hypothetical protein  59.2 
 
 		 251 aa  275  5e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0981369  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  52.63 
 
 		 247 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  49 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0484  hypothetical protein  53.66 
 
 		 246 aa  256  2e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  50 
 
 		 248 aa  251  1e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  51.82 
 
 		 247 aa  250  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  51.85 
 
 		 247 aa  250  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  49.39 
 
 		 247 aa  249  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  49.39 
 
 		 247 aa  249  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  52.23 
 
 		 247 aa  249  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  51.42 
 
 		 247 aa  249  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  52.42 
 
 		 247 aa  247  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  49.8 
 
 		 249 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  50.2 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  51 
 
 		 248 aa  238  6.999999999999999e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  48.97 
 
 		 246 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  47.18 
 
 		 250 aa  237  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2775  hypothetical protein  49.6 
 
 		 255 aa  237  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  49.8 
 
 		 250 aa  236  3e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  49.6 
 
 		 248 aa  234  8e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  50 
 
 		 247 aa  233  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  48.39 
 
 		 248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  50 
 
 		 247 aa  231  7.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  53.2 
 
 		 247 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  49.59 
 
 		 247 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  48.39 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  48.79 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  50.41 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2325  hypothetical protein  48.8 
 
 		 248 aa  229  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.667141  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  47.01 
 
 		 251 aa  230  2e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  48.79 
 
 		 247 aa  229  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  47.58 
 
 		 248 aa  229  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  48.4 
 
 		 249 aa  229  4e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  47.98 
 
 		 249 aa  229  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  48.35 
 
 		 250 aa  228  5e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  51.69 
 
 		 243 aa  228  5e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  48.79 
 
 		 248 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2424  hypothetical protein  48.8 
 
 		 247 aa  228  6e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.079823  normal  0.460299 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2033  hypothetical protein  48.8 
 
 		 247 aa  228  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00594875  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  48.16 
 
 		 247 aa  228  9e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  48.39 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  45.82 
 
 		 253 aa  227  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2146  hypothetical protein  48.4 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  48.76 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  49.6 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2554  protein of unknown function DUF28  47.39 
 
 		 248 aa  225  6e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113083  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0704  hypothetical protein  47.76 
 
 		 248 aa  224  8e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  47.18 
 
 		 248 aa  224  8e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0351  hypothetical protein  47.35 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  46.99 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  49.4 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  49.4 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  47.98 
 
 		 248 aa  223  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2028  hypothetical protein  48.21 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2054  hypothetical protein  48.21 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  45.97 
 
 		 248 aa  222  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  45.75 
 
 		 250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  50 
 
 		 245 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  45.75 
 
 		 250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  46.37 
 
 		 247 aa  221  7e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>