More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2762 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2762  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  506  9.999999999999999e-143  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0792169 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  88.62 
 
 		 246 aa  456  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3380  hypothetical protein  84.19 
 
 		 255 aa  441  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  79.27 
 
 		 246 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  75.61 
 
 		 248 aa  388  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  75.2 
 
 		 248 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  75.61 
 
 		 248 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  69.51 
 
 		 248 aa  359  2e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  69.51 
 
 		 248 aa  359  2e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  68.29 
 
 		 249 aa  355  5e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  68.29 
 
 		 248 aa  353  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  67.89 
 
 		 248 aa  351  8e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  67.07 
 
 		 248 aa  348  5e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0163  hypothetical protein  67.07 
 
 		 248 aa  347  1e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  66.26 
 
 		 248 aa  340  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3509  hypothetical protein  64.63 
 
 		 248 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.208978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  61.79 
 
 		 248 aa  322  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2114  hypothetical protein  59.35 
 
 		 248 aa  315  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.308852  normal  0.355584 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2433  hypothetical protein  60.71 
 
 		 253 aa  313  9.999999999999999e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  59.76 
 
 		 248 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4171  hypothetical protein  60.57 
 
 		 248 aa  312  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265987  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0337  hypothetical protein  64.37 
 
 		 248 aa  311  4.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0419  hypothetical protein  60.47 
 
 		 254 aa  311  6.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.26819  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1287  hypothetical protein  62.6 
 
 		 248 aa  311  9e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2729  hypothetical protein  58.94 
 
 		 248 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6579  hypothetical protein  62.2 
 
 		 248 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7401  hypothetical protein  62.2 
 
 		 248 aa  305  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372247  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6910  hypothetical protein  60.98 
 
 		 248 aa  303  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3062  hypothetical protein  64.23 
 
 		 249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3525  hypothetical protein  58.13 
 
 		 248 aa  301  6.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2305  hypothetical protein  58.13 
 
 		 248 aa  301  9e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119494 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3553  hypothetical protein  58.54 
 
 		 248 aa  293  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0946  hypothetical protein  57.32 
 
 		 248 aa  289  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.596094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0982  hypothetical protein  57.32 
 
 		 264 aa  288  4e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.501161 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2907  hypothetical protein  59.51 
 
 		 253 aa  288  6e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1086  hypothetical protein  59.11 
 
 		 249 aa  288  8e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0922  hypothetical protein  58.94 
 
 		 248 aa  281  9e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1219  hypothetical protein  55.87 
 
 		 249 aa  279  3e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.854834 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0345  hypothetical protein  55.69 
 
 		 248 aa  277  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0780  hypothetical protein  60 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0981369  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2142  hypothetical protein  60.98 
 
 		 247 aa  275  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  54.3 
 
 		 250 aa  263  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  54.03 
 
 		 248 aa  259  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  52.82 
 
 		 248 aa  257  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  52.82 
 
 		 248 aa  257  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  54.22 
 
 		 249 aa  255  4e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  53.63 
 
 		 248 aa  252  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  51.61 
 
 		 248 aa  251  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  53.23 
 
 		 248 aa  251  7e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  49.8 
 
 		 247 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  52.02 
 
 		 248 aa  250  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  51.61 
 
 		 248 aa  249  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  49.8 
 
 		 247 aa  250  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  53.04 
 
 		 247 aa  249  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  52.82 
 
 		 251 aa  248  5e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  51.61 
 
 		 248 aa  248  9e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  48.79 
 
 		 250 aa  248  9e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  53.11 
 
 		 247 aa  247  1e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0938  hypothetical protein  50 
 
 		 249 aa  247  1e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.879867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  52.02 
 
 		 248 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  53.04 
 
 		 248 aa  246  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4204  hypothetical protein  52.02 
 
 		 248 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  53.04 
 
 		 250 aa  247  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1214  hypothetical protein  52.02 
 
 		 248 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.480804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1243  hypothetical protein  52.02 
 
 		 248 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  52.21 
 
 		 249 aa  246  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  52.42 
 
 		 247 aa  245  4e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1479  hypothetical protein  49.6 
 
 		 249 aa  245  4e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  51.61 
 
 		 248 aa  244  6e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  52.42 
 
 		 248 aa  244  8e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  51.61 
 
 		 248 aa  244  8e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  50 
 
 		 251 aa  244  9e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2554  protein of unknown function DUF28  51.01 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113083  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  52.42 
 
 		 247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  51.21 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  52.89 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  52.02 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  52.02 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  52.02 
 
 		 248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  51.21 
 
 		 248 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  50.4 
 
 		 253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  51.21 
 
 		 248 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  50.61 
 
 		 247 aa  242  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  50.4 
 
 		 246 aa  241  6e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  50.4 
 
 		 246 aa  241  6e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  50 
 
 		 246 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  50 
 
 		 246 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  50 
 
 		 246 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  50 
 
 		 246 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  50 
 
 		 246 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  50 
 
 		 246 aa  241  7.999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  50 
 
 		 246 aa  241  7.999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  52.89 
 
 		 246 aa  241  9e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  51.42 
 
 		 247 aa  240  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17500  conserved hypothetical protein TIGR01033  50.81 
 
 		 252 aa  240  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.268105  normal  0.267307 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  50 
 
 		 246 aa  240  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  50 
 
 		 246 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  50 
 
 		 246 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  50 
 
 		 246 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  50 
 
 		 246 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>