More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0655 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  99.6 
 
 		 248 aa  507  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  98.39 
 
 		 248 aa  504  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  86.18 
 
 		 246 aa  436  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3380  hypothetical protein  73.91 
 
 		 255 aa  385  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  74.8 
 
 		 246 aa  385  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2762  hypothetical protein  75.2 
 
 		 246 aa  365  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0792169 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  71.77 
 
 		 248 aa  360  1e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  67.74 
 
 		 248 aa  347  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  69.35 
 
 		 248 aa  346  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3509  hypothetical protein  68.15 
 
 		 248 aa  343  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.208978 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  66.94 
 
 		 249 aa  339  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  65.32 
 
 		 248 aa  337  9.999999999999999e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  65.32 
 
 		 248 aa  337  9.999999999999999e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0163  hypothetical protein  64.52 
 
 		 248 aa  333  2e-90  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  64.52 
 
 		 248 aa  331  8e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  61.79 
 
 		 248 aa  314  9e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2729  hypothetical protein  61.38 
 
 		 248 aa  312  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4171  hypothetical protein  61.38 
 
 		 248 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265987  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0337  hypothetical protein  63.97 
 
 		 248 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  60.16 
 
 		 248 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3525  hypothetical protein  60.16 
 
 		 248 aa  305  6e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0419  hypothetical protein  61.26 
 
 		 254 aa  304  8.000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.26819  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2114  hypothetical protein  58.06 
 
 		 248 aa  301  5.000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.308852  normal  0.355584 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2305  hypothetical protein  58.06 
 
 		 248 aa  300  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6910  hypothetical protein  61.79 
 
 		 248 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311344 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1287  hypothetical protein  61.79 
 
 		 248 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7401  hypothetical protein  61.38 
 
 		 248 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372247  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3062  hypothetical protein  62.1 
 
 		 249 aa  291  6e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2433  hypothetical protein  58.5 
 
 		 253 aa  290  2e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0946  hypothetical protein  60.08 
 
 		 248 aa  289  3e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.596094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0982  hypothetical protein  60.08 
 
 		 264 aa  288  4e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.501161 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1219  hypothetical protein  55.82 
 
 		 249 aa  288  6e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.854834 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3553  hypothetical protein  59.68 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2907  hypothetical protein  59.44 
 
 		 253 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6579  hypothetical protein  58.94 
 
 		 248 aa  284  8e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2142  hypothetical protein  61.38 
 
 		 247 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0345  hypothetical protein  57.32 
 
 		 248 aa  275  6e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0780  hypothetical protein  59.6 
 
 		 251 aa  274  9e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0981369  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0922  hypothetical protein  59.27 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1086  hypothetical protein  56.22 
 
 		 249 aa  263  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  52.59 
 
 		 250 aa  248  4e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  51.21 
 
 		 248 aa  248  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  52.02 
 
 		 248 aa  245  4e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  51.61 
 
 		 248 aa  245  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  52.61 
 
 		 249 aa  244  6.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  50.2 
 
 		 248 aa  242  3.9999999999999997e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  50.4 
 
 		 249 aa  240  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  46.8 
 
 		 250 aa  239  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  51.04 
 
 		 247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  49.19 
 
 		 248 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  50.6 
 
 		 248 aa  238  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  48.79 
 
 		 248 aa  237  1e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  51.01 
 
 		 247 aa  236  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  49.8 
 
 		 248 aa  235  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  48.61 
 
 		 251 aa  235  4e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  50.2 
 
 		 247 aa  236  4e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  47.77 
 
 		 247 aa  234  7e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  47.77 
 
 		 247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0938  hypothetical protein  47.39 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.879867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  48.39 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1479  hypothetical protein  47.39 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  53.09 
 
 		 245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  51.63 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  48.39 
 
 		 248 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  48.79 
 
 		 248 aa  233  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  52.23 
 
 		 247 aa  233  3e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  48.39 
 
 		 248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2554  protein of unknown function DUF28  48.58 
 
 		 248 aa  232  5e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113083  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  50.2 
 
 		 248 aa  232  5e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3853  protein of unknown function DUF28  52.56 
 
 		 241 aa  231  7.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  47.79 
 
 		 250 aa  231  8.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  47.79 
 
 		 250 aa  231  8.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  47.98 
 
 		 248 aa  231  9e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  48.39 
 
 		 248 aa  229  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  51.25 
 
 		 246 aa  229  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  50.2 
 
 		 247 aa  229  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  54.62 
 
 		 247 aa  229  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1013  hypothetical protein  47.18 
 
 		 248 aa  229  4e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166545  hitchhiker  0.000108366 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  48.58 
 
 		 247 aa  228  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0484  hypothetical protein  50.83 
 
 		 246 aa  228  7e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  48.59 
 
 		 247 aa  228  7e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  50 
 
 		 243 aa  227  1e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  48.59 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  50.42 
 
 		 246 aa  227  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  47.58 
 
 		 249 aa  226  2e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  46.99 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  47.98 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  47.98 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  47.98 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  46.99 
 
 		 248 aa  225  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  49.57 
 
 		 243 aa  225  5.0000000000000005e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  47.6 
 
 		 253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  49.19 
 
 		 247 aa  224  7e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2325  hypothetical protein  51 
 
 		 248 aa  224  7e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.667141  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  47.98 
 
 		 246 aa  224  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  47.98 
 
 		 246 aa  224  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  47.98 
 
 		 246 aa  224  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  47.98 
 
 		 246 aa  224  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  47.98 
 
 		 246 aa  224  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>