More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2114 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2114  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  511  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.308852  normal  0.355584 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  69.23 
 
 		 248 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2729  hypothetical protein  67.89 
 
 		 248 aa  362  2e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3525  hypothetical protein  66.67 
 
 		 248 aa  360  1e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  67.48 
 
 		 248 aa  358  4e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4171  hypothetical protein  67.21 
 
 		 248 aa  358  6e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265987  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1287  hypothetical protein  69.64 
 
 		 248 aa  355  5e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2305  hypothetical protein  66.94 
 
 		 248 aa  349  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6910  hypothetical protein  67.89 
 
 		 248 aa  347  9e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311344 
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  65.32 
 
 		 248 aa  341  5.999999999999999e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  65.32 
 
 		 248 aa  341  5.999999999999999e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  64.52 
 
 		 248 aa  337  9.999999999999999e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0345  hypothetical protein  67.48 
 
 		 248 aa  336  2.9999999999999997e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  61.29 
 
 		 248 aa  331  6e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  62.1 
 
 		 249 aa  330  1e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3062  hypothetical protein  68.95 
 
 		 249 aa  330  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  61.29 
 
 		 248 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  61.29 
 
 		 248 aa  324  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3553  hypothetical protein  64.52 
 
 		 248 aa  323  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6579  hypothetical protein  64.63 
 
 		 248 aa  321  6e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3509  hypothetical protein  60.89 
 
 		 248 aa  321  9.000000000000001e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.208978 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0946  hypothetical protein  64.11 
 
 		 248 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.596094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0982  hypothetical protein  64.11 
 
 		 264 aa  317  9e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.501161 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1219  hypothetical protein  58.63 
 
 		 249 aa  317  1e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.854834 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7401  hypothetical protein  63.82 
 
 		 248 aa  317  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372247  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0337  hypothetical protein  59.92 
 
 		 248 aa  314  7e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2907  hypothetical protein  62.65 
 
 		 253 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0163  hypothetical protein  58.87 
 
 		 248 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0922  hypothetical protein  65.32 
 
 		 248 aa  311  4.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0419  hypothetical protein  57.31 
 
 		 254 aa  311  6.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.26819  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  56.5 
 
 		 246 aa  304  8.000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  58.06 
 
 		 248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  58.06 
 
 		 248 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  58.06 
 
 		 248 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2762  hypothetical protein  59.35 
 
 		 246 aa  297  9e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0792169 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3380  hypothetical protein  53.94 
 
 		 255 aa  294  7e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  56.91 
 
 		 246 aa  291  6e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2142  hypothetical protein  59.35 
 
 		 247 aa  290  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1086  hypothetical protein  57.83 
 
 		 249 aa  289  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2433  hypothetical protein  55.16 
 
 		 253 aa  287  9e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0780  hypothetical protein  56.18 
 
 		 251 aa  268  4e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0981369  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  52.23 
 
 		 247 aa  260  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  52.23 
 
 		 247 aa  259  4e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  53.04 
 
 		 247 aa  255  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0484  hypothetical protein  52.44 
 
 		 246 aa  255  5e-67  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  52.23 
 
 		 247 aa  254  6e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  50 
 
 		 250 aa  254  6e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  52.63 
 
 		 247 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  52.63 
 
 		 247 aa  252  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  50 
 
 		 248 aa  244  6.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  50.2 
 
 		 247 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  47.18 
 
 		 249 aa  242  3e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  50.2 
 
 		 246 aa  242  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  52.48 
 
 		 246 aa  241  6e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  48.97 
 
 		 247 aa  241  7e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  48.59 
 
 		 251 aa  241  7e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  50.81 
 
 		 250 aa  241  9e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  50.41 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  49.8 
 
 		 248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  46.59 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  46.59 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  48.39 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  45.78 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  48.39 
 
 		 253 aa  231  6e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1106  hypothetical protein  47.2 
 
 		 252 aa  231  8.000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1151  hypothetical protein  45.38 
 
 		 250 aa  231  1e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  46.22 
 
 		 253 aa  229  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0661  hypothetical protein  50.79 
 
 		 248 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.135239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  45.34 
 
 		 246 aa  228  7e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2554  protein of unknown function DUF28  47.18 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113083  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  45.97 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0704  hypothetical protein  46.94 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  46.37 
 
 		 248 aa  225  4e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0807  hypothetical protein  46 
 
 		 251 aa  225  5.0000000000000005e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0351  hypothetical protein  46.53 
 
 		 248 aa  225  7e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  46.59 
 
 		 249 aa  224  9e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  46.99 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  46 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2066  hypothetical protein  43.37 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1615  hypothetical protein  46.99 
 
 		 249 aa  223  3e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  42 
 
 		 250 aa  221  8e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1634  protein of unknown function DUF28  48.8 
 
 		 252 aa  221  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  45.23 
 
 		 243 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  47.3 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  47.08 
 
 		 242 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  46.81 
 
 		 243 aa  219  3e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1346  hypothetical protein  41.53 
 
 		 248 aa  219  3e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404537  normal  0.548466 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  44.35 
 
 		 248 aa  218  6e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  45.38 
 
 		 250 aa  218  7e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2325  hypothetical protein  46.77 
 
 		 248 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.667141  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  44.98 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  46.77 
 
 		 248 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  44.49 
 
 		 249 aa  216  2e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  44.76 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  46.8 
 
 		 248 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  44.98 
 
 		 250 aa  216  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  44.35 
 
 		 247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  46.8 
 
 		 248 aa  215  5e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  44.14 
 
 		 250 aa  215  5e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2183  hypothetical protein  44.58 
 
 		 250 aa  215  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>