More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1086 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1086  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  507  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  62.25 
 
 		 248 aa  319  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0337  hypothetical protein  65.46 
 
 		 248 aa  319  3e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  62.25 
 
 		 248 aa  318  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  61.85 
 
 		 249 aa  315  6e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  61.85 
 
 		 248 aa  312  2.9999999999999996e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  61.85 
 
 		 248 aa  312  2.9999999999999996e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  61.13 
 
 		 248 aa  311  9e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  60.08 
 
 		 248 aa  311  9e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2114  hypothetical protein  57.83 
 
 		 248 aa  309  2.9999999999999997e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.308852  normal  0.355584 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0163  hypothetical protein  59.44 
 
 		 248 aa  308  4e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  60.64 
 
 		 248 aa  308  5.9999999999999995e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4171  hypothetical protein  60.32 
 
 		 248 aa  308  8e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265987  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0419  hypothetical protein  60.39 
 
 		 254 aa  306  3e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.26819  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  59.92 
 
 		 246 aa  305  6e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2729  hypothetical protein  59.27 
 
 		 248 aa  304  7e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  59.44 
 
 		 248 aa  301  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2305  hypothetical protein  57.83 
 
 		 248 aa  301  9e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119494 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3509  hypothetical protein  58.63 
 
 		 248 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.208978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6910  hypothetical protein  61.69 
 
 		 248 aa  299  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311344 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3525  hypothetical protein  58.06 
 
 		 248 aa  300  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2907  hypothetical protein  59.44 
 
 		 253 aa  295  5e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1219  hypothetical protein  55.82 
 
 		 249 aa  294  9e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.854834 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1287  hypothetical protein  61.94 
 
 		 248 aa  289  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2762  hypothetical protein  59.11 
 
 		 246 aa  286  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0792169 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2142  hypothetical protein  60.08 
 
 		 247 aa  286  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  56.63 
 
 		 248 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3380  hypothetical protein  54.33 
 
 		 255 aa  281  5.000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  56.22 
 
 		 248 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7401  hypothetical protein  59.51 
 
 		 248 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372247  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  56.22 
 
 		 248 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6579  hypothetical protein  59.11 
 
 		 248 aa  279  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3553  hypothetical protein  59.04 
 
 		 248 aa  278  7e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  55.47 
 
 		 246 aa  277  9e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3062  hypothetical protein  61.04 
 
 		 249 aa  277  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0922  hypothetical protein  59.84 
 
 		 248 aa  276  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0946  hypothetical protein  58.23 
 
 		 248 aa  275  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.596094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0982  hypothetical protein  58.23 
 
 		 264 aa  275  7e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.501161 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0345  hypothetical protein  56.05 
 
 		 248 aa  269  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2433  hypothetical protein  53.36 
 
 		 253 aa  267  8.999999999999999e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0780  hypothetical protein  55.95 
 
 		 251 aa  256  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0981369  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  50.2 
 
 		 248 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0484  hypothetical protein  51.01 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  47.58 
 
 		 246 aa  234  8e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  47.58 
 
 		 246 aa  234  8e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  47.58 
 
 		 246 aa  234  8e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  47.58 
 
 		 246 aa  234  8e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  47.58 
 
 		 246 aa  234  8e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  47.58 
 
 		 246 aa  234  8e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  47.58 
 
 		 246 aa  234  8e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  48.54 
 
 		 247 aa  234  9e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  47.18 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  47.18 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  48.79 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  46.8 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  46.12 
 
 		 246 aa  232  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  48.79 
 
 		 247 aa  233  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  46.96 
 
 		 247 aa  232  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  46.37 
 
 		 246 aa  231  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  46.37 
 
 		 246 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  46.37 
 
 		 246 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  46.56 
 
 		 247 aa  230  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  46.37 
 
 		 246 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  49.18 
 
 		 247 aa  230  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  46.37 
 
 		 246 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  45.34 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  46.56 
 
 		 247 aa  230  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  47.98 
 
 		 247 aa  229  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  45.34 
 
 		 247 aa  229  3e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2432  hypothetical protein  47.18 
 
 		 246 aa  229  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  46.99 
 
 		 249 aa  229  4e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  48.77 
 
 		 247 aa  229  5e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  47.37 
 
 		 247 aa  228  7e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  47.98 
 
 		 248 aa  228  9e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0351  hypothetical protein  48.99 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0508  hypothetical protein  47.95 
 
 		 246 aa  227  1e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  46.59 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1346  hypothetical protein  46 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404537  normal  0.548466 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  47.18 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  47.18 
 
 		 248 aa  225  6e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2033  hypothetical protein  47.18 
 
 		 247 aa  224  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00594875  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2424  hypothetical protein  47.18 
 
 		 247 aa  224  7e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.079823  normal  0.460299 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  46.37 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  49.8 
 
 		 243 aa  224  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2066  hypothetical protein  45.2 
 
 		 250 aa  224  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0807  hypothetical protein  47.2 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2146  hypothetical protein  46.77 
 
 		 247 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  47.39 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0704  hypothetical protein  47.35 
 
 		 248 aa  223  3e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  44.94 
 
 		 249 aa  222  3e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  47.79 
 
 		 248 aa  222  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  47.79 
 
 		 248 aa  222  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  47.79 
 
 		 248 aa  222  4e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  48.4 
 
 		 249 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  46.25 
 
 		 250 aa  221  7e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  45.38 
 
 		 251 aa  221  9e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1151  hypothetical protein  43.55 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  47.79 
 
 		 248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  46.99 
 
 		 246 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  45.56 
 
 		 246 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>