More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2907 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2907  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1219  hypothetical protein  75.9 
 
 
249 aa  411  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.854834 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  65.06 
 
 
248 aa  333  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  65.06 
 
 
249 aa  332  3e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  64.66 
 
 
248 aa  331  7.000000000000001e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  64.66 
 
 
248 aa  331  7.000000000000001e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2114  hypothetical protein  62.65 
 
 
248 aa  331  8e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.308852  normal  0.355584 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  64.34 
 
 
248 aa  331  9e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4171  hypothetical protein  63.31 
 
 
248 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265987  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  62.65 
 
 
248 aa  326  3e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0163  hypothetical protein  64.26 
 
 
248 aa  326  3e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  62.5 
 
 
248 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  60.64 
 
 
248 aa  319  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  62.25 
 
 
248 aa  316  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3509  hypothetical protein  60.64 
 
 
248 aa  311  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.208978 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3525  hypothetical protein  61.54 
 
 
248 aa  310  1e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2305  hypothetical protein  60.64 
 
 
248 aa  310  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119494 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2729  hypothetical protein  60.73 
 
 
248 aa  308  4e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31246  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6910  hypothetical protein  61.04 
 
 
248 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.311344 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1287  hypothetical protein  62.9 
 
 
248 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0337  hypothetical protein  59.27 
 
 
248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171809  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  59.44 
 
 
248 aa  301  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0345  hypothetical protein  61.13 
 
 
248 aa  300  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  59.04 
 
 
248 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  59.44 
 
 
248 aa  299  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3553  hypothetical protein  61.04 
 
 
248 aa  297  9e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  57.09 
 
 
246 aa  296  2e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1086  hypothetical protein  59.44 
 
 
249 aa  295  4e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0419  hypothetical protein  57.48 
 
 
254 aa  295  4e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.26819  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3380  hypothetical protein  57.65 
 
 
255 aa  291  5e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3062  hypothetical protein  62.25 
 
 
249 aa  291  7e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0946  hypothetical protein  59.44 
 
 
248 aa  289  2e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.596094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0982  hypothetical protein  59.13 
 
 
264 aa  288  4e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.501161 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6579  hypothetical protein  60.25 
 
 
248 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7401  hypothetical protein  59.51 
 
 
248 aa  287  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372247  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  57.49 
 
 
246 aa  285  7e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2762  hypothetical protein  59.51 
 
 
246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0792169 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0922  hypothetical protein  59.04 
 
 
248 aa  280  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0484  hypothetical protein  54.07 
 
 
246 aa  272  5.000000000000001e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2142  hypothetical protein  57.09 
 
 
247 aa  271  8.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68172  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  52.82 
 
 
248 aa  263  1e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2433  hypothetical protein  51.37 
 
 
253 aa  255  4e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0780  hypothetical protein  54.88 
 
 
251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0981369  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  49.6 
 
 
250 aa  252  4.0000000000000004e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  49.8 
 
 
247 aa  248  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0351  hypothetical protein  50.2 
 
 
248 aa  248  8e-65  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  51.61 
 
 
248 aa  248  9e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  51.61 
 
 
248 aa  248  9e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2066  hypothetical protein  47.39 
 
 
250 aa  247  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  48.58 
 
 
247 aa  246  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  53.41 
 
 
249 aa  246  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0704  hypothetical protein  48.57 
 
 
248 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  49.8 
 
 
251 aa  245  6e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  51.64 
 
 
248 aa  244  6.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  47.79 
 
 
249 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  52.02 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  46.96 
 
 
247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  46.96 
 
 
247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  50.81 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  47.77 
 
 
247 aa  241  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  47.56 
 
 
246 aa  241  6e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  51.61 
 
 
248 aa  241  7e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  51.82 
 
 
247 aa  241  9e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  48.96 
 
 
247 aa  240  1e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  50.83 
 
 
246 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  48.39 
 
 
247 aa  239  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  47.39 
 
 
249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  48.18 
 
 
247 aa  237  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  48.79 
 
 
247 aa  236  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1249  hypothetical protein  48.39 
 
 
247 aa  236  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1249  hypothetical protein  48.39 
 
 
247 aa  237  2e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  49.6 
 
 
248 aa  236  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  48.79 
 
 
247 aa  236  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6116  hypothetical protein  44.8 
 
 
250 aa  235  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal  0.165467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2570  hypothetical protein  47.58 
 
 
251 aa  235  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  50.6 
 
 
249 aa  235  6e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  50 
 
 
248 aa  235  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  50 
 
 
248 aa  235  6e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1346  hypothetical protein  46.12 
 
 
248 aa  234  7e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404537  normal  0.548466 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  49.6 
 
 
248 aa  234  8e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2237  hypothetical protein  51.6 
 
 
249 aa  234  8e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1151  hypothetical protein  45.38 
 
 
250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2108  protein of unknown function DUF28  45.56 
 
 
249 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00811013  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  49.6 
 
 
248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  49.6 
 
 
248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  49.6 
 
 
248 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  46.4 
 
 
250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0807  hypothetical protein  47.6 
 
 
251 aa  233  2.0000000000000002e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4204  hypothetical protein  51.21 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300828  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  50.42 
 
 
246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1371  protein of unknown function DUF28  47.39 
 
 
252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.82714  normal  0.0256064 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  49.6 
 
 
248 aa  232  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1243  hypothetical protein  50.81 
 
 
248 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362221  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1214  hypothetical protein  50.81 
 
 
248 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.480804  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  48.39 
 
 
248 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2018  protein of unknown function DUF28  52.42 
 
 
245 aa  232  5e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.687235  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  48.39 
 
 
248 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  48.39 
 
 
248 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3828  hypothetical protein  46 
 
 
251 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2298  hypothetical protein  45.97 
 
 
250 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>