More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2142 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2142  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  499  1e-140  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0337  hypothetical protein  75.4 
 
 		 248 aa  372  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0171809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0419  hypothetical protein  68.9 
 
 		 254 aa  360  1e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.26819  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  63.01 
 
 		 248 aa  329  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  64.23 
 
 		 248 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3509  hypothetical protein  64.23 
 
 		 248 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.208978 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  63.01 
 
 		 248 aa  324  8.000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  60.73 
 
 		 248 aa  320  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  61.38 
 
 		 248 aa  319  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  62.6 
 
 		 248 aa  317  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  62.6 
 
 		 248 aa  317  1e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4171  hypothetical protein  60.16 
 
 		 248 aa  314  9e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265987  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2114  hypothetical protein  59.35 
 
 		 248 aa  313  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.308852  normal  0.355584 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  62.6 
 
 		 249 aa  311  4.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2729  hypothetical protein  59.51 
 
 		 248 aa  310  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  61.38 
 
 		 248 aa  310  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3525  hypothetical protein  59.51 
 
 		 248 aa  309  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  61.38 
 
 		 248 aa  307  9e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  60.98 
 
 		 248 aa  305  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  60.98 
 
 		 248 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2305  hypothetical protein  58.94 
 
 		 248 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119494 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  61.38 
 
 		 246 aa  302  4.0000000000000003e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6910  hypothetical protein  59.51 
 
 		 248 aa  301  6.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.311344 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0163  hypothetical protein  60.16 
 
 		 248 aa  301  7.000000000000001e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1287  hypothetical protein  60.98 
 
 		 248 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3380  hypothetical protein  57.31 
 
 		 255 aa  294  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  58.54 
 
 		 246 aa  291  6e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1086  hypothetical protein  60.08 
 
 		 249 aa  291  9e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.630242  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3062  hypothetical protein  60.98 
 
 		 249 aa  288  7e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.35902 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7401  hypothetical protein  59.35 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.372247  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1219  hypothetical protein  56.28 
 
 		 249 aa  285  2.9999999999999996e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.854834 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0345  hypothetical protein  57.49 
 
 		 248 aa  285  5.999999999999999e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6579  hypothetical protein  58.13 
 
 		 248 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3553  hypothetical protein  57.72 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2762  hypothetical protein  60.98 
 
 		 246 aa  281  9e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0792169 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2907  hypothetical protein  57.09 
 
 		 253 aa  278  6e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0946  hypothetical protein  56.28 
 
 		 248 aa  278  7e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.596094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0982  hypothetical protein  56.28 
 
 		 264 aa  277  9e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.501161 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0922  hypothetical protein  56.68 
 
 		 248 aa  271  6e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2433  hypothetical protein  51.98 
 
 		 253 aa  263  1e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0780  hypothetical protein  57.37 
 
 		 251 aa  262  4.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0981369  normal  0.226642 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  51 
 
 		 248 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  46.96 
 
 		 247 aa  237  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  46.96 
 
 		 247 aa  236  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  48.58 
 
 		 247 aa  236  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  49.8 
 
 		 247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  47.77 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  50.21 
 
 		 247 aa  231  6e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  49.8 
 
 		 247 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  50.83 
 
 		 246 aa  230  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  45.56 
 
 		 250 aa  227  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  49.8 
 
 		 248 aa  227  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0484  hypothetical protein  50 
 
 		 246 aa  226  3e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  47.37 
 
 		 250 aa  226  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  47.39 
 
 		 247 aa  226  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  47.37 
 
 		 250 aa  226  3e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  49.58 
 
 		 246 aa  222  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  46.18 
 
 		 248 aa  221  6e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  45.78 
 
 		 251 aa  221  9.999999999999999e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  49.19 
 
 		 250 aa  221  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  49.59 
 
 		 243 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  48.4 
 
 		 248 aa  218  6e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  47.2 
 
 		 253 aa  218  7e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  49.4 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  47.37 
 
 		 249 aa  216  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  48 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  47.39 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  46.15 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0807  hypothetical protein  49.4 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  47.58 
 
 		 247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  49 
 
 		 248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  46.99 
 
 		 248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  48.81 
 
 		 249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  46.77 
 
 		 248 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  48.59 
 
 		 248 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  46.99 
 
 		 248 aa  211  7e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  46.77 
 
 		 246 aa  211  9e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  46.77 
 
 		 246 aa  211  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  46.77 
 
 		 246 aa  211  9e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  46.37 
 
 		 246 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  46.37 
 
 		 246 aa  211  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  47.6 
 
 		 248 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  46.77 
 
 		 246 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  46.37 
 
 		 246 aa  211  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  46.37 
 
 		 246 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  46.77 
 
 		 246 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  45.56 
 
 		 248 aa  210  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  46.77 
 
 		 246 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  46.37 
 
 		 246 aa  211  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  46.77 
 
 		 246 aa  210  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  46.37 
 
 		 246 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  46.37 
 
 		 246 aa  211  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  46.18 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1228  hypothetical protein  48.19 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  44.44 
 
 		 246 aa  210  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  47.6 
 
 		 248 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  43.95 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1151  hypothetical protein  41.94 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  46.77 
 
 		 247 aa  210  2e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  50.41 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>