More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_12523 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_12523  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  511  1e-144  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1990  hypothetical protein  72.98 
 
 
239 aa  382  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2560  hypothetical protein  71.43 
 
 
237 aa  366  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0228  protein of unknown function DUF28  61.32 
 
 
255 aa  298  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_002950  PG0097  hypothetical protein  57.26 
 
 
242 aa  291  8e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0278859 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2653  protein of unknown function DUF28  58.44 
 
 
226 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1650  hypothetical protein  56.38 
 
 
236 aa  270  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3642  protein of unknown function DUF28  59.84 
 
 
242 aa  264  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3516  hypothetical protein  56.68 
 
 
238 aa  247  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1612  hypothetical protein  50.62 
 
 
240 aa  245  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00192145  normal  0.534654 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2184  hypothetical protein  51.03 
 
 
240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1694  hypothetical protein  50.21 
 
 
240 aa  230  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534386  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1765  hypothetical protein  50.21 
 
 
240 aa  230  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.874851  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0752  protein of unknown function DUF28  48.55 
 
 
236 aa  227  1e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1389  hypothetical protein  52.28 
 
 
236 aa  219  5e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.407687  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1426  hypothetical protein  46.67 
 
 
244 aa  211  7.999999999999999e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1037  hypothetical protein  45.49 
 
 
235 aa  191  7e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000707905  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1081  hypothetical protein  45.49 
 
 
235 aa  191  1e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.478174  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0424  hypothetical protein  45.08 
 
 
235 aa  190  2e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1514  hypothetical protein  44.26 
 
 
235 aa  188  5.999999999999999e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0105441  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1306  hypothetical protein  45.49 
 
 
235 aa  181  8.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.793334  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0557  hypothetical protein  45.9 
 
 
235 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0624  hypothetical protein  42.37 
 
 
244 aa  180  2e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1187  hypothetical protein  45.08 
 
 
235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2399  protein of unknown function DUF28  40.98 
 
 
248 aa  178  8e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42546  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  41.95 
 
 
242 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  41.42 
 
 
246 aa  168  6e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  41.18 
 
 
248 aa  167  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  41.18 
 
 
248 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  40.17 
 
 
246 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  41.18 
 
 
248 aa  167  1e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  43.11 
 
 
248 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  41.18 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  41.48 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  39.92 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  40 
 
 
249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  40.79 
 
 
247 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  39.91 
 
 
247 aa  160  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0163  hypothetical protein  39.5 
 
 
248 aa  160  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  37.39 
 
 
246 aa  159  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  40.87 
 
 
247 aa  159  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  40.87 
 
 
247 aa  159  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  38.02 
 
 
248 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2114  hypothetical protein  39 
 
 
248 aa  158  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.308852  normal  0.355584 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  37.12 
 
 
252 aa  158  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  41.56 
 
 
253 aa  158  8e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  40.33 
 
 
253 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  40.87 
 
 
247 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  37.55 
 
 
248 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0768  hypothetical protein  38.91 
 
 
240 aa  157  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0981887  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  36.75 
 
 
243 aa  156  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  39.83 
 
 
248 aa  156  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0465  hypothetical protein  36.14 
 
 
239 aa  156  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000140686  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  40 
 
 
247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  36.33 
 
 
248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2433  hypothetical protein  37.96 
 
 
253 aa  155  8e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  41 
 
 
248 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3509  hypothetical protein  36.63 
 
 
248 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.208978 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  38.66 
 
 
248 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  36.93 
 
 
248 aa  154  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  38.75 
 
 
251 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  38.6 
 
 
250 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  38.17 
 
 
247 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1219  hypothetical protein  38.91 
 
 
249 aa  153  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.854834 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  38.66 
 
 
248 aa  153  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  38.17 
 
 
251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  38.24 
 
 
252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  38.24 
 
 
248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4171  hypothetical protein  36.71 
 
 
248 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265987  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0456  hypothetical protein  34.54 
 
 
242 aa  152  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2063  hypothetical protein  36.21 
 
 
241 aa  152  5.9999999999999996e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.804932 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4761  hypothetical protein  34.14 
 
 
239 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0577  hypothetical protein  34.14 
 
 
239 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00950255  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0322  hypothetical protein  35.1 
 
 
238 aa  150  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.535102  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0453  hypothetical protein  34.54 
 
 
239 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190075  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3380  hypothetical protein  36.6 
 
 
255 aa  150  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  37.34 
 
 
249 aa  151  1e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0615  hypothetical protein  34.54 
 
 
239 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000476022  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  37.19 
 
 
248 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1106  hypothetical protein  37.34 
 
 
252 aa  150  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2210  hypothetical protein  38.98 
 
 
245 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1922  hypothetical protein  38.98 
 
 
245 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.541871  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  39.02 
 
 
250 aa  149  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  39.02 
 
 
250 aa  149  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0510  hypothetical protein  34.14 
 
 
239 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.887528  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0449  hypothetical protein  34.14 
 
 
239 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0541  hypothetical protein  34.14 
 
 
239 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5905599999999994e-39 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0541  hypothetical protein  34.14 
 
 
239 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000461831  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1479  hypothetical protein  38.02 
 
 
249 aa  149  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0595  hypothetical protein  34.14 
 
 
239 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0672572  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0938  hypothetical protein  38.27 
 
 
249 aa  149  5e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.879867  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2729  hypothetical protein  35.86 
 
 
248 aa  149  6e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31246  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  36.55 
 
 
246 aa  148  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  36.82 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2305  hypothetical protein  37.82 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119494 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1013  hypothetical protein  39.51 
 
 
248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166545  hitchhiker  0.000108366 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  36.13 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3259  hypothetical protein  40.54 
 
 
242 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1227  hypothetical protein  36.63 
 
 
240 aa  146  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0124  hypothetical protein  37.65 
 
 
239 aa  146  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>