More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1227 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1227  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1086  hypothetical protein  92.92 
 
 		 241 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2724  hypothetical protein  81.93 
 
 		 240 aa  418  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1323  hypothetical protein  81.25 
 
 		 240 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403322 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1289  hypothetical protein  81.25 
 
 		 240 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1245  hypothetical protein  81.25 
 
 		 240 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3065  hypothetical protein  80.83 
 
 		 240 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.574128  hitchhiker  0.0000000411233 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2410  hypothetical protein  80.67 
 
 		 240 aa  411  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.895374 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0450  hypothetical protein  80.08 
 
 		 242 aa  410  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.777332  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3401  hypothetical protein  79.58 
 
 		 240 aa  407  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3408  hypothetical protein  79.92 
 
 		 241 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1225  hypothetical protein  78.75 
 
 		 240 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0447  hypothetical protein  80.17 
 
 		 242 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1154  hypothetical protein  78.33 
 
 		 240 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4519  hypothetical protein  79.5 
 
 		 242 aa  401  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.13557 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1155  hypothetical protein  77.92 
 
 		 240 aa  402  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.706452  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4169  hypothetical protein  65.98 
 
 		 241 aa  347  7e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.652416  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0124  hypothetical protein  66.81 
 
 		 239 aa  344  5e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1551  hypothetical protein  67.51 
 
 		 238 aa  342  2.9999999999999997e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00373978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2063  hypothetical protein  66.25 
 
 		 241 aa  340  9e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.804932 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03175  hypothetical protein  65.25 
 
 		 240 aa  339  2.9999999999999998e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2868  hypothetical protein  65.82 
 
 		 238 aa  327  8e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.666015  hitchhiker  0.000154925 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2154  hypothetical protein  63.87 
 
 		 241 aa  325  3e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36352  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0810  hypothetical protein  62.61 
 
 		 240 aa  324  7e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0550  hypothetical protein  62.18 
 
 		 243 aa  324  9e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.105783  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07036  hypothetical protein  68.07 
 
 		 238 aa  323  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0141  hypothetical protein  65.42 
 
 		 240 aa  323  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.829283  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000982  hypothetical protein  70.04 
 
 		 227 aa  316  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1066  hypothetical protein  62.71 
 
 		 237 aa  313  9.999999999999999e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1104  hypothetical protein  58.58 
 
 		 239 aa  300  1e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0411  hypothetical protein  47.7 
 
 		 238 aa  216  2e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0757755  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0242  hypothetical protein  46.81 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000674117  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0322  hypothetical protein  47.06 
 
 		 238 aa  209  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.535102  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1645  hypothetical protein  43.83 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0393041  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0465  hypothetical protein  43.75 
 
 		 239 aa  205  5e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000140686  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0456  hypothetical protein  44.17 
 
 		 242 aa  205  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0693  hypothetical protein  47.48 
 
 		 238 aa  204  8e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.719863  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0708  hypothetical protein  47.48 
 
 		 238 aa  204  8e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.934731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0453  hypothetical protein  43.33 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190075  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0615  hypothetical protein  43.75 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000476022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0510  hypothetical protein  43.33 
 
 		 239 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.887528  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0449  hypothetical protein  43.33 
 
 		 239 aa  202  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0541  hypothetical protein  43.33 
 
 		 239 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000461831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0541  hypothetical protein  43.33 
 
 		 239 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5905599999999994e-39 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0595  hypothetical protein  43.33 
 
 		 239 aa  201  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0672572  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4761  hypothetical protein  43.33 
 
 		 239 aa  202  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0577  hypothetical protein  43.33 
 
 		 239 aa  201  8e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00950255  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0237  hypothetical protein  43.83 
 
 		 238 aa  199  3e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.89365  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4750  hypothetical protein  42.55 
 
 		 238 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.168616 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4850  hypothetical protein  42.55 
 
 		 238 aa  195  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0706778 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4826  hypothetical protein  42.55 
 
 		 238 aa  195  5.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2106  hypothetical protein  42.55 
 
 		 238 aa  195  6e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.42847e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2265  hypothetical protein  42.55 
 
 		 238 aa  195  6e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1660  hypothetical protein  42.55 
 
 		 238 aa  195  6e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000398097  normal  0.0396414 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0985  hypothetical protein  42.55 
 
 		 238 aa  195  6e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000517844  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4901  hypothetical protein  42.55 
 
 		 238 aa  195  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01895  hypothetical protein  42.55 
 
 		 238 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.332684  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1670  protein of unknown function DUF28  42.55 
 
 		 238 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00376814  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2825  hypothetical protein  42.55 
 
 		 238 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000953652  normal  0.63572 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1142  hypothetical protein  42.55 
 
 		 238 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394813  hitchhiker  0.000003904 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01884  hypothetical protein  42.55 
 
 		 238 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.340686  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4897  hypothetical protein  42.13 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374047 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl546  hypothetical protein  42.74 
 
 		 237 aa  181  6e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.04209  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0598  hypothetical protein  39.83 
 
 		 237 aa  168  7e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.780908  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  36.16 
 
 		 243 aa  151  7e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1301  hypothetical protein  41.15 
 
 		 242 aa  151  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17975  normal  0.117692 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  34.17 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  41.59 
 
 		 248 aa  149  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0508  hypothetical protein  33.89 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  35.83 
 
 		 247 aa  149  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  40 
 
 		 242 aa  149  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0097  hypothetical protein  36.13 
 
 		 242 aa  148  6e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0278859 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3259  hypothetical protein  40.27 
 
 		 242 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.977869 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  35.56 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  35.56 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  35.56 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  35.56 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  35.56 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  35.56 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  35.15 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  35.15 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  35.95 
 
 		 247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  35.83 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  35.15 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  40.71 
 
 		 248 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  40.71 
 
 		 248 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  34.85 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  34.73 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  36 
 
 		 246 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  34.73 
 
 		 246 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  34.73 
 
 		 246 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  34.73 
 
 		 246 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  34.73 
 
 		 246 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2432  hypothetical protein  34.85 
 
 		 246 aa  145  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  38.22 
 
 		 247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  35.54 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  35.25 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  35.47 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  37.44 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2190  hypothetical protein  38.94 
 
 		 241 aa  142  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>