More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1922 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2210  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  495  1e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1922  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  495  1e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.541871  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  62.61 
 
 
242 aa  304  8.000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  60.08 
 
 
248 aa  292  4e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2507  hypothetical protein  60.08 
 
 
242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.153457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  56.3 
 
 
246 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  56.97 
 
 
247 aa  281  1e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  53.5 
 
 
243 aa  276  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  55.88 
 
 
246 aa  275  6e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0816  hypothetical protein  54.81 
 
 
243 aa  275  7e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.177048  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  53.66 
 
 
246 aa  271  6e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  52.5 
 
 
242 aa  269  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  58.05 
 
 
247 aa  266  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  56.78 
 
 
247 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  57.2 
 
 
247 aa  261  8.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  53.5 
 
 
248 aa  259  3e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  52.89 
 
 
247 aa  258  6e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  50 
 
 
253 aa  257  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3629  hypothetical protein  52.82 
 
 
252 aa  255  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000422691  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  56.78 
 
 
247 aa  255  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  50.41 
 
 
248 aa  254  7e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  52.67 
 
 
248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  52.07 
 
 
249 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1151  hypothetical protein  50.83 
 
 
250 aa  251  5.000000000000001e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  53.33 
 
 
239 aa  251  6e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  51.65 
 
 
250 aa  251  6e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  52.3 
 
 
250 aa  251  7e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  49.79 
 
 
246 aa  248  7e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  53.94 
 
 
247 aa  247  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2183  hypothetical protein  49.59 
 
 
250 aa  247  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  52.24 
 
 
251 aa  247  1e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  49.58 
 
 
243 aa  247  2e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  50 
 
 
248 aa  246  3e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  51.9 
 
 
250 aa  244  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  53.81 
 
 
248 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1013  hypothetical protein  52.07 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166545  hitchhiker  0.000108366 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  49.38 
 
 
251 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  54.1 
 
 
243 aa  243  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2117  protein of unknown function DUF28  47.46 
 
 
247 aa  243  3e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.892674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  51.04 
 
 
247 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1210  protein of unknown function DUF28  52.24 
 
 
243 aa  242  5e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  50.62 
 
 
249 aa  241  6e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  51.24 
 
 
246 aa  241  7e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  50.62 
 
 
247 aa  241  7e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  51.24 
 
 
246 aa  241  7e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  50.62 
 
 
248 aa  241  7e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  51.24 
 
 
246 aa  241  7.999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  50.83 
 
 
246 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  50.83 
 
 
246 aa  241  1e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  50.83 
 
 
246 aa  241  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  50.83 
 
 
246 aa  241  1e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  50.83 
 
 
246 aa  241  1e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  50.83 
 
 
246 aa  241  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  51.24 
 
 
248 aa  239  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2031  hypothetical protein  53.5 
 
 
248 aa  239  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0016605  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  51.24 
 
 
246 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  51.24 
 
 
246 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  51.24 
 
 
246 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  51.24 
 
 
246 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1752  hypothetical protein  50 
 
 
244 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000585673  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0422  hypothetical protein  50 
 
 
244 aa  239  4e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0951689  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0618  hypothetical protein  50.83 
 
 
239 aa  238  5.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.979417  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1703  hypothetical protein  51.67 
 
 
239 aa  238  9e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24862  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0768  hypothetical protein  48.55 
 
 
240 aa  238  9e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0981887  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1898  hypothetical protein  51.67 
 
 
239 aa  238  9e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484547  normal  0.228214 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  50.83 
 
 
246 aa  237  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  49.59 
 
 
248 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  49.17 
 
 
248 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  46.47 
 
 
249 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0025  hypothetical protein  50.21 
 
 
243 aa  235  5.0000000000000005e-61  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  49.17 
 
 
248 aa  235  6e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  50.42 
 
 
250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  50.42 
 
 
250 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0508  hypothetical protein  47.93 
 
 
246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  51.04 
 
 
247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3203  hypothetical protein  50.42 
 
 
239 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258342  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2432  hypothetical protein  50.41 
 
 
246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  49.17 
 
 
247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  49.17 
 
 
247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  48.76 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  48.76 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  48.76 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  48.76 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  48.76 
 
 
248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  48.76 
 
 
248 aa  232  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  49.17 
 
 
248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2355  hypothetical protein  54.13 
 
 
241 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.377653 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  51.26 
 
 
240 aa  231  7.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  48.35 
 
 
247 aa  231  7.000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  48.35 
 
 
247 aa  231  9e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1615  hypothetical protein  48.35 
 
 
249 aa  230  1e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  48.75 
 
 
253 aa  230  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  51.03 
 
 
249 aa  231  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  46.69 
 
 
249 aa  230  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1704  hypothetical protein  50.62 
 
 
252 aa  229  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609953  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  49.17 
 
 
247 aa  230  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  48.95 
 
 
248 aa  229  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  50.42 
 
 
246 aa  230  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1461  hypothetical protein  49.38 
 
 
240 aa  229  2e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  48.33 
 
 
253 aa  230  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>