More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1461 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1461  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  489  1e-137  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0768  hypothetical protein  74.58 
 
 
240 aa  382  1e-105  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0981887  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  59 
 
 
243 aa  293  1e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  55.6 
 
 
246 aa  266  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  54.77 
 
 
246 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0552  hypothetical protein  60.08 
 
 
248 aa  260  1e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  53.53 
 
 
248 aa  242  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  49.79 
 
 
246 aa  241  9e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  47.9 
 
 
242 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  50.21 
 
 
247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  50.21 
 
 
249 aa  232  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  48.13 
 
 
247 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  48.13 
 
 
247 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  48.55 
 
 
247 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  49.17 
 
 
248 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  49.17 
 
 
248 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  48.55 
 
 
247 aa  230  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  49.17 
 
 
248 aa  231  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  48.96 
 
 
247 aa  230  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  48.76 
 
 
248 aa  229  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  48.76 
 
 
248 aa  229  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  48.76 
 
 
248 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  49.17 
 
 
248 aa  228  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  48.76 
 
 
248 aa  228  5e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1953  hypothetical protein  51.04 
 
 
241 aa  227  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  49.17 
 
 
250 aa  227  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  49.17 
 
 
250 aa  227  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  50.41 
 
 
248 aa  226  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  48.13 
 
 
247 aa  226  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  48.35 
 
 
248 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  47.06 
 
 
248 aa  226  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  51.45 
 
 
240 aa  225  4e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  47.5 
 
 
246 aa  226  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  49.17 
 
 
250 aa  225  4e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3030  hypothetical protein  48.74 
 
 
252 aa  225  6e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.248633  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  48.35 
 
 
247 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  46.89 
 
 
249 aa  221  6e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  48.35 
 
 
248 aa  221  6e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  47.93 
 
 
248 aa  221  9e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  47.48 
 
 
242 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  47.93 
 
 
248 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  45.45 
 
 
253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1703  hypothetical protein  49.17 
 
 
239 aa  219  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24862  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3521  hypothetical protein  48.76 
 
 
239 aa  219  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0483995  normal  0.126063 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3203  hypothetical protein  49.79 
 
 
239 aa  219  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.258342  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1898  hypothetical protein  49.17 
 
 
239 aa  219  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484547  normal  0.228214 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0816  hypothetical protein  45.57 
 
 
243 aa  218  7e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.177048  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  48.73 
 
 
247 aa  218  8.999999999999998e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  49.38 
 
 
248 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  47.74 
 
 
248 aa  217  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3853  protein of unknown function DUF28  47.52 
 
 
241 aa  216  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  49.17 
 
 
248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  47.93 
 
 
248 aa  215  4e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1210  protein of unknown function DUF28  46.89 
 
 
243 aa  215  5e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  45.23 
 
 
250 aa  215  5e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  44.77 
 
 
250 aa  215  5e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0925  protein of unknown function DUF28  45.87 
 
 
250 aa  215  5e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.488101  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  47.3 
 
 
245 aa  214  7e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  47.11 
 
 
248 aa  214  8e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2117  protein of unknown function DUF28  46.06 
 
 
247 aa  214  9.999999999999999e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.892674  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0967  protein of unknown function DUF28  46.27 
 
 
266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.021533  hitchhiker  0.000000117284 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  47.33 
 
 
243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  48.35 
 
 
248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  47.48 
 
 
247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4362  hypothetical protein  47.13 
 
 
255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.144565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  49.17 
 
 
248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03900  conserved hypothetical protein TIGR01033  46.64 
 
 
265 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.144849 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2183  hypothetical protein  47.11 
 
 
250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  46.64 
 
 
253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  48.74 
 
 
247 aa  211  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  45.87 
 
 
250 aa  211  5.999999999999999e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1615  hypothetical protein  47.3 
 
 
249 aa  211  7.999999999999999e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  48.35 
 
 
248 aa  211  9e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  43.93 
 
 
250 aa  211  9e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  49.79 
 
 
248 aa  210  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0718  hypothetical protein  46.89 
 
 
255 aa  210  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  45.45 
 
 
250 aa  210  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  44.35 
 
 
250 aa  209  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  45.04 
 
 
252 aa  210  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  48.52 
 
 
248 aa  210  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  47.06 
 
 
246 aa  209  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  47.48 
 
 
246 aa  209  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  47.06 
 
 
246 aa  209  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  47.48 
 
 
246 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  44.03 
 
 
251 aa  209  3e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  47.06 
 
 
246 aa  209  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  47.06 
 
 
246 aa  209  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  47.06 
 
 
246 aa  209  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  47.48 
 
 
246 aa  209  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3259  hypothetical protein  49.79 
 
 
242 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  47.06 
 
 
246 aa  209  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  47.48 
 
 
246 aa  209  3e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  47.48 
 
 
246 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  47.9 
 
 
247 aa  209  3e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  47.48 
 
 
246 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  47.48 
 
 
246 aa  209  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  48.56 
 
 
249 aa  209  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  45.8 
 
 
253 aa  209  4e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3509  hypothetical protein  49.79 
 
 
248 aa  209  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.208978 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  47.72 
 
 
247 aa  208  6e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.226909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>