More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0552 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0552  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  508  1e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  63.16 
 
 		 243 aa  327  9e-89  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0768  hypothetical protein  60.5 
 
 		 240 aa  294  7e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0981887  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  58.47 
 
 		 246 aa  290  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1461  hypothetical protein  60.08 
 
 		 240 aa  286  2.9999999999999996e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  56.78 
 
 		 246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  49.8 
 
 		 246 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  49.37 
 
 		 247 aa  242  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  48.31 
 
 		 247 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  48.31 
 
 		 247 aa  237  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  47.98 
 
 		 253 aa  235  6e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  50.63 
 
 		 242 aa  235  6e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  47.58 
 
 		 253 aa  234  9e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  47.39 
 
 		 247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  49.38 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  47.9 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  47.95 
 
 		 249 aa  233  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  50.2 
 
 		 248 aa  231  9e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  48.54 
 
 		 248 aa  229  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  48.16 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  48.16 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  46.61 
 
 		 243 aa  229  4e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  46.75 
 
 		 248 aa  227  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1615  hypothetical protein  47.95 
 
 		 249 aa  227  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  45.34 
 
 		 242 aa  226  3e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  46.41 
 
 		 247 aa  226  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  47.15 
 
 		 248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  46.75 
 
 		 248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  46.75 
 
 		 248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  46.75 
 
 		 248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  46.41 
 
 		 250 aa  224  8e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1210  protein of unknown function DUF28  49.15 
 
 		 243 aa  224  8e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  47.56 
 
 		 247 aa  224  9e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  45.57 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  48.57 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  44.49 
 
 		 253 aa  223  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3629  hypothetical protein  46.4 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000422691  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  48.98 
 
 		 248 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  47.77 
 
 		 246 aa  222  4e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  47.77 
 
 		 246 aa  222  4e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  47.77 
 
 		 246 aa  222  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  47.77 
 
 		 246 aa  222  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  47.77 
 
 		 246 aa  222  4e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  47.77 
 
 		 246 aa  222  4e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0925  protein of unknown function DUF28  47.97 
 
 		 250 aa  222  4e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.488101  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  47.37 
 
 		 246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  47.37 
 
 		 246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  47.37 
 
 		 246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  47.37 
 
 		 246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  47.37 
 
 		 246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  47.37 
 
 		 246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  47.37 
 
 		 246 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  43.5 
 
 		 251 aa  221  8e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  46.34 
 
 		 248 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  47.56 
 
 		 248 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  45.93 
 
 		 248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  47.35 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  48.1 
 
 		 248 aa  219  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  45.93 
 
 		 248 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  46.96 
 
 		 246 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  45.93 
 
 		 248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4204  hypothetical protein  47.56 
 
 		 248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2432  hypothetical protein  47.58 
 
 		 246 aa  219  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1151  hypothetical protein  45.31 
 
 		 250 aa  218  5e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2210  hypothetical protein  49.39 
 
 		 245 aa  218  5e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1922  hypothetical protein  49.39 
 
 		 245 aa  218  5e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.541871  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  47.13 
 
 		 247 aa  218  5e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2507  hypothetical protein  50.71 
 
 		 242 aa  218  6e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.153457  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  48.58 
 
 		 247 aa  218  7e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1214  hypothetical protein  47.56 
 
 		 248 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.480804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1243  hypothetical protein  47.56 
 
 		 248 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  47.98 
 
 		 247 aa  217  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  45.31 
 
 		 248 aa  217  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1228  hypothetical protein  47.28 
 
 		 252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  48.16 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  47.77 
 
 		 247 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  47.46 
 
 		 252 aa  215  5e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  48.77 
 
 		 247 aa  215  5e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  48.09 
 
 		 248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2424  hypothetical protein  47.58 
 
 		 247 aa  214  8e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.079823  normal  0.460299 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2033  hypothetical protein  47.58 
 
 		 247 aa  214  8e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00594875  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2117  protein of unknown function DUF28  44.92 
 
 		 247 aa  214  9e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.892674  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  46.56 
 
 		 247 aa  214  9e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  46.53 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  48.51 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2183  hypothetical protein  45.71 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  44.96 
 
 		 252 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1013  hypothetical protein  48.1 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166545  hitchhiker  0.000108366 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2146  hypothetical protein  47.18 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  47.26 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  44.9 
 
 		 248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  47.37 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  46.53 
 
 		 248 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0816  hypothetical protein  44.92 
 
 		 243 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.177048  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  44.49 
 
 		 248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  47.88 
 
 		 248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3030  hypothetical protein  46.12 
 
 		 252 aa  212  3.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.248633  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  47.97 
 
 		 249 aa  211  7.999999999999999e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1989  hypothetical protein  44.96 
 
 		 252 aa  211  7.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0129309 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07020  conserved hypothetical protein TIGR01033  44.79 
 
 		 267 aa  211  7.999999999999999e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000405153  normal  0.306564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>