More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2507 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2507  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  500  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.153457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  62.08 
 
 		 242 aa  310  2e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  55 
 
 		 248 aa  282  4.0000000000000003e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0816  hypothetical protein  55.79 
 
 		 243 aa  281  9e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.177048  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  57.32 
 
 		 246 aa  280  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2210  hypothetical protein  60.08 
 
 		 245 aa  267  8.999999999999999e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1922  hypothetical protein  60.08 
 
 		 245 aa  267  8.999999999999999e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.541871  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  50.83 
 
 		 246 aa  265  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  52.07 
 
 		 246 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  51.04 
 
 		 243 aa  262  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  49.59 
 
 		 242 aa  258  4e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  53.11 
 
 		 247 aa  257  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  52.07 
 
 		 250 aa  257  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  53.11 
 
 		 247 aa  254  6e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  47.3 
 
 		 253 aa  246  3e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  50.63 
 
 		 246 aa  245  4e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3629  hypothetical protein  49.79 
 
 		 252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000422691  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  50.21 
 
 		 252 aa  239  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  49.79 
 
 		 247 aa  238  5.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  50.62 
 
 		 247 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  50.41 
 
 		 250 aa  237  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  50.42 
 
 		 247 aa  235  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  48.13 
 
 		 247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  48.1 
 
 		 243 aa  235  6e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  50.63 
 
 		 247 aa  234  8e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  49.59 
 
 		 249 aa  234  8e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  47.72 
 
 		 247 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  49.79 
 
 		 247 aa  233  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1151  hypothetical protein  47.72 
 
 		 250 aa  233  3e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  49.58 
 
 		 248 aa  232  5e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  45.42 
 
 		 251 aa  231  6e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  50.41 
 
 		 248 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1210  protein of unknown function DUF28  48.35 
 
 		 243 aa  228  9e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  49.58 
 
 		 248 aa  228  9e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  48.76 
 
 		 248 aa  227  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  49.38 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  45.64 
 
 		 249 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  48.33 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  50.83 
 
 		 249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  47.11 
 
 		 250 aa  224  8e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  46.28 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  48.13 
 
 		 248 aa  224  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1779  hypothetical protein  46.28 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2183  hypothetical protein  48.33 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1013  hypothetical protein  46.47 
 
 		 248 aa  223  2e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166545  hitchhiker  0.000108366 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  48.96 
 
 		 247 aa  222  4e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0508  hypothetical protein  47.92 
 
 		 246 aa  221  9.999999999999999e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1615  hypothetical protein  47.72 
 
 		 249 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  51.63 
 
 		 248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  47.72 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  47.72 
 
 		 250 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  47.92 
 
 		 248 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  48.76 
 
 		 243 aa  219  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1634  protein of unknown function DUF28  46.06 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1792  hypothetical protein  45.04 
 
 		 249 aa  219  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  51.22 
 
 		 248 aa  219  3e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1371  protein of unknown function DUF28  47.74 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.82714  normal  0.0256064 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  46.06 
 
 		 249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  46.69 
 
 		 248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  48.75 
 
 		 248 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  47.92 
 
 		 248 aa  218  5e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  47.92 
 
 		 248 aa  218  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  47.92 
 
 		 248 aa  218  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  48.74 
 
 		 240 aa  218  7.999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  49.17 
 
 		 249 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  47.08 
 
 		 248 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  47.92 
 
 		 248 aa  217  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  47.5 
 
 		 248 aa  217  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1479  hypothetical protein  44.35 
 
 		 249 aa  217  1e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  47.5 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2108  protein of unknown function DUF28  45.04 
 
 		 249 aa  216  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00811013  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  47.5 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  47.11 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1346  hypothetical protein  44.63 
 
 		 248 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.404537  normal  0.548466 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  44.81 
 
 		 250 aa  216  4e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0768  hypothetical protein  44.63 
 
 		 240 aa  215  4e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0981887  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  46.06 
 
 		 249 aa  215  5e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3179  protein of unknown function DUF28  45.45 
 
 		 250 aa  215  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  47.3 
 
 		 246 aa  215  5.9999999999999996e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2031  hypothetical protein  46.91 
 
 		 248 aa  214  7e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0016605  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  46.67 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0938  hypothetical protein  44.35 
 
 		 249 aa  214  9.999999999999999e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.879867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2554  protein of unknown function DUF28  45.83 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.113083  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  47.08 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  46.67 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  47.08 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  46.67 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  47.08 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  47.08 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  46.25 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  46.25 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  46.25 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  46.25 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0774  protein of unknown function DUF28  45.11 
 
 		 238 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3057  protein of unknown function DUF28  44.63 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.205438  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  46.25 
 
 		 246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1898  hypothetical protein  47.08 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484547  normal  0.228214 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2117  protein of unknown function DUF28  43.15 
 
 		 247 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.892674  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  45.04 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1703  hypothetical protein  47.08 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.24862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>