More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1037 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1037  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  481  1e-135  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000707905  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1514  hypothetical protein  87.66 
 
 
235 aa  392  1e-108  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0105441  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0424  hypothetical protein  83.4 
 
 
235 aa  388  1e-107  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1081  hypothetical protein  71.91 
 
 
235 aa  326  2.0000000000000001e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.478174  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1426  hypothetical protein  67.21 
 
 
244 aa  325  5e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1306  hypothetical protein  72.34 
 
 
235 aa  319  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.793334  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0557  hypothetical protein  71.49 
 
 
235 aa  319  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1187  hypothetical protein  72.34 
 
 
235 aa  319  3e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0752  protein of unknown function DUF28  60.43 
 
 
236 aa  293  1e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1389  hypothetical protein  57.02 
 
 
236 aa  264  8e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.407687  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0228  protein of unknown function DUF28  46.61 
 
 
255 aa  231  7.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_002950  PG0097  hypothetical protein  45.96 
 
 
242 aa  229  2e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0278859 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1650  hypothetical protein  47.66 
 
 
236 aa  224  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2560  hypothetical protein  46.32 
 
 
237 aa  223  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1990  hypothetical protein  45.02 
 
 
239 aa  219  1.9999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2653  protein of unknown function DUF28  47.3 
 
 
226 aa  215  4e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1612  hypothetical protein  42.26 
 
 
240 aa  205  6e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00192145  normal  0.534654 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3516  hypothetical protein  47.01 
 
 
238 aa  204  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3642  protein of unknown function DUF28  45 
 
 
242 aa  198  5e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0624  hypothetical protein  43.78 
 
 
244 aa  194  1e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2184  hypothetical protein  43.51 
 
 
240 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1765  hypothetical protein  43.51 
 
 
240 aa  189  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.874851  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1694  hypothetical protein  43.51 
 
 
240 aa  189  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534386  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12523  hypothetical protein  45.49 
 
 
248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1210  protein of unknown function DUF28  41.01 
 
 
243 aa  177  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  39.83 
 
 
246 aa  169  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  39.65 
 
 
243 aa  169  5e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  41.33 
 
 
248 aa  168  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  39.74 
 
 
248 aa  168  9e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  40.89 
 
 
248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  40.89 
 
 
248 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  41.33 
 
 
248 aa  165  6.9999999999999995e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  41.33 
 
 
248 aa  165  6.9999999999999995e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  38.16 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  38.79 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  38.56 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  39.57 
 
 
247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  38.36 
 
 
247 aa  162  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  40.44 
 
 
248 aa  163  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  40 
 
 
248 aa  161  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  39.09 
 
 
246 aa  161  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  39.83 
 
 
246 aa  161  8.000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  41.1 
 
 
246 aa  160  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  38.67 
 
 
248 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  38.2 
 
 
253 aa  159  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2729  hypothetical protein  37.55 
 
 
248 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31246  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2399  protein of unknown function DUF28  40 
 
 
248 aa  159  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42546  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2114  hypothetical protein  38.43 
 
 
248 aa  159  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.308852  normal  0.355584 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  40.53 
 
 
249 aa  159  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  38.36 
 
 
247 aa  159  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  38.2 
 
 
253 aa  158  7e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4171  hypothetical protein  37.99 
 
 
248 aa  157  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265987  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  37.93 
 
 
247 aa  156  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3509  hypothetical protein  39.56 
 
 
248 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.208978 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2594  hypothetical protein  38.96 
 
 
252 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000460429 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  39.22 
 
 
248 aa  156  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  39.09 
 
 
250 aa  157  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  39.56 
 
 
248 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  38.26 
 
 
249 aa  156  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  38.79 
 
 
245 aa  156  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1650  protein of unknown function DUF28  36.75 
 
 
247 aa  155  4e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  37.77 
 
 
248 aa  154  8e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0816  hypothetical protein  39.91 
 
 
243 aa  154  9e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.177048  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  38.67 
 
 
246 aa  154  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.192843 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  39.22 
 
 
246 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  39.22 
 
 
246 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  39.22 
 
 
246 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  39.22 
 
 
246 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  39.22 
 
 
246 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3030  hypothetical protein  36.82 
 
 
252 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.248633  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  37.55 
 
 
252 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  39.22 
 
 
246 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  36.21 
 
 
247 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  38.79 
 
 
246 aa  153  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  37.73 
 
 
250 aa  153  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  38.79 
 
 
246 aa  153  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  38.79 
 
 
246 aa  153  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  38.64 
 
 
250 aa  153  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  38.96 
 
 
250 aa  153  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0718  hypothetical protein  38.84 
 
 
255 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  39.21 
 
 
250 aa  153  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0163  hypothetical protein  39.38 
 
 
248 aa  153  2e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3179  protein of unknown function DUF28  38.81 
 
 
250 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1371  protein of unknown function DUF28  36.64 
 
 
252 aa  152  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.82714  normal  0.0256064 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1106  hypothetical protein  38.2 
 
 
252 aa  152  5e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  38.79 
 
 
246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  38.79 
 
 
246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  38.79 
 
 
246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  38.79 
 
 
246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  37.34 
 
 
252 aa  151  7e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3525  hypothetical protein  37.33 
 
 
248 aa  151  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  36.21 
 
 
248 aa  151  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  35.93 
 
 
246 aa  151  8e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  38.16 
 
 
251 aa  151  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  38.43 
 
 
248 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  36.21 
 
 
247 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4362  hypothetical protein  38.39 
 
 
255 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.144565 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  35.78 
 
 
247 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  37.27 
 
 
251 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  38.36 
 
 
246 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>