More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2653 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2653  protein of unknown function DUF28  100 
 
 		 226 aa  464  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0228  protein of unknown function DUF28  67.41 
 
 		 255 aa  324  5e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2560  hypothetical protein  62.05 
 
 		 237 aa  284  9e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1990  hypothetical protein  60.27 
 
 		 239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0097  hypothetical protein  61.33 
 
 		 242 aa  275  6e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0278859 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1650  hypothetical protein  56.44 
 
 		 236 aa  262  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3642  protein of unknown function DUF28  58.77 
 
 		 242 aa  239  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12523  hypothetical protein  58.44 
 
 		 248 aa  236  2e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3516  hypothetical protein  56.7 
 
 		 238 aa  227  9e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1612  hypothetical protein  47.39 
 
 		 240 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00192145  normal  0.534654 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0752  protein of unknown function DUF28  46.9 
 
 		 236 aa  213  9.999999999999999e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1694  hypothetical protein  47.19 
 
 		 240 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534386  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1765  hypothetical protein  47.19 
 
 		 240 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.874851  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2184  hypothetical protein  45.89 
 
 		 240 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0424  hypothetical protein  47.75 
 
 		 235 aa  198  5e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1037  hypothetical protein  47.3 
 
 		 235 aa  189  2e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000707905  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0624  hypothetical protein  44.8 
 
 		 244 aa  188  7e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1389  hypothetical protein  45.13 
 
 		 236 aa  185  6e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.407687  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1081  hypothetical protein  46.85 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.478174  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1514  hypothetical protein  45.5 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0105441  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1306  hypothetical protein  47.75 
 
 		 235 aa  181  6e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.793334  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1187  hypothetical protein  47.75 
 
 		 235 aa  181  7e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  41.89 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0557  hypothetical protein  47.3 
 
 		 235 aa  178  4.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  42.01 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  42.92 
 
 		 242 aa  175  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  40.99 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  42.99 
 
 		 246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  42.27 
 
 		 248 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1426  hypothetical protein  41.92 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  41.82 
 
 		 248 aa  165  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0768  hypothetical protein  40.18 
 
 		 240 aa  165  4e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0981887  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  42.27 
 
 		 248 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2399  protein of unknown function DUF28  40.27 
 
 		 248 aa  164  8e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42546  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  42.27 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  37.16 
 
 		 243 aa  161  7e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  40.28 
 
 		 248 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  36.49 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  39.91 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  39.35 
 
 		 249 aa  159  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  40.64 
 
 		 247 aa  158  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  41.28 
 
 		 248 aa  158  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0163  hypothetical protein  39.35 
 
 		 248 aa  156  2e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  39.73 
 
 		 249 aa  156  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  38.18 
 
 		 247 aa  155  4e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1219  hypothetical protein  40.64 
 
 		 249 aa  155  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.854834 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  40 
 
 		 246 aa  155  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  39.81 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  39.81 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1407  hypothetical protein  38.36 
 
 		 248 aa  154  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.133281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  39.35 
 
 		 248 aa  154  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  40.09 
 
 		 251 aa  154  9e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3509  hypothetical protein  40.37 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.208978 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  40 
 
 		 253 aa  153  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  40 
 
 		 253 aa  153  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1210  protein of unknown function DUF28  36.99 
 
 		 243 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1615  hypothetical protein  37.21 
 
 		 249 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2594  hypothetical protein  38.5 
 
 		 252 aa  152  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000460429 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3980  hypothetical protein  37.44 
 
 		 248 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  36.07 
 
 		 249 aa  151  7e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  40.64 
 
 		 250 aa  151  8e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  40.64 
 
 		 250 aa  151  8e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  36.53 
 
 		 248 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  34.7 
 
 		 248 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  40 
 
 		 247 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  36.57 
 
 		 248 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3030  hypothetical protein  36.2 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.248633  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  39.27 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1461  hypothetical protein  38.18 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3380  hypothetical protein  37.89 
 
 		 255 aa  148  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2775  hypothetical protein  36.89 
 
 		 255 aa  148  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  37.44 
 
 		 246 aa  147  9e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  37.84 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  36.99 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  37.9 
 
 		 247 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2729  hypothetical protein  36.57 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  39.55 
 
 		 248 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  37.9 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4171  hypothetical protein  37.33 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265987  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2210  hypothetical protein  40.64 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1922  hypothetical protein  40.64 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.541871  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  36.36 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  35.65 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0465  hypothetical protein  34.18 
 
 		 239 aa  146  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000140686  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  37.44 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  37.44 
 
 		 246 aa  145  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  36.36 
 
 		 250 aa  145  5e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  38.81 
 
 		 247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  36.99 
 
 		 247 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0925  protein of unknown function DUF28  39.37 
 
 		 250 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.488101  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3525  hypothetical protein  36.11 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  36.36 
 
 		 249 aa  143  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  36.82 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1650  protein of unknown function DUF28  37.1 
 
 		 247 aa  143  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  36.07 
 
 		 248 aa  143  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  38.99 
 
 		 250 aa  143  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  37.27 
 
 		 250 aa  142  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4362  hypothetical protein  35.56 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144565 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0595  hypothetical protein  31.22 
 
 		 239 aa  142  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0672572  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  36.07 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>