More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1650 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1650  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  483  1e-136  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1612  hypothetical protein  64.85 
 
 		 240 aa  320  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00192145  normal  0.534654 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1765  hypothetical protein  65.27 
 
 		 240 aa  304  9.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.874851  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1694  hypothetical protein  65.27 
 
 		 240 aa  304  9.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534386  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2184  hypothetical protein  64.44 
 
 		 240 aa  301  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1990  hypothetical protein  54.66 
 
 		 239 aa  265  4e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0228  protein of unknown function DUF28  54.43 
 
 		 255 aa  262  3e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2653  protein of unknown function DUF28  56.44 
 
 		 226 aa  262  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3642  protein of unknown function DUF28  60.42 
 
 		 242 aa  262  3e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2560  hypothetical protein  52.97 
 
 		 237 aa  259  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0097  hypothetical protein  54.85 
 
 		 242 aa  255  4e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0278859 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3516  hypothetical protein  57.63 
 
 		 238 aa  245  3e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12523  hypothetical protein  56.38 
 
 		 248 aa  237  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0752  protein of unknown function DUF28  47.88 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0424  hypothetical protein  48.94 
 
 		 235 aa  213  9.999999999999999e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1514  hypothetical protein  49.79 
 
 		 235 aa  207  1e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0105441  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1389  hypothetical protein  47.46 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.407687  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1081  hypothetical protein  46.81 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.478174  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1306  hypothetical protein  49.36 
 
 		 235 aa  201  9e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.793334  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1187  hypothetical protein  49.36 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0557  hypothetical protein  48.51 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1426  hypothetical protein  43.44 
 
 		 244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0624  hypothetical protein  47.73 
 
 		 244 aa  196  3e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1037  hypothetical protein  47.66 
 
 		 235 aa  194  1e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000707905  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2399  protein of unknown function DUF28  46.82 
 
 		 248 aa  187  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42546  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  45.7 
 
 		 246 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  42.79 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  45.25 
 
 		 246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  44.44 
 
 		 248 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  44.44 
 
 		 248 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  42.59 
 
 		 249 aa  178  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0163  hypothetical protein  44.44 
 
 		 248 aa  178  7e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  42.13 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3380  hypothetical protein  42.98 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  44.29 
 
 		 248 aa  175  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  43.46 
 
 		 247 aa  175  7e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  41.67 
 
 		 248 aa  175  7e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  43.98 
 
 		 248 aa  175  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  43.52 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  41.2 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1219  hypothetical protein  44.75 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.854834 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  44.75 
 
 		 242 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  41.2 
 
 		 246 aa  172  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  43.84 
 
 		 245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  41.12 
 
 		 250 aa  172  5e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  43.52 
 
 		 246 aa  172  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  41.74 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  42.13 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  41.67 
 
 		 248 aa  169  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  39.81 
 
 		 248 aa  168  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0816  hypothetical protein  41.28 
 
 		 243 aa  168  8e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.177048  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  42.47 
 
 		 247 aa  168  9e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  42.47 
 
 		 248 aa  166  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  42.17 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4171  hypothetical protein  39.81 
 
 		 248 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265987  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  39.81 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  40.65 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  41.23 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  39.72 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  41.74 
 
 		 250 aa  165  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  41.74 
 
 		 250 aa  165  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  40.65 
 
 		 250 aa  165  5e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  42.86 
 
 		 251 aa  165  5e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  42.01 
 
 		 248 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  39.91 
 
 		 247 aa  164  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  43.38 
 
 		 247 aa  164  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  43.38 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0967  protein of unknown function DUF28  37.7 
 
 		 266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.021533  hitchhiker  0.000000117284 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  40.18 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  40.79 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  40.79 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  40.79 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2907  hypothetical protein  41.1 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  42.92 
 
 		 247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  40.17 
 
 		 246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  43.38 
 
 		 248 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  42.92 
 
 		 247 aa  162  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1989  hypothetical protein  40.27 
 
 		 252 aa  161  8.000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0129309 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  40.17 
 
 		 246 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  40.17 
 
 		 246 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  40.17 
 
 		 246 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  40.17 
 
 		 246 aa  161  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  40.35 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  41.1 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  40.35 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2325  hypothetical protein  41.36 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.667141  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  40.74 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  41.92 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  41.1 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  40.17 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2729  hypothetical protein  38.43 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  40.17 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  40.79 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  40.17 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  40.17 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  42.33 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  40.17 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  40.17 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  38.71 
 
 		 243 aa  160  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13930  conserved hypothetical protein TIGR01033  41.56 
 
 		 254 aa  159  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0487372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>