More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0424 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0424  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  476  1e-133  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1037  hypothetical protein  83.4 
 
 
235 aa  375  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000707905  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1514  hypothetical protein  80.85 
 
 
235 aa  365  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0105441  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1426  hypothetical protein  69.67 
 
 
244 aa  327  7e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1081  hypothetical protein  72.34 
 
 
235 aa  323  1e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.478174  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0557  hypothetical protein  72.34 
 
 
235 aa  318  3.9999999999999996e-86  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1306  hypothetical protein  72.77 
 
 
235 aa  317  1e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.793334  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1187  hypothetical protein  72.77 
 
 
235 aa  317  1e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0752  protein of unknown function DUF28  59.15 
 
 
236 aa  288  4e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1389  hypothetical protein  60 
 
 
236 aa  270  1e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.407687  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0228  protein of unknown function DUF28  47.46 
 
 
255 aa  235  4e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1650  hypothetical protein  48.94 
 
 
236 aa  234  8e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0097  hypothetical protein  46.81 
 
 
242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0278859 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2560  hypothetical protein  46.75 
 
 
237 aa  223  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2653  protein of unknown function DUF28  47.75 
 
 
226 aa  216  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1990  hypothetical protein  43.16 
 
 
239 aa  206  3e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1612  hypothetical protein  42.26 
 
 
240 aa  205  6e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00192145  normal  0.534654 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3642  protein of unknown function DUF28  47.92 
 
 
242 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3516  hypothetical protein  46.58 
 
 
238 aa  196  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2184  hypothetical protein  43.93 
 
 
240 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1765  hypothetical protein  43.93 
 
 
240 aa  191  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.874851  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1694  hypothetical protein  43.93 
 
 
240 aa  191  7e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534386  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0624  hypothetical protein  42.06 
 
 
244 aa  185  6e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1210  protein of unknown function DUF28  40.53 
 
 
243 aa  177  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  42.67 
 
 
248 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  43.35 
 
 
246 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  42.67 
 
 
248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  42.67 
 
 
248 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  41.38 
 
 
253 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  42.73 
 
 
248 aa  170  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  42.73 
 
 
248 aa  170  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12523  hypothetical protein  45.12 
 
 
248 aa  170  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  42.67 
 
 
248 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  42.29 
 
 
248 aa  169  5e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  38.86 
 
 
248 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  39.04 
 
 
247 aa  166  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  40.53 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  40.53 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2729  hypothetical protein  37.99 
 
 
248 aa  166  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31246  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  40.64 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  39.3 
 
 
248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  40.45 
 
 
250 aa  162  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  38.2 
 
 
248 aa  161  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  40.09 
 
 
245 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2114  hypothetical protein  36.68 
 
 
248 aa  160  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.308852  normal  0.355584 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  39.21 
 
 
246 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4171  hypothetical protein  37.55 
 
 
248 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265987  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  38.94 
 
 
243 aa  160  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  40.44 
 
 
246 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  39.91 
 
 
247 aa  159  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  41.1 
 
 
246 aa  159  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3380  hypothetical protein  40.95 
 
 
255 aa  159  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3525  hypothetical protein  37.99 
 
 
248 aa  159  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  39.17 
 
 
246 aa  159  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  39.55 
 
 
246 aa  159  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  41.2 
 
 
248 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  40 
 
 
250 aa  158  6e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  41.1 
 
 
247 aa  158  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  40.64 
 
 
247 aa  157  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  41.33 
 
 
248 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  40.72 
 
 
250 aa  157  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  37.28 
 
 
252 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0419  hypothetical protein  41.33 
 
 
254 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.26819  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3179  protein of unknown function DUF28  39.19 
 
 
250 aa  156  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1650  protein of unknown function DUF28  36.6 
 
 
247 aa  157  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  40.09 
 
 
250 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0163  hypothetical protein  40.53 
 
 
248 aa  156  2e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  39.27 
 
 
247 aa  155  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3509  hypothetical protein  40.44 
 
 
248 aa  155  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.208978 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2399  protein of unknown function DUF28  39.09 
 
 
248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42546  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  36.91 
 
 
248 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  38.81 
 
 
247 aa  154  8e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  37.5 
 
 
248 aa  154  8e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  38.26 
 
 
249 aa  154  9e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  36.91 
 
 
248 aa  154  9e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  37.34 
 
 
253 aa  154  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  37.87 
 
 
247 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  36.91 
 
 
248 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2594  hypothetical protein  38.96 
 
 
252 aa  153  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000460429 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  38.81 
 
 
247 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1287  hypothetical protein  39.74 
 
 
248 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  40.45 
 
 
250 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0816  hypothetical protein  40.09 
 
 
243 aa  153  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.177048  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  40.61 
 
 
251 aa  153  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  36.91 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  36.48 
 
 
248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6910  hypothetical protein  40.44 
 
 
248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.311344 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  36.99 
 
 
248 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  37.34 
 
 
248 aa  152  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  36.48 
 
 
248 aa  152  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  37.23 
 
 
246 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  37.23 
 
 
246 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  37.23 
 
 
246 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  37.23 
 
 
246 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.074562 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  36.8 
 
 
246 aa  152  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  36.8 
 
 
246 aa  152  5e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  36.8 
 
 
246 aa  152  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  36.8 
 
 
246 aa  152  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  36.8 
 
 
246 aa  152  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  36.8 
 
 
246 aa  152  5e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>