More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1990 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1990  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  491  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2560  hypothetical protein  84.32 
 
 		 237 aa  423  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12523  hypothetical protein  72.98 
 
 		 248 aa  346  2e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0228  protein of unknown function DUF28  67.09 
 
 		 255 aa  330  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_002950  PG0097  hypothetical protein  59.83 
 
 		 242 aa  295  5e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0278859 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3642  protein of unknown function DUF28  62.5 
 
 		 242 aa  285  5e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2653  protein of unknown function DUF28  60.27 
 
 		 226 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3516  hypothetical protein  57.56 
 
 		 238 aa  266  2.9999999999999995e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1650  hypothetical protein  54.66 
 
 		 236 aa  265  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1612  hypothetical protein  50.42 
 
 		 240 aa  235  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00192145  normal  0.534654 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1389  hypothetical protein  51.93 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.407687  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0752  protein of unknown function DUF28  49.36 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2184  hypothetical protein  50.42 
 
 		 240 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1694  hypothetical protein  48.54 
 
 		 240 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534386  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1765  hypothetical protein  48.54 
 
 		 240 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.874851  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0624  hypothetical protein  47.16 
 
 		 244 aa  199  3e-50  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1426  hypothetical protein  43.85 
 
 		 244 aa  191  6e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1037  hypothetical protein  45.02 
 
 		 235 aa  191  7e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000707905  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2399  protein of unknown function DUF28  45.58 
 
 		 248 aa  188  8e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42546  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0424  hypothetical protein  43.72 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1514  hypothetical protein  42.86 
 
 		 235 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0105441  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  43.67 
 
 		 248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  43.67 
 
 		 248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  43.23 
 
 		 248 aa  182  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  42.29 
 
 		 242 aa  180  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  43.04 
 
 		 246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1081  hypothetical protein  42.86 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.478174  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  42.61 
 
 		 246 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  42.08 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  41.92 
 
 		 248 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3509  hypothetical protein  41.92 
 
 		 248 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.208978 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  42.79 
 
 		 248 aa  176  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  41.67 
 
 		 246 aa  175  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  41.92 
 
 		 248 aa  175  5e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1306  hypothetical protein  43.72 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.793334  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1187  hypothetical protein  43.72 
 
 		 235 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0768  hypothetical protein  40.35 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0981887  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0557  hypothetical protein  43.72 
 
 		 235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  41.36 
 
 		 248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  41.36 
 
 		 246 aa  172  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4171  hypothetical protein  41.63 
 
 		 248 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265987  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  40.72 
 
 		 248 aa  171  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  40.72 
 
 		 248 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  41.82 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0163  hypothetical protein  40.17 
 
 		 248 aa  169  3e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  37.34 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  39.91 
 
 		 252 aa  169  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  41.36 
 
 		 248 aa  168  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  41.36 
 
 		 248 aa  168  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3030  hypothetical protein  38.53 
 
 		 252 aa  167  9e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.248633  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  39.74 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2729  hypothetical protein  41.18 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0465  hypothetical protein  37.92 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000140686  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2210  hypothetical protein  41.33 
 
 		 245 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1922  hypothetical protein  41.33 
 
 		 245 aa  166  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.541871  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0453  hypothetical protein  37.08 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0190075  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0577  hypothetical protein  36.67 
 
 		 239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00950255  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2305  hypothetical protein  41.89 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119494 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  41.52 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  39.74 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0456  hypothetical protein  36.67 
 
 		 242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.467342  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  42.24 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0510  hypothetical protein  36.67 
 
 		 239 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.887528  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0449  hypothetical protein  36.67 
 
 		 239 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0541  hypothetical protein  36.67 
 
 		 239 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000461831  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3525  hypothetical protein  39.37 
 
 		 248 aa  162  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0541  hypothetical protein  36.67 
 
 		 239 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5905599999999994e-39 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0595  hypothetical protein  36.67 
 
 		 239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0672572  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  41.78 
 
 		 253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2114  hypothetical protein  40 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.308852  normal  0.355584 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2594  hypothetical protein  39.82 
 
 		 252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000460429 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  41.78 
 
 		 253 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4362  hypothetical protein  38.46 
 
 		 255 aa  161  9e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144565 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2507  hypothetical protein  39.22 
 
 		 242 aa  161  9e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.153457  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  40.18 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  40.74 
 
 		 247 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0615  hypothetical protein  36.25 
 
 		 239 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000476022  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4761  hypothetical protein  35.83 
 
 		 239 aa  160  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  hitchhiker  1.64862e-21 
 
 
-
 
NC_002936  DET0444  hypothetical protein  42.15 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  38.57 
 
 		 247 aa  159  4e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3380  hypothetical protein  39.06 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  40.53 
 
 		 251 aa  159  5e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0322  hypothetical protein  36.86 
 
 		 238 aa  158  6e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.535102  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  40.43 
 
 		 251 aa  158  6e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  36.48 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  36.05 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  38.2 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_386  hypothetical protein  41.7 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0718  hypothetical protein  36.28 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  40.62 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  36.05 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  38.53 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  41.45 
 
 		 248 aa  155  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  40.74 
 
 		 250 aa  155  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1287  hypothetical protein  41.18 
 
 		 248 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2722  hypothetical protein  40.35 
 
 		 240 aa  155  7e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0967  protein of unknown function DUF28  35.34 
 
 		 266 aa  154  9e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.021533  hitchhiker  0.000000117284 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0816  hypothetical protein  37.45 
 
 		 243 aa  154  9e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.177048  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1615  hypothetical protein  39.25 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  39.22 
 
 		 248 aa  153  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>