More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_386 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_386  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  512  1e-144  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0444  hypothetical protein  98.01 
 
 		 251 aa  504  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0421  hypothetical protein  93.23 
 
 		 251 aa  457  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  54.22 
 
 		 253 aa  275  5e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  54.47 
 
 		 247 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  51.61 
 
 		 250 aa  266  2.9999999999999995e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  52.65 
 
 		 246 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  55.28 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  54.88 
 
 		 247 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  54.88 
 
 		 247 aa  260  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  53.66 
 
 		 247 aa  259  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  53.66 
 
 		 247 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  51.65 
 
 		 243 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0996  hypothetical protein  51.42 
 
 		 249 aa  256  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  52.44 
 
 		 247 aa  255  5e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2594  hypothetical protein  51.59 
 
 		 252 aa  254  8e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000460429 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  53.66 
 
 		 252 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  51.39 
 
 		 253 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  49.79 
 
 		 246 aa  251  5.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  51 
 
 		 253 aa  251  1e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  50.81 
 
 		 251 aa  250  2e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  53.72 
 
 		 248 aa  248  5e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3030  hypothetical protein  47.81 
 
 		 252 aa  248  5e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.248633  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  52.24 
 
 		 247 aa  247  1e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1704  hypothetical protein  53.01 
 
 		 252 aa  247  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000609953  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  51.82 
 
 		 249 aa  246  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0718  hypothetical protein  50 
 
 		 255 aa  246  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  49.58 
 
 		 250 aa  245  4e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  50.21 
 
 		 250 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1220  hypothetical protein  51.43 
 
 		 248 aa  245  6e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  49.6 
 
 		 250 aa  244  6.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0986  hypothetical protein  51.64 
 
 		 247 aa  244  9e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  48.95 
 
 		 250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  50 
 
 		 250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4362  hypothetical protein  49.6 
 
 		 255 aa  243  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144565 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  49.58 
 
 		 242 aa  242  5e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0496  hypothetical protein  47.6 
 
 		 250 aa  241  7.999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.813063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  49.16 
 
 		 242 aa  241  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  49.8 
 
 		 248 aa  239  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  49.59 
 
 		 250 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  49.59 
 
 		 247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3201  hypothetical protein  52.87 
 
 		 247 aa  238  5e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.044565 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2125  hypothetical protein  49.59 
 
 		 248 aa  238  6.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1318  hypothetical protein  51.84 
 
 		 250 aa  237  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0714247  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1106  hypothetical protein  50.62 
 
 		 252 aa  237  1e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  49.39 
 
 		 252 aa  237  1e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1219  protein of unknown function DUF28  50 
 
 		 250 aa  236  2e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.100847  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  51.67 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1899  hypothetical protein  49.59 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000661567  hitchhiker  0.000893936 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2079  hypothetical protein  49.59 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00551786  hitchhiker  0.0017448 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1954  hypothetical protein  49.59 
 
 		 248 aa  236  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.04417  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  49.59 
 
 		 248 aa  236  4e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0807  hypothetical protein  52.23 
 
 		 251 aa  235  4e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  50.61 
 
 		 248 aa  235  5.0000000000000005e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  48.37 
 
 		 248 aa  235  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  48.77 
 
 		 246 aa  234  9e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  48.77 
 
 		 246 aa  234  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  48.77 
 
 		 246 aa  234  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  48.77 
 
 		 246 aa  234  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  48.77 
 
 		 246 aa  234  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  48.77 
 
 		 246 aa  234  9e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  48.77 
 
 		 246 aa  234  9e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  48.77 
 
 		 246 aa  234  9e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  48.77 
 
 		 246 aa  234  9e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3629  hypothetical protein  49.17 
 
 		 252 aa  234  9e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000422691  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  48.77 
 
 		 246 aa  234  9e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  48.36 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  51.25 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  48.36 
 
 		 246 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  47.95 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  50.41 
 
 		 245 aa  232  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  48.36 
 
 		 246 aa  232  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  48.58 
 
 		 248 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0925  protein of unknown function DUF28  49.39 
 
 		 250 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.488101  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  48.99 
 
 		 249 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  47.56 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  48.94 
 
 		 248 aa  229  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51810  hypothetical protein  48.18 
 
 		 248 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73043  hitchhiker  0.0000547975 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2117  protein of unknown function DUF28  49.37 
 
 		 247 aa  229  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.892674  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1634  protein of unknown function DUF28  47.81 
 
 		 252 aa  229  3e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1368  hypothetical protein  49.39 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  47.76 
 
 		 248 aa  229  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  49.17 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  49.17 
 
 		 250 aa  229  3e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  47.54 
 
 		 247 aa  229  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1615  hypothetical protein  48.37 
 
 		 249 aa  229  4e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4410  hypothetical protein  51.02 
 
 		 248 aa  228  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.150505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0816  hypothetical protein  47.33 
 
 		 243 aa  227  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.177048  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  48.16 
 
 		 248 aa  227  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  43.95 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1228  hypothetical protein  50 
 
 		 252 aa  226  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1792  hypothetical protein  46.96 
 
 		 249 aa  226  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.165315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0508  hypothetical protein  48.77 
 
 		 246 aa  226  2e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  47.76 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  47.56 
 
 		 247 aa  226  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  48.99 
 
 		 248 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1371  protein of unknown function DUF28  46.31 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.82714  normal  0.0256064 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0501  protein of unknown function DUF28  45.71 
 
 		 249 aa  226  3e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15040  conserved hypothetical protein TIGR01033  49.59 
 
 		 249 aa  226  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6116  hypothetical protein  48.99 
 
 		 250 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.701892  normal  0.165467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>