More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3516 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3516  hypothetical protein  100 
 
 		 238 aa  481  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1990  hypothetical protein  57.56 
 
 		 239 aa  293  2e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2560  hypothetical protein  55.08 
 
 		 237 aa  276  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1650  hypothetical protein  57.63 
 
 		 236 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0097  hypothetical protein  56.07 
 
 		 242 aa  267  1e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0278859 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0228  protein of unknown function DUF28  52.54 
 
 		 255 aa  259  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2653  protein of unknown function DUF28  56.7 
 
 		 226 aa  254  6e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3642  protein of unknown function DUF28  55.37 
 
 		 242 aa  246  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0752  protein of unknown function DUF28  51.91 
 
 		 236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12523  hypothetical protein  56.68 
 
 		 248 aa  242  3.9999999999999997e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1612  hypothetical protein  47.08 
 
 		 240 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00192145  normal  0.534654 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2184  hypothetical protein  47.92 
 
 		 240 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1694  hypothetical protein  47.92 
 
 		 240 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534386  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1765  hypothetical protein  47.92 
 
 		 240 aa  220  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.874851  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1389  hypothetical protein  48.73 
 
 		 236 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.407687  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1514  hypothetical protein  47.44 
 
 		 235 aa  209  4e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0105441  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1037  hypothetical protein  47.01 
 
 		 235 aa  204  9e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000707905  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0624  hypothetical protein  45.22 
 
 		 244 aa  201  7e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  45.65 
 
 		 246 aa  198  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0424  hypothetical protein  46.58 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1081  hypothetical protein  45.73 
 
 		 235 aa  194  9e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.478174  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1306  hypothetical protein  46.15 
 
 		 235 aa  189  5e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.793334  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1187  hypothetical protein  46.15 
 
 		 235 aa  188  5e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1426  hypothetical protein  43.21 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  43.48 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0557  hypothetical protein  46.15 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  43.66 
 
 		 247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  41.92 
 
 		 245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2399  protein of unknown function DUF28  43.18 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42546  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  44.04 
 
 		 248 aa  179  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  42.34 
 
 		 252 aa  179  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  45.13 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  42.92 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  41.92 
 
 		 242 aa  179  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  44.86 
 
 		 247 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  43.95 
 
 		 246 aa  178  7e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  44.86 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  43.81 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  41.48 
 
 		 250 aa  176  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  43.61 
 
 		 248 aa  176  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0479  hypothetical protein  41.41 
 
 		 250 aa  175  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000314446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0508  hypothetical protein  41.85 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  38.36 
 
 		 243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1842  hypothetical protein  38.77 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  42.92 
 
 		 248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  42.73 
 
 		 253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0025  hypothetical protein  44.44 
 
 		 243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  42.92 
 
 		 248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0816  hypothetical protein  38.79 
 
 		 243 aa  172  5e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.177048  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2432  hypothetical protein  39.65 
 
 		 246 aa  172  5.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.037804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  41.13 
 
 		 248 aa  171  7.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  40.83 
 
 		 250 aa  171  9e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2779  hypothetical protein  40.97 
 
 		 247 aa  170  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0375824  normal  0.0326422 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  38.36 
 
 		 250 aa  170  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  42.4 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  41.67 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0163  hypothetical protein  44.49 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  42.29 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2113  hypothetical protein  40.44 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00850732 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  40.09 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  40.44 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  40.44 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  42.61 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  40.44 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  40.44 
 
 		 246 aa  169  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  41.3 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  40 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  40 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  40 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  38.77 
 
 		 247 aa  169  5e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  39.56 
 
 		 246 aa  168  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  41.88 
 
 		 248 aa  168  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0060  hypothetical protein  41.59 
 
 		 250 aa  168  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0149328  normal  0.895421 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0059  hypothetical protein  41.59 
 
 		 250 aa  168  6e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.852085  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  39.56 
 
 		 246 aa  168  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  39.21 
 
 		 247 aa  168  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  39.56 
 
 		 246 aa  168  6e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2210  hypothetical protein  42.04 
 
 		 245 aa  168  6e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1922  hypothetical protein  42.04 
 
 		 245 aa  168  6e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.541871  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_386  hypothetical protein  45.75 
 
 		 251 aa  168  6e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  39.56 
 
 		 246 aa  168  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  39.56 
 
 		 246 aa  168  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  39.56 
 
 		 246 aa  168  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0444  hypothetical protein  45.28 
 
 		 251 aa  168  8e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  41.59 
 
 		 248 aa  168  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2594  hypothetical protein  39.66 
 
 		 252 aa  168  9e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000460429 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  38.6 
 
 		 246 aa  168  9e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4362  hypothetical protein  41.38 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144565 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  41.59 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2101  hypothetical protein  38.77 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  38.43 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  41.47 
 
 		 247 aa  166  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2033  hypothetical protein  39.65 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00594875  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4544  hypothetical protein  41.85 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.528574  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  38.72 
 
 		 242 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  38.33 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  39.01 
 
 		 248 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  37.61 
 
 		 250 aa  166  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2158  hypothetical protein  38.77 
 
 		 247 aa  166  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2424  hypothetical protein  39.65 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.079823  normal  0.460299 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>