More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0228 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0228  protein of unknown function DUF28  100 
 
 		 255 aa  521  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2560  hypothetical protein  67.93 
 
 		 237 aa  333  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1990  hypothetical protein  67.09 
 
 		 239 aa  330  2e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2653  protein of unknown function DUF28  67.41 
 
 		 226 aa  324  6e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0097  hypothetical protein  63.45 
 
 		 242 aa  305  5.0000000000000004e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0278859 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3642  protein of unknown function DUF28  60.42 
 
 		 242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12523  hypothetical protein  61.32 
 
 		 248 aa  262  3e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1650  hypothetical protein  54.43 
 
 		 236 aa  262  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0752  protein of unknown function DUF28  50.63 
 
 		 236 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3516  hypothetical protein  52.54 
 
 		 238 aa  236  3e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1612  hypothetical protein  48.95 
 
 		 240 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00192145  normal  0.534654 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1389  hypothetical protein  50.63 
 
 		 236 aa  225  4e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.407687  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1426  hypothetical protein  49.18 
 
 		 244 aa  222  4e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1694  hypothetical protein  49.37 
 
 		 240 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534386  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1765  hypothetical protein  49.37 
 
 		 240 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.874851  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2184  hypothetical protein  48.54 
 
 		 240 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0424  hypothetical protein  47.46 
 
 		 235 aa  218  1e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0624  hypothetical protein  48.03 
 
 		 244 aa  211  7.999999999999999e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1037  hypothetical protein  46.61 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000707905  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1306  hypothetical protein  47.88 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.793334  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1187  hypothetical protein  47.88 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1081  hypothetical protein  46.61 
 
 		 235 aa  198  6e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.478174  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1514  hypothetical protein  46.61 
 
 		 235 aa  198  6e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0105441  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0557  hypothetical protein  48.31 
 
 		 235 aa  198  7e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  42.36 
 
 		 246 aa  186  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  42.79 
 
 		 246 aa  185  6e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  41.3 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  41.1 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  43.11 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  39.65 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  41.56 
 
 		 248 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  41.13 
 
 		 248 aa  175  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0768  hypothetical protein  39.04 
 
 		 240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0981887  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  40.79 
 
 		 252 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  38.7 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  41.01 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  40 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2507  hypothetical protein  39.91 
 
 		 242 aa  167  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.153457  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  40.74 
 
 		 250 aa  166  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3509  hypothetical protein  40.44 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.208978 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  40.89 
 
 		 246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  40.44 
 
 		 248 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  40.89 
 
 		 248 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  40.44 
 
 		 248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  40.55 
 
 		 247 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  40 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3380  hypothetical protein  38.56 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2399  protein of unknown function DUF28  40.35 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42546  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  39.91 
 
 		 249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  40 
 
 		 248 aa  163  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  40 
 
 		 248 aa  163  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  38.67 
 
 		 248 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  38.67 
 
 		 248 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  38.53 
 
 		 250 aa  163  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0163  hypothetical protein  38.67 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1650  protein of unknown function DUF28  38.72 
 
 		 247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2114  hypothetical protein  39.74 
 
 		 248 aa  162  6e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.308852  normal  0.355584 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2729  hypothetical protein  39.56 
 
 		 248 aa  162  6e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31246  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  36.75 
 
 		 247 aa  161  8.000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  41.01 
 
 		 250 aa  161  8.000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4171  hypothetical protein  39.56 
 
 		 248 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265987  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  41.01 
 
 		 247 aa  161  9e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  39.66 
 
 		 251 aa  161  9e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  38.1 
 
 		 250 aa  161  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  41.01 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  36.41 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1269  hypothetical protein  39.06 
 
 		 249 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196217  normal  0.639481 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3525  hypothetical protein  38.67 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0742  hypothetical protein  38.16 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  38.43 
 
 		 251 aa  159  4e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  39.74 
 
 		 246 aa  158  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1210  protein of unknown function DUF28  37.12 
 
 		 243 aa  158  8e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3030  hypothetical protein  37.99 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.248633  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0496  hypothetical protein  42.33 
 
 		 250 aa  158  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.813063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1106  hypothetical protein  38.43 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  38.03 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  37.61 
 
 		 248 aa  158  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  41.01 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  38.43 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  38.22 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  38.43 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0465  hypothetical protein  36.71 
 
 		 239 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000140686  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36720  hypothetical protein  37.55 
 
 		 249 aa  155  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2775  hypothetical protein  39.15 
 
 		 255 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1615  hypothetical protein  36.28 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  38.86 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0816  hypothetical protein  36.24 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.177048  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1151  hypothetical protein  38.46 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1103  hypothetical protein  37.39 
 
 		 243 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000610466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  38.86 
 
 		 252 aa  154  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  36.84 
 
 		 248 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2594  hypothetical protein  39.22 
 
 		 252 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000460429 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2028  hypothetical protein  39.56 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2054  hypothetical protein  39.56 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  39.17 
 
 		 247 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4001  hypothetical protein  36.96 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0322  hypothetical protein  36.29 
 
 		 238 aa  152  5e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.535102  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1219  hypothetical protein  38.5 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.854834 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1461  hypothetical protein  34.65 
 
 		 240 aa  152  5.9999999999999996e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  38.25 
 
 		 247 aa  151  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>