More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1389 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1389  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  477  1e-134  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.407687  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0752  protein of unknown function DUF28  67.37 
 
 		 236 aa  347  1e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0424  hypothetical protein  60 
 
 		 235 aa  268  7e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1081  hypothetical protein  60 
 
 		 235 aa  263  2e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.478174  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1187  hypothetical protein  60.43 
 
 		 235 aa  254  8e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1306  hypothetical protein  60.43 
 
 		 235 aa  254  9e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.793334  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1426  hypothetical protein  55.33 
 
 		 244 aa  252  3e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0557  hypothetical protein  59.57 
 
 		 235 aa  251  6e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1037  hypothetical protein  57.02 
 
 		 235 aa  250  1e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000707905  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0097  hypothetical protein  50.64 
 
 		 242 aa  249  3e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0278859 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1514  hypothetical protein  56.17 
 
 		 235 aa  249  3e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0105441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2560  hypothetical protein  52.79 
 
 		 237 aa  242  3.9999999999999997e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0228  protein of unknown function DUF28  50.63 
 
 		 255 aa  240  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1990  hypothetical protein  51.93 
 
 		 239 aa  237  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1650  hypothetical protein  47.46 
 
 		 236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3642  protein of unknown function DUF28  50.83 
 
 		 242 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1612  hypothetical protein  43.15 
 
 		 240 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00192145  normal  0.534654 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2653  protein of unknown function DUF28  45.13 
 
 		 226 aa  201  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3516  hypothetical protein  48.73 
 
 		 238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12523  hypothetical protein  52.28 
 
 		 248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2184  hypothetical protein  43.15 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1694  hypothetical protein  43.15 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534386  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1765  hypothetical protein  43.15 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.874851  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0624  hypothetical protein  42.47 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2399  protein of unknown function DUF28  37.02 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42546  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  40.54 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  39.63 
 
 		 248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1210  protein of unknown function DUF28  37.5 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  38.71 
 
 		 247 aa  150  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  38.2 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  36.32 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  39.91 
 
 		 249 aa  149  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  39.91 
 
 		 248 aa  149  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  38.96 
 
 		 248 aa  149  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  36.87 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  38.71 
 
 		 247 aa  149  5e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  41.1 
 
 		 248 aa  148  8e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  41.1 
 
 		 248 aa  148  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0371  hypothetical protein  38.43 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00064064  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0768  hypothetical protein  35.19 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0981887  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  38.99 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2365  hypothetical protein  36.21 
 
 		 247 aa  146  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00180131  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  37.79 
 
 		 247 aa  145  6e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0124  hypothetical protein  34.87 
 
 		 239 aa  145  6e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  37.5 
 
 		 247 aa  145  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0163  hypothetical protein  39.45 
 
 		 248 aa  145  6e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  36.41 
 
 		 247 aa  144  9e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  36.87 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  34.42 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  36.41 
 
 		 247 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0137  hypothetical protein  35.34 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.153689  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3509  hypothetical protein  38.07 
 
 		 248 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.208978 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  39.21 
 
 		 248 aa  143  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0718  hypothetical protein  36.65 
 
 		 255 aa  142  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  35.68 
 
 		 253 aa  142  6e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0985  hypothetical protein  36.29 
 
 		 252 aa  142  6e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  38.71 
 
 		 246 aa  142  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2305  hypothetical protein  41.01 
 
 		 248 aa  141  8e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119494 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3178  protein of unknown function DUF28  35.47 
 
 		 249 aa  141  8e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.777297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2215  hypothetical protein  38.46 
 
 		 243 aa  141  8e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0612934 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  34.48 
 
 		 248 aa  141  9e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2729  hypothetical protein  37.04 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  37.5 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  36.8 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  36.84 
 
 		 253 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3030  hypothetical protein  35.51 
 
 		 252 aa  140  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.248633  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  36.65 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2574  hypothetical protein  33.62 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000592568  hitchhiker  0.00160004 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2117  protein of unknown function DUF28  35.02 
 
 		 247 aa  139  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.892674  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1650  protein of unknown function DUF28  35.47 
 
 		 247 aa  139  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  35.62 
 
 		 250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3525  hypothetical protein  36.57 
 
 		 248 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  36.17 
 
 		 246 aa  139  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1658  hypothetical protein  35.74 
 
 		 242 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  37.5 
 
 		 250 aa  138  6e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1461  hypothetical protein  36.41 
 
 		 240 aa  138  6e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3911  protein of unknown function DUF28  34.26 
 
 		 249 aa  138  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.662224  normal  0.0433199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4362  hypothetical protein  36.2 
 
 		 255 aa  138  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.144565 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03175  hypothetical protein  33.05 
 
 		 240 aa  138  7e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  37.5 
 
 		 250 aa  138  7.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07036  hypothetical protein  34.73 
 
 		 238 aa  138  8.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3547  protein of unknown function DUF28  34.86 
 
 		 250 aa  137  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0132193  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  35.19 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0550  hypothetical protein  33.05 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.105783  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  31.96 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2306  hypothetical protein  36.48 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00197948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  37.16 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2039  hypothetical protein  36.48 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000194196  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  36.53 
 
 		 250 aa  136  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2041  hypothetical protein  36.48 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000668061  hitchhiker  0.0000000668977 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  36.7 
 
 		 251 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1936  hypothetical protein  35.34 
 
 		 248 aa  135  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2063  hypothetical protein  35.12 
 
 		 241 aa  135  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.804932 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1106  hypothetical protein  35.78 
 
 		 252 aa  135  5e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2210  hypothetical protein  34.65 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4169  hypothetical protein  32.77 
 
 		 241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.652416  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2422  hypothetical protein  36.48 
 
 		 248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000138795  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2522  hypothetical protein  36.2 
 
 		 241 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2492  hypothetical protein  35.47 
 
 		 250 aa  134  9e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  33.8 
 
 		 249 aa  134  9e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.649879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>