More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3642 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3642  protein of unknown function DUF28  100 
 
 		 242 aa  495  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1990  hypothetical protein  62.5 
 
 		 239 aa  307  8e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0228  protein of unknown function DUF28  64.17 
 
 		 255 aa  304  7e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2560  hypothetical protein  62.92 
 
 		 237 aa  300  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1650  hypothetical protein  60.42 
 
 		 236 aa  283  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2653  protein of unknown function DUF28  58.77 
 
 		 226 aa  263  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0097  hypothetical protein  53.72 
 
 		 242 aa  262  4e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0278859 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1612  hypothetical protein  53.33 
 
 		 240 aa  260  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00192145  normal  0.534654 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12523  hypothetical protein  59.84 
 
 		 248 aa  257  1e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0752  protein of unknown function DUF28  52.08 
 
 		 236 aa  249  2e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2184  hypothetical protein  54.17 
 
 		 240 aa  248  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1765  hypothetical protein  54.17 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.874851  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1694  hypothetical protein  54.17 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534386  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3516  hypothetical protein  55.37 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1389  hypothetical protein  50.83 
 
 		 236 aa  227  1e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.407687  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1426  hypothetical protein  49.59 
 
 		 244 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0424  hypothetical protein  47.92 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1081  hypothetical protein  48.75 
 
 		 235 aa  195  6e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.478174  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0624  hypothetical protein  45.73 
 
 		 244 aa  192  5e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1187  hypothetical protein  50.21 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1306  hypothetical protein  50.21 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.793334  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0557  hypothetical protein  49.38 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1037  hypothetical protein  47.92 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000707905  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0958  protein of unknown function DUF28  41.82 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1514  hypothetical protein  45 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0105441  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  44.54 
 
 		 249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  43.91 
 
 		 248 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0163  hypothetical protein  42.79 
 
 		 248 aa  172  5e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  42.79 
 
 		 248 aa  168  6e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  42.79 
 
 		 248 aa  168  6e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  42.13 
 
 		 246 aa  168  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3509  hypothetical protein  43.04 
 
 		 248 aa  168  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.208978 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  42.13 
 
 		 248 aa  168  8e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  43.48 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1487  hypothetical protein  43.11 
 
 		 247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000223264  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  41.7 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  41.7 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  43.35 
 
 		 247 aa  166  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2075  hypothetical protein  39.91 
 
 		 242 aa  165  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.116774  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  42.01 
 
 		 250 aa  164  8e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  43.04 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  40.6 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  42.79 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0542  hypothetical protein  42.47 
 
 		 250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  41.55 
 
 		 250 aa  162  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  43.1 
 
 		 247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  43.04 
 
 		 246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1219  hypothetical protein  42.55 
 
 		 249 aa  162  6e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.854834 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1650  protein of unknown function DUF28  40.95 
 
 		 247 aa  161  1e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  41.56 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  39.15 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  40.18 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3380  hypothetical protein  40.08 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1748  hypothetical protein  39.66 
 
 		 249 aa  159  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.649879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2399  protein of unknown function DUF28  40.95 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42546  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  41.07 
 
 		 247 aa  159  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2114  hypothetical protein  37.77 
 
 		 248 aa  159  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.308852  normal  0.355584 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  41.1 
 
 		 250 aa  159  5e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3030  hypothetical protein  36.64 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.248633  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  40.34 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  38.2 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1435  hypothetical protein  39.42 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748903  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  41.38 
 
 		 247 aa  156  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  41.07 
 
 		 247 aa  156  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003925  hypothetical protein  38.89 
 
 		 248 aa  155  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00219055  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0685  hypothetical protein  39.91 
 
 		 251 aa  155  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0454  hypothetical protein  40.34 
 
 		 253 aa  155  6e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.588948  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2729  hypothetical protein  39.74 
 
 		 248 aa  154  9e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  38.86 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0469  hypothetical protein  40.09 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  39.22 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1210  protein of unknown function DUF28  38.75 
 
 		 243 aa  154  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1817  hypothetical protein  37.93 
 
 		 247 aa  153  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.670174  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0496  hypothetical protein  41.1 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.813063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  39.22 
 
 		 247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0816  hypothetical protein  36.86 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.177048  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0768  hypothetical protein  39.57 
 
 		 240 aa  152  4e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0981887  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2078  hypothetical protein  38.36 
 
 		 248 aa  152  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.283628  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  39.22 
 
 		 246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  39.22 
 
 		 246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  39.22 
 
 		 246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1348  hypothetical protein  39.22 
 
 		 246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00414949 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2058  hypothetical protein  39.22 
 
 		 246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.074562 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  39.22 
 
 		 246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  39.22 
 
 		 246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1224  hypothetical protein  39.22 
 
 		 246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.171474  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  39.22 
 
 		 246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2053  hypothetical protein  39.22 
 
 		 246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  38.74 
 
 		 250 aa  151  8e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  38.79 
 
 		 246 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2432  hypothetical protein  38.72 
 
 		 248 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  38.79 
 
 		 246 aa  151  8.999999999999999e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1151  hypothetical protein  37.5 
 
 		 250 aa  150  1e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2117  protein of unknown function DUF28  38.2 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.892674  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2260  hypothetical protein  37.5 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1886  hypothetical protein  37.5 
 
 		 248 aa  150  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3525  hypothetical protein  38.86 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  38.79 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  37.61 
 
 		 243 aa  151  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2335  hypothetical protein  40.6 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000225431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>