More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1081 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1081  hypothetical protein  100 
 
 		 235 aa  476  1e-133  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.478174  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1306  hypothetical protein  91.49 
 
 		 235 aa  392  1e-108  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.793334  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1187  hypothetical protein  91.49 
 
 		 235 aa  392  1e-108  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0557  hypothetical protein  90.64 
 
 		 235 aa  390  1e-107  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0424  hypothetical protein  72.34 
 
 		 235 aa  329  3e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1514  hypothetical protein  73.62 
 
 		 235 aa  322  3e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0105441  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1037  hypothetical protein  71.91 
 
 		 235 aa  318  3e-86  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000707905  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1426  hypothetical protein  67.21 
 
 		 244 aa  311  7.999999999999999e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0752  protein of unknown function DUF28  60.43 
 
 		 236 aa  297  1e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1389  hypothetical protein  60 
 
 		 236 aa  270  1e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.407687  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1650  hypothetical protein  46.81 
 
 		 236 aa  223  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0097  hypothetical protein  45.96 
 
 		 242 aa  222  4.9999999999999996e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0278859 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0228  protein of unknown function DUF28  46.61 
 
 		 255 aa  220  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1612  hypothetical protein  44.35 
 
 		 240 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00192145  normal  0.534654 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2560  hypothetical protein  45.89 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2653  protein of unknown function DUF28  46.85 
 
 		 226 aa  206  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1990  hypothetical protein  42.86 
 
 		 239 aa  202  4e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3642  protein of unknown function DUF28  48.75 
 
 		 242 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3516  hypothetical protein  45.73 
 
 		 238 aa  194  7e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1694  hypothetical protein  45.19 
 
 		 240 aa  194  9e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.534386  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1765  hypothetical protein  45.19 
 
 		 240 aa  194  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.874851  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2184  hypothetical protein  44.77 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0624  hypothetical protein  43.78 
 
 		 244 aa  184  7e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1210  protein of unknown function DUF28  40.97 
 
 		 243 aa  178  7e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12523  hypothetical protein  46.25 
 
 		 248 aa  176  4e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1449  hypothetical protein  43.18 
 
 		 246 aa  171  9e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3214  hypothetical protein  42.67 
 
 		 248 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0924  hypothetical protein  41.41 
 
 		 246 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3509  hypothetical protein  41.33 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.208978 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1200  hypothetical protein  40.89 
 
 		 248 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2641  hypothetical protein  40.44 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1650  protein of unknown function DUF28  39.15 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1717  hypothetical protein  40.44 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1660  hypothetical protein  40.44 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2673  hypothetical protein  40.64 
 
 		 247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000969674  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1893  hypothetical protein  39.83 
 
 		 246 aa  161  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.519482  normal  0.766951 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0743  hypothetical protein  38.81 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000326938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3192  hypothetical protein  40.44 
 
 		 249 aa  160  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1905  hypothetical protein  41.33 
 
 		 246 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.192843 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2524  hypothetical protein  38.77 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.4403  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0655  hypothetical protein  40.89 
 
 		 248 aa  158  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2308  hypothetical protein  40.89 
 
 		 248 aa  158  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.431489  normal  0.117154 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0165  hypothetical protein  40 
 
 		 250 aa  158  9e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0577  hypothetical protein  40.44 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.236121  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1074  hypothetical protein  38.6 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.414553  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1416  hypothetical protein  38.81 
 
 		 247 aa  156  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000254749  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3631  hypothetical protein  40.28 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0181  hypothetical protein  40.65 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12350  hypothetical protein  39.39 
 
 		 253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242675  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4273  hypothetical protein  37.12 
 
 		 248 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.538279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1371  protein of unknown function DUF28  37.27 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.82714  normal  0.0256064 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0475  hypothetical protein  42.29 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0657  hypothetical protein  38.64 
 
 		 250 aa  153  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.384968  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0536  hypothetical protein  39.66 
 
 		 245 aa  153  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.297552  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1245  hypothetical protein  37.9 
 
 		 247 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.136267  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1643  hypothetical protein  39.09 
 
 		 250 aa  152  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0816  hypothetical protein  38.99 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.177048  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4807  hypothetical protein  37.12 
 
 		 248 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3398  protein of unknown function DUF28  37.18 
 
 		 255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438869  decreased coverage  0.000000218577 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0163  hypothetical protein  38.22 
 
 		 248 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1276  hypothetical protein  37.17 
 
 		 243 aa  151  8.999999999999999e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2096  hypothetical protein  36.7 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.803403  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3490  hypothetical protein  41.18 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0933  hypothetical protein  36.53 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000814789 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1800  hypothetical protein  38.86 
 
 		 250 aa  149  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00453018 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1793  protein of unknown function DUF28  36.36 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.209564  normal  0.104344 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2305  hypothetical protein  37.96 
 
 		 248 aa  149  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0119494 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2594  hypothetical protein  38.96 
 
 		 252 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000460429 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3313  hypothetical protein  36.53 
 
 		 247 aa  148  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0825  protein of unknown function DUF28  37.16 
 
 		 249 aa  148  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.141355  normal  0.0381393 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15040  conserved hypothetical protein TIGR01033  36.36 
 
 		 249 aa  148  7e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.105495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0496  hypothetical protein  39.09 
 
 		 250 aa  147  9e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.813063  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01835  hypothetical protein  37.66 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2094  hypothetical protein  37.66 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2729  hypothetical protein  35.37 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.31246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2600  hypothetical protein  37.66 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.21652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3259  hypothetical protein  40.74 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.977869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4171  hypothetical protein  35.81 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265987  normal  0.79352 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01823  hypothetical protein  37.66 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.562952  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2629  hypothetical protein  37.1 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.404447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2399  protein of unknown function DUF28  36.53 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.42546  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1957  hypothetical protein  37.66 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.522715  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1322  hypothetical protein  37.66 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1776  protein of unknown function DUF28  37.23 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00344475  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1932  protein of unknown function DUF28  36.82 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487076  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1768  hypothetical protein  37.23 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235013  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1884  hypothetical protein  40.28 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1385  hypothetical protein  40.28 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.823747  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2210  hypothetical protein  40.28 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.495132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3380  hypothetical protein  39.15 
 
 		 255 aa  146  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1108  hypothetical protein  37.23 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0618  hypothetical protein  38.89 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.979417  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1075  hypothetical protein  40.28 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511587  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1240  hypothetical protein  40.28 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0366087  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1231  hypothetical protein  40.28 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1301  hypothetical protein  39.53 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17975  normal  0.117692 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0358  hypothetical protein  40.28 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132435  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0982  hypothetical protein  39.29 
 
 		 264 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.501161 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0538  hypothetical protein  37.61 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0792  hypothetical protein  40.28 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.166344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>