More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0402 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007354  Ecaj_0617  30S ribosomal protein S1  95.77 
 
 		 567 aa  1100    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0402  30S ribosomal protein S1  100 
 
 		 567 aa  1136    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1090  30S ribosomal protein S1  56.65 
 
 		 550 aa  580  1e-164  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3882  30S ribosomal protein S1  43.23 
 
 		 561 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237416  normal  0.848573 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3590  30S ribosomal protein S1  43.05 
 
 		 561 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.019363  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0149  30S ribosomal protein S1  43.3 
 
 		 569 aa  444  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3275  30S ribosomal protein S1  43.05 
 
 		 561 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.62304 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3786  30S ribosomal protein S1  43.18 
 
 		 571 aa  442  1e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  hitchhiker  0.000327486 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1025  30S ribosomal protein S1  43.23 
 
 		 558 aa  441  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0436614  normal  0.528214 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0293  30S ribosomal protein S1  43.05 
 
 		 573 aa  434  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0200  30S ribosomal protein S1  43.42 
 
 		 558 aa  435  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0721  30S ribosomal protein S1  41.95 
 
 		 558 aa  431  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0686992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6612  30S ribosomal protein S1  42.97 
 
 		 569 aa  431  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328912  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6076  30S ribosomal protein S1  42.69 
 
 		 569 aa  429  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0675  30S ribosomal protein S1  47.56 
 
 		 582 aa  429  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.690527 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0163  30S ribosomal protein S1  42.08 
 
 		 566 aa  426  1e-118  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97893  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2936  30S ribosomal protein S1  46.24 
 
 		 577 aa  425  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0124  30S ribosomal protein S1  41.57 
 
 		 570 aa  422  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.463891 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0206  30S ribosomal protein S1  42.08 
 
 		 567 aa  422  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.49849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0182  30S ribosomal protein S1  41.57 
 
 		 570 aa  423  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.357984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0103  30S ribosomal protein S1  41.89 
 
 		 569 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503388  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0207  30S ribosomal protein S1  42.03 
 
 		 570 aa  424  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2446  30S ribosomal protein S1  41.65 
 
 		 570 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.822205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2917  30S ribosomal protein S1  40.71 
 
 		 571 aa  421  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.371234  normal  0.0728232 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2229  30S ribosomal protein S1  42.75 
 
 		 571 aa  420  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.516713  normal  0.0580456 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0397  30S ribosomal protein S1  41.9 
 
 		 565 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0168105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0067  30S ribosomal protein S1  42.08 
 
 		 565 aa  422  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605902  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0098  30S ribosomal protein S1  46.44 
 
 		 566 aa  419  1e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0640  30S ribosomal protein S1  41.63 
 
 		 565 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0408  ribosomal protein S1  41.87 
 
 		 553 aa  418  9.999999999999999e-116  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.460478  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0192  30S ribosomal protein S1  41.63 
 
 		 565 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0754  30S ribosomal protein S1  42.94 
 
 		 575 aa  412  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1322  30S ribosomal protein S1  43.83 
 
 		 566 aa  412  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.85252  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1305  30S ribosomal protein S1  42.92 
 
 		 566 aa  404  1e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000305659  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1495  30S ribosomal protein S1  44.99 
 
 		 570 aa  402  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.255625 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0029  30S ribosomal protein S1  41.26 
 
 		 566 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0027  30S ribosomal protein S1  45.13 
 
 		 566 aa  401  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.173864  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0026  30S ribosomal protein S1  45.13 
 
 		 566 aa  401  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3606  30S ribosomal protein S1  45.58 
 
 		 569 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0103  30S ribosomal protein S1  44.4 
 
 		 569 aa  399  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.924927 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0194  30S ribosomal protein S1  43.51 
 
 		 573 aa  396  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.571877  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2456  30S ribosomal protein S1  43.72 
 
 		 569 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3458  30S ribosomal protein S1  43.12 
 
 		 568 aa  394  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  38.86 
 
 		 557 aa  394  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1330  ribosomal protein S1  39.06 
 
 		 560 aa  392  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4360  30S ribosomal protein S1  42.47 
 
 		 567 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294177  hitchhiker  0.00911055 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2466  30S ribosomal protein S1  39.31 
 
 		 557 aa  391  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000206931  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4030  30S ribosomal protein S1  42.47 
 
 		 567 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1736  30S ribosomal protein S1  39.31 
 
 		 555 aa  391  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000968358  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2137  30S ribosomal protein S1  39.26 
 
 		 560 aa  389  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000133883  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2402  30S ribosomal protein S1  38.74 
 
 		 555 aa  383  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02860  30S ribosomal protein S1  37.9 
 
 		 556 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1597  30S ribosomal protein S1  39.45 
 
 		 558 aa  383  1e-105  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1753  30S ribosomal protein S1  39.73 
 
 		 555 aa  383  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374073  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1924  30S ribosomal protein S1  38.74 
 
 		 555 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000191049  unclonable  0.0000000000752303 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2054  30S ribosomal protein S1  38.74 
 
 		 555 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000199699  unclonable  0.0000339472 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1540  30S ribosomal protein S1  39.45 
 
 		 558 aa  383  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1977  30S ribosomal protein S1  38.74 
 
 		 555 aa  383  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000796646  unclonable  0.000000000124259 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0850  30S ribosomal protein S1  40.62 
 
 		 562 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.334273 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00891  30S ribosomal protein S1  39.06 
 
 		 561 aa  382  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0317797  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0909  30S ribosomal protein S1  40.62 
 
 		 562 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3035  30S ribosomal protein S1  38.36 
 
 		 567 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00687642  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2066  30S ribosomal protein S1  38.74 
 
 		 555 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000984925  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2569  30S ribosomal protein S1  40.7 
 
 		 564 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2220  30S ribosomal protein S1  40.81 
 
 		 557 aa  382  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000298041  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003020  SSU ribosomal protein S1p  37.71 
 
 		 556 aa  381  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000113511  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2070  30S ribosomal protein S1  38.74 
 
 		 555 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000132225  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0779  30S ribosomal protein S1  40.62 
 
 		 562 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2396  30S ribosomal protein S1  38.74 
 
 		 555 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000546021  unclonable  0.0000133254 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2163  30S ribosomal protein S1  38.78 
 
 		 559 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0054934  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0722  30S ribosomal protein S1  40.7 
 
 		 564 aa  379  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2042  30S ribosomal protein S1  38.74 
 
 		 555 aa  382  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000389287  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2123  30S ribosomal protein S1  38.74 
 
 		 555 aa  380  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000359988  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0172  SSU ribosomal protein S1P  43.11 
 
 		 570 aa  382  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0487527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2279  30S ribosomal protein S1  38.74 
 
 		 555 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000133831  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1954  30S ribosomal protein S1  38.55 
 
 		 555 aa  382  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000214666  unclonable  0.00000523034 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  40.08 
 
 		 589 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1646  30S ribosomal protein S1  39.26 
 
 		 561 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.563909  normal  0.099465 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1505  30S ribosomal protein S1  37.33 
 
 		 556 aa  376  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000598437  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3001  30S ribosomal protein S1  42.12 
 
 		 577 aa  378  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213018  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0947  30S ribosomal protein S1  41.45 
 
 		 570 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579155  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  41.45 
 
 		 570 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1702  30S ribosomal protein S1  40.58 
 
 		 577 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0507  30S ribosomal protein S1  40.04 
 
 		 574 aa  376  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.762722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  39.88 
 
 		 576 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2882  30S ribosomal protein S1  41.45 
 
 		 570 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0077101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1638  30S ribosomal protein S1  41.45 
 
 		 570 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.82562  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0927  30S ribosomal protein S1  39.68 
 
 		 576 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0927  30S ribosomal protein S1  42.76 
 
 		 569 aa  379  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000030887  normal  0.340595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1071  30S ribosomal protein S1  42.76 
 
 		 569 aa  379  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000319804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2257  30S ribosomal protein S1  41.45 
 
 		 570 aa  375  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  42.12 
 
 		 571 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2298  30S ribosomal protein S1  38.74 
 
 		 555 aa  378  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000879863  unclonable  0.000000000196055 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  39.88 
 
 		 570 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0201  30S ribosomal protein S1  41.45 
 
 		 570 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0931  30S ribosomal protein S1  38.87 
 
 		 561 aa  378  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2572  30S ribosomal protein S1  41.45 
 
 		 570 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.196878  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1047  30S ribosomal protein S1  39.88 
 
 		 576 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1587  30S ribosomal protein S1  39.12 
 
 		 559 aa  376  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113977  hitchhiker  0.000457786 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0563  30S ribosomal protein S1  38.87 
 
 		 560 aa  375  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.647894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>