More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD1090 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD1090  30S ribosomal protein S1  100 
 
 		 550 aa  1093    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.365976  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0617  30S ribosomal protein S1  56.28 
 
 		 567 aa  595  1e-169  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0402  30S ribosomal protein S1  56.65 
 
 		 567 aa  598  1e-169  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2229  30S ribosomal protein S1  42.08 
 
 		 571 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.516713  normal  0.0580456 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0408  ribosomal protein S1  40.63 
 
 		 553 aa  408  1.0000000000000001e-112  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.460478  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0149  30S ribosomal protein S1  41.63 
 
 		 569 aa  407  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0640  30S ribosomal protein S1  41.94 
 
 		 565 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.079846 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0397  30S ribosomal protein S1  42.14 
 
 		 565 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0168105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0192  30S ribosomal protein S1  41.94 
 
 		 565 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0782699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2936  30S ribosomal protein S1  42.15 
 
 		 577 aa  403  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0754  30S ribosomal protein S1  42.12 
 
 		 575 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0103  30S ribosomal protein S1  41.75 
 
 		 569 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503388  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1025  30S ribosomal protein S1  40.45 
 
 		 558 aa  399  9.999999999999999e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0436614  normal  0.528214 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0067  30S ribosomal protein S1  41.75 
 
 		 565 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605902  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0182  30S ribosomal protein S1  42.33 
 
 		 570 aa  395  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.357984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0207  30S ribosomal protein S1  42.14 
 
 		 570 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.271501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0124  30S ribosomal protein S1  42.52 
 
 		 570 aa  397  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.463891 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0206  30S ribosomal protein S1  40.78 
 
 		 567 aa  392  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.49849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0293  30S ribosomal protein S1  40.98 
 
 		 573 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0163  30S ribosomal protein S1  40.58 
 
 		 566 aa  395  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97893  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0200  30S ribosomal protein S1  41.12 
 
 		 558 aa  393  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.977671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2446  30S ribosomal protein S1  41.25 
 
 		 570 aa  392  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.822205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3590  30S ribosomal protein S1  39.35 
 
 		 561 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.019363  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6076  30S ribosomal protein S1  41.44 
 
 		 569 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3882  30S ribosomal protein S1  39.16 
 
 		 561 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237416  normal  0.848573 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0675  30S ribosomal protein S1  41.98 
 
 		 582 aa  390  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.690527 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0098  30S ribosomal protein S1  40.45 
 
 		 566 aa  390  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6612  30S ribosomal protein S1  41.63 
 
 		 569 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.328912  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3275  30S ribosomal protein S1  39.35 
 
 		 561 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.62304 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3786  30S ribosomal protein S1  39.31 
 
 		 571 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  hitchhiker  0.000327486 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2917  30S ribosomal protein S1  39.24 
 
 		 571 aa  385  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.371234  normal  0.0728232 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1305  30S ribosomal protein S1  40.68 
 
 		 566 aa  382  1e-105  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000305659  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3606  30S ribosomal protein S1  40.42 
 
 		 569 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0721  30S ribosomal protein S1  39.81 
 
 		 558 aa  381  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0686992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0029  30S ribosomal protein S1  41.14 
 
 		 566 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0026  30S ribosomal protein S1  41.14 
 
 		 566 aa  378  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0027  30S ribosomal protein S1  41.14 
 
 		 566 aa  378  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.173864  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0103  30S ribosomal protein S1  43.17 
 
 		 569 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.924927 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3458  30S ribosomal protein S1  41.15 
 
 		 568 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0194  30S ribosomal protein S1  44.37 
 
 		 573 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.571877  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4030  30S ribosomal protein S1  44.54 
 
 		 567 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2456  30S ribosomal protein S1  43.88 
 
 		 569 aa  375  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1322  30S ribosomal protein S1  40.28 
 
 		 566 aa  370  1e-101  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.85252  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1495  30S ribosomal protein S1  41.18 
 
 		 570 aa  370  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.255625 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4360  30S ribosomal protein S1  44.54 
 
 		 567 aa  372  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294177  hitchhiker  0.00911055 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0172  SSU ribosomal protein S1P  39.37 
 
 		 570 aa  363  5.0000000000000005e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0487527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0507  30S ribosomal protein S1  39.46 
 
 		 574 aa  350  3e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.762722  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1702  30S ribosomal protein S1  39.26 
 
 		 577 aa  350  4e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1543  30S ribosomal protein S1  37.07 
 
 		 558 aa  347  4e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.49794  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0235  30S ribosomal protein S1  39.07 
 
 		 577 aa  343  5e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.00000120876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1025  ribosomal protein S1  37.09 
 
 		 568 aa  342  9e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.000000189842  unclonable  0.0000000000588279 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0903  ribosomal protein S1  37.09 
 
 		 568 aa  342  9e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.055479  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2466  30S ribosomal protein S1  37.71 
 
 		 557 aa  342  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000206931  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0746  30S ribosomal protein S1  38.91 
 
 		 589 aa  340  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.46132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1736  30S ribosomal protein S1  37.52 
 
 		 555 aa  340  5e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000968358  hitchhiker  0.000799802 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1198  30S ribosomal protein S1  35.31 
 
 		 557 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3035  30S ribosomal protein S1  40.29 
 
 		 567 aa  338  9.999999999999999e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00687642  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0642  30S ribosomal protein S1  39.33 
 
 		 551 aa  338  1.9999999999999998e-91  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000269635  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2402  30S ribosomal protein S1  37.43 
 
 		 555 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3001  30S ribosomal protein S1  38.71 
 
 		 577 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213018  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0982  30S ribosomal protein S1  38.71 
 
 		 571 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.144535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1924  30S ribosomal protein S1  37.43 
 
 		 555 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000191049  unclonable  0.0000000000752303 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2054  30S ribosomal protein S1  37.43 
 
 		 555 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000199699  unclonable  0.0000339472 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1977  30S ribosomal protein S1  37.43 
 
 		 555 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000796646  unclonable  0.000000000124259 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2257  30S ribosomal protein S1  39.54 
 
 		 570 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1535  30S ribosomal protein S1  39.33 
 
 		 555 aa  337  2.9999999999999997e-91  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00152799  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4160  30S ribosomal protein S1  39.75 
 
 		 570 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1330  ribosomal protein S1  36.86 
 
 		 560 aa  337  2.9999999999999997e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000364638  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2396  30S ribosomal protein S1  37.24 
 
 		 555 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000546021  unclonable  0.0000133254 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2572  30S ribosomal protein S1  39.75 
 
 		 570 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.196878  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2279  30S ribosomal protein S1  37.24 
 
 		 555 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000133831  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0428  30S ribosomal protein S1  39.75 
 
 		 570 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2070  30S ribosomal protein S1  37.24 
 
 		 555 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000132225  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2993  30S ribosomal protein S1  39.75 
 
 		 570 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1638  30S ribosomal protein S1  39.75 
 
 		 570 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.82562  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0927  30S ribosomal protein S1  38 
 
 		 569 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000030887  normal  0.340595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1071  30S ribosomal protein S1  38 
 
 		 569 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000319804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2945  30S ribosomal protein S1  39.75 
 
 		 570 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.855668  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0850  30S ribosomal protein S1  39.13 
 
 		 562 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.334273 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2882  30S ribosomal protein S1  39.75 
 
 		 570 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0077101  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0947  30S ribosomal protein S1  39.75 
 
 		 570 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.579155  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2066  30S ribosomal protein S1  37.24 
 
 		 555 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000984925  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0201  30S ribosomal protein S1  39.75 
 
 		 570 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2042  30S ribosomal protein S1  37.24 
 
 		 555 aa  336  5e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000389287  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2220  30S ribosomal protein S1  37.72 
 
 		 557 aa  337  5e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000298041  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1882  30S ribosomal protein S1  38.17 
 
 		 573 aa  336  5e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.48438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0568  30S ribosomal protein S1  39.75 
 
 		 570 aa  337  5e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0923  30S ribosomal protein S1  39.54 
 
 		 576 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.261659  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1047  30S ribosomal protein S1  39.75 
 
 		 576 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1006  30S ribosomal protein S1  39.75 
 
 		 576 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0779  30S ribosomal protein S1  39.34 
 
 		 562 aa  336  7e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1753  30S ribosomal protein S1  37.43 
 
 		 555 aa  336  7e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374073  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2123  30S ribosomal protein S1  37.43 
 
 		 555 aa  336  7e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000359988  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0927  30S ribosomal protein S1  39.54 
 
 		 576 aa  336  7e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.722612  normal  0.700665 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4724  30S ribosomal protein S1  40.94 
 
 		 561 aa  334  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271218  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0909  30S ribosomal protein S1  39.13 
 
 		 562 aa  334  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02120  30S ribosomal subunit protein S1  37.68 
 
 		 504 aa  334  2e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000618962  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1212  ribosomal protein S1  35.63 
 
 		 556 aa  335  2e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0374524  normal  0.207409 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3124  30S ribosomal protein S1  40.94 
 
 		 562 aa  334  2e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00164205  normal  0.0119703 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1391  30S ribosomal protein S1  41.36 
 
 		 561 aa  334  3e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00553115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>