More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2388 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2388  ferredoxin-dependent glutamate synthase  100 
 
 		 544 aa  1129    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2275  ferredoxin-dependent glutamate synthase  78.31 
 
 		 544 aa  880    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0384  ferredoxin-dependent glutamate synthase  75.09 
 
 		 548 aa  807    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1724  ferredoxin-dependent glutamate synthase  78.26 
 
 		 552 aa  904    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132222  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1376  ferredoxin-dependent glutamate synthase  81.8 
 
 		 544 aa  905    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.69748  normal  0.385645 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0103  ferredoxin-dependent glutamate synthase  86.4 
 
 		 544 aa  1001    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.841143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1371  ferredoxin-dependent glutamate synthase  78.86 
 
 		 544 aa  918    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2599  glutamate synthase, beta subunit-like  50 
 
 		 547 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2160  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.82 
 
 		 547 aa  510  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1156  ferredoxin-dependent glutamate synthase  49.36 
 
 		 541 aa  495  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00724144  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0212  glutamate synthase (NADPH)  32.23 
 
 		 497 aa  189  8e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1239  glutamate synthase-related protein  32.33 
 
 		 509 aa  189  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  30.23 
 
 		 503 aa  189  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  31.14 
 
 		 502 aa  188  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.46 
 
 		 503 aa  187  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  31.98 
 
 		 503 aa  184  3e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1301  glutamate synthase (NADPH)  30.56 
 
 		 510 aa  183  6e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2494  glutamate synthase (NADPH)  32.37 
 
 		 509 aa  182  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.12803  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2025  glutamate synthase (NADPH)  30.8 
 
 		 530 aa  180  7e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2137  glutamate synthase (NADPH)  31.07 
 
 		 502 aa  177  5e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1756  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  32.39 
 
 		 509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.314576  normal  0.0683666 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1292  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  29.46 
 
 		 502 aa  173  6.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00363747 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1079  glutamate synthase (NADPH)  29.7 
 
 		 510 aa  171  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.592845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0868  glutamate synthase (NADPH)  29.78 
 
 		 510 aa  168  2e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00172644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1597  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  29.59 
 
 		 510 aa  168  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.322339  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16300  Glutamate synthase (NADPH)  31.76 
 
 		 500 aa  167  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0221938  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  29.88 
 
 		 507 aa  166  8e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  29.62 
 
 		 505 aa  163  8.000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0523  glutamate synthase (NADPH)  28.4 
 
 		 507 aa  163  9e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.55997  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0537  glutamate synthase (NADPH)  28.4 
 
 		 507 aa  163  9e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.5 
 
 		 507 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2360  Glutamate synthase (NADPH)  27.88 
 
 		 502 aa  162  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.235602  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_946  glutamate synthase-like protein, gltB-like fragment  30.51 
 
 		 500 aa  160  7e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1128  glutamate synthase, alpha subunit, putative  30.29 
 
 		 500 aa  159  1e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147695  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0957  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.51 
 
 		 500 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.653223  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  29.36 
 
 		 507 aa  157  6e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0559  glutamate synthase (NADPH)  28.68 
 
 		 501 aa  156  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0198  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  28.86 
 
 		 501 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1093  glutamate synthase (NADPH)  30.11 
 
 		 510 aa  145  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3590  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.61 
 
 		 1572 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.610776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3462  Glutamate synthase (ferredoxin)  32.59 
 
 		 1577 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3266  glutamate synthase (ferredoxin)  32.61 
 
 		 1572 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819491  normal  0.0774951 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0029  glutamate synthase (NADPH)  34.99 
 
 		 741 aa  134  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0036  glutamate synthase (ferredoxin)  31.87 
 
 		 1571 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.790561 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1640  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.41 
 
 		 1519 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0608399  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1741  Glutamate synthase (NADPH)  34.08 
 
 		 747 aa  128  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.831135  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0529  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.46 
 
 		 1474 aa  127  6e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.41827  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  30.58 
 
 		 529 aa  127  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1056  glutamate synthase subunit alpha  32.55 
 
 		 1486 aa  126  8.000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1884  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  33.61 
 
 		 712 aa  126  9e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.95621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2984  ferredoxin-dependent glutamate synthase  31.87 
 
 		 516 aa  126  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1811  glutamate synthase (NADPH)  32.4 
 
 		 685 aa  126  1e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.172314  hitchhiker  0.0000101045 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4277  glutamate synthase (ferredoxin)  29.19 
 
 		 1583 aa  125  2e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1013  glutamate synthase subunit alpha  32.42 
 
 		 1482 aa  125  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.471869  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1126  glutamate synthase subunit alpha  32.15 
 
 		 1482 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.052618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3007  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30 
 
 		 516 aa  125  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0049  glutamate synthase, large subunit  29.19 
 
 		 1583 aa  125  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0054  glutamate synthase, large subunit  29.19 
 
 		 1583 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.673781  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1458  glutamate synthase  32.35 
 
 		 1508 aa  124  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2039  glutamate synthase, large subunit  31.64 
 
 		 1542 aa  124  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.545584  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  31.28 
 
 		 529 aa  124  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1802  glutamate synthase (ferredoxin)  31.55 
 
 		 1498 aa  124  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0512049  normal  0.419037 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0959  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.79 
 
 		 1575 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434425  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2744  glutamate synthase (NADH) large subunit  29.79 
 
 		 1574 aa  124  4e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1260  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.11 
 
 		 1511 aa  124  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.179185  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28040  glutamate synthase (NADH) large subunit  31.95 
 
 		 1527 aa  123  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.723113  normal  0.697076 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2951  glutamate synthase subunit alpha  33.05 
 
 		 1482 aa  123  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1325  glutamate synthase subunit alpha  32.86 
 
 		 1482 aa  123  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1608  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  31.75 
 
 		 693 aa  123  8e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3050  glutamate synthase subunit alpha  32.58 
 
 		 1482 aa  123  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.156524 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6714  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.41 
 
 		 1526 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3060  glutamate synthase (NADH) large subunit  31.29 
 
 		 1518 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5693  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.97 
 
 		 1512 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1207  Glutamate synthase (ferredoxin)  31.78 
 
 		 1469 aa  122  9.999999999999999e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0477  glutamate synthase (ferredoxin)  30.23 
 
 		 1567 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0794035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0118  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.23 
 
 		 1537 aa  122  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.750611  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3044  glutamate synthase (NADH) large subunit  31.29 
 
 		 1518 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3103  glutamate synthase (NADH) large subunit  31.29 
 
 		 1518 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.238876  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1703  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.46 
 
 		 1518 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.625118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1170  glutamine amidotransferase class-II  32.11 
 
 		 1563 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2872  glutamate synthase subunit alpha  32.58 
 
 		 1482 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0333567 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2954  glutamate synthase subunit alpha  32.58 
 
 		 1482 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.791133  normal  0.168031 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0279  glutamate synthase (ferredoxin)  29.25 
 
 		 539 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0857  glutamate synthase subunit alpha  33.33 
 
 		 1483 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.245541 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  32.31 
 
 		 529 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1503  ferredoxin-dependent glutamate synthase  30.6 
 
 		 1530 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0232  Glutamate synthase (ferredoxin)  29.38 
 
 		 1510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.261044 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1032  glutamate synthase subunit alpha  32.88 
 
 		 1482 aa  121  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.843249 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1221  glutamate synthase subunit alpha  32.35 
 
 		 1482 aa  121  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.120556 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0403  glutamate synthase subunit alpha  29.91 
 
 		 1507 aa  121  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405842 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5333  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.93 
 
 		 534 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.87247  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5712  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.93 
 
 		 534 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5422  ferredoxin-dependent glutamate synthase  28.93 
 
 		 534 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02050  glutamate synthase  32.75 
 
 		 543 aa  121  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00531954  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1812  glutamate synthase (ferredoxin)  32.11 
 
 		 1564 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0773594 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0730  Glutamate synthase (ferredoxin)  30.68 
 
 		 1509 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000317884 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0265  glutamate synthase (NADH) large subunit  30.4 
 
 		 1584 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568336  normal  0.146722 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1222  glutamate synthase subunit alpha  32.82 
 
 		 1462 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12620  glutamate synthase family protein  29.31 
 
 		 522 aa  120  6e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0829  glutamate synthase (NADPH)  31.74 
 
 		 681 aa  120  6e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.37412  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>